Identificação e dosagem alélica de marcadores moleculares associados a resistência ao vírus PVY em batata
| Ano de defesa: | 2014 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de Pelotas
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Programa de Pós-Graduação em Agronomia
|
| Departamento: |
Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel
|
| País: |
Brasil
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Área do conhecimento CNPq: | |
| Link de acesso: | http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/3061 |
Resumo: | A batata é o terceiro principal alimento produzido no mundo, e é um dos cultivos mais promissores para suprimir a fome em países em desenvolvimento. Cerca de 40 viroses infectam a cultura da batata, entre estas, o Potato virus Y (PVY) é, atualmente, o que causa maior impacto negativo na cultura. O PVY é transmitido de diversas formas, todas com controle e manejo deficitários, tornando a resistência genética a medida de controle mais eficaz. Esta resistência é controlada pelos genes Ry encontrados em espécies silvestres de batata. Marcadores do tipo SCAR (Sequence Characterized Amplified Region), os quais amplificam a região que contém o gene Ry, foram desenvolvidos e estão disponíveis para uso pelos programas de melhoramento de batata. Este trabalho foi realizado com o objetivo de aumentar a eficiência dos programas de melhoramento de batata em relação à resistência ao PVY fazendo uso da seleção assistida por marcadores moleculares. A dissertação foi dividida em dois capítulos. No primeiro, visando estimar a dosagem alélica do gene Ry e selecionar clones com múltiplas cópias do gene Ry para serem usados como genitores no programa de melhoramento de batata, foram genotipadas sete famílias clonais, envolvendo cinco genitores com resistência ao PVY, utilizando os marcadores SCAR RYSC3 e M45. Para o gene Ryadg, com base no marcador RYSC 3, dos cinco genitores resistentes ao PVY avaliados, quatro, C1883-22-97, C2372-02-02, C2388-01-02, e MB9846-1, são simplex, e o genitor C2389-01-02 é duplex. Para o gene Rysto, com base no marcador M45, dois genitores, C2388-01-02 e MB9846-1, são simplex, e o genitor C2389-01-02 é duplex. Para os genitores C1883-22-97 e C2372-02-02, as frequências observadas de presença do gene Rysto, nas progênies avaliadas, não se adequaram estatisticamente a nenhuma das constituições genotípicas propostas. No segundo capítulo, com objetivo de identificar germoplasma de batata com resistência extrema ao vírus Y associada aos componentes da aparência e do rendimento de tubérculos, além verificar as associações entre esses caracteres, foram avaliados clones portadores do gene Ry, oriundos de oito combinações genéticas distintas. As combinações genéticas C2389-01-02 x Asterix, e, BRS Ana x C1883-22-97, mostraram maior potencial para serem exploradas visando agregar a resistência ao vírus Y aos caracteres desejáveis de rendimento e de aparência de tubérculo. O grau de correlação entre caracteres indica fortíssima e direta associação entre aparência geral e aspereza de tubérculo; forte e direta associação da intensidade da cor de película com aspereza e aparência geral de tubérculo, entre número e massa média de tubérculo, entre massa média e cor da película, e entre massa total e número total de tubérculos; e forte e inversa associação de formato com cor da polpa, cor da película e massa média de tubérculos. Os resultados encontrados no nosso estudo mostraram que os marcadores moleculares RYSC3 e M45 são uma importante ferramenta para ser usada pelos programas de melhoramento de batata visando acelerar o processo de desenvolvimento de cultivares com resistência ao PVY. |
| id |
UFPL_35d7355b1b8f1d312ae19a18d4cc3b43 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:guaiaca.ufpel.edu.br:prefix/3061 |
| network_acronym_str |
UFPL |
| network_name_str |
Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca |
| repository_id_str |
|
| spelling |
http://lattes.cnpq.br/3510424678815101http://lattes.cnpq.br/6461716944613921Castro, Caroline MarquesKneib, Raquel Bartz2016-09-28T17:06:46Z2016-09-272016-09-28T17:06:46Z2014-07-31KNEIB, Raquel Bartz. Identificação e dosagem alélica de marcadores moleculares associados a resistência ao vírus Y em batata. 2014. 45f. Dissertação (Mestrado) – Programa de Pós-Graduação em Agronomia. Universidade Federal de Pelotas, Pelotas.http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/3061A batata é o terceiro principal alimento produzido no mundo, e é um dos cultivos mais promissores para suprimir a fome em países em desenvolvimento. Cerca de 40 viroses infectam a cultura da batata, entre estas, o Potato virus Y (PVY) é, atualmente, o que causa maior impacto negativo na cultura. O PVY é transmitido de diversas formas, todas com controle e manejo deficitários, tornando a resistência genética a medida de controle mais eficaz. Esta resistência é controlada pelos genes Ry encontrados em espécies silvestres de batata. Marcadores do tipo SCAR (Sequence Characterized Amplified Region), os quais amplificam a região que contém o gene Ry, foram desenvolvidos e estão disponíveis para uso pelos programas de melhoramento de batata. Este trabalho foi realizado com o objetivo de aumentar a eficiência dos programas de melhoramento de batata em relação à resistência ao PVY fazendo uso da seleção assistida por marcadores moleculares. A dissertação foi dividida em dois capítulos. No primeiro, visando estimar a dosagem alélica do gene Ry e selecionar clones com múltiplas cópias do gene Ry para serem usados como genitores no programa de melhoramento de batata, foram genotipadas sete famílias clonais, envolvendo cinco genitores com resistência ao PVY, utilizando os marcadores SCAR RYSC3 e M45. Para o gene Ryadg, com base no marcador RYSC 3, dos cinco genitores resistentes ao PVY avaliados, quatro, C1883-22-97, C2372-02-02, C2388-01-02, e MB9846-1, são simplex, e o genitor C2389-01-02 é duplex. Para o gene Rysto, com base no marcador M45, dois genitores, C2388-01-02 e MB9846-1, são simplex, e o genitor C2389-01-02 é duplex. Para os genitores C1883-22-97 e C2372-02-02, as frequências observadas de presença do gene Rysto, nas progênies avaliadas, não se adequaram estatisticamente a nenhuma das constituições genotípicas propostas. No segundo capítulo, com objetivo de identificar germoplasma de batata com resistência extrema ao vírus Y associada aos componentes da aparência e do rendimento de tubérculos, além verificar as associações entre esses caracteres, foram avaliados clones portadores do gene Ry, oriundos de oito combinações genéticas distintas. As combinações genéticas C2389-01-02 x Asterix, e, BRS Ana x C1883-22-97, mostraram maior potencial para serem exploradas visando agregar a resistência ao vírus Y aos caracteres desejáveis de rendimento e de aparência de tubérculo. O grau de correlação entre caracteres indica fortíssima e direta associação entre aparência geral e aspereza de tubérculo; forte e direta associação da intensidade da cor de película com aspereza e aparência geral de tubérculo, entre número e massa média de tubérculo, entre massa média e cor da película, e entre massa total e número total de tubérculos; e forte e inversa associação de formato com cor da polpa, cor da película e massa média de tubérculos. Os resultados encontrados no nosso estudo mostraram que os marcadores moleculares RYSC3 e M45 são uma importante ferramenta para ser usada pelos programas de melhoramento de batata visando acelerar o processo de desenvolvimento de cultivares com resistência ao PVY.Potato is the third main food crop in the world, and is one of the most promising crop to suppress hunger in developing countries. From the 40 viruses which infect potato growing fields, Potato virus Y (PVY) is currently considered the most important one. PVY is transmitted by several ways, all of them with limited control, begin genetic resistance the main way to control this important disease controlled by Ry genes. Molecular markers, which amplify the region containing Ry gene have been developed and are available to be used by potato breeding. This work was developed with the aim of increasing the efficiency of potato breeding programs for resistance to PVY making use of molecular assisted selection. The dissertation is divided into two chapters. In the first chapter, in order to estimate allelic dosage of Ry genes in clones used as genitors in the breeding program, progenies from seven families were genotyped with the markers RYSC3 and M45. For Ryadg gene, based on the marker RYSC, from the five PVY resistant parents analysed, four are simplex, C1883-22-97, C2372-02-02, C2388-01-02 and MB9846-1, and one is duplex, C2389- 01-02. For Rysto gene, based on the marker M45, both parents, C2388-01-02 and MB9846-1, are simplex, and the parent C2389-01-02 is duplex. For the C1883-22-97 and C2372-02-02, it was not possible to estimate the allelic dosage of the Rysto gene. In the second chapter, in order to identify germplasm with extreme resistance to PVY associated to desirable agronomic traits, clones carrying the Ry gene, belonging from eight different genetic combinations, were evaluated for characteres related to tuber appearance and yield. The genetic combinations C2389-01-02 x Asterix and BRS Ana x C1883-22-97 showed good potential to be exploited in order to add resistance to virus Y to traits related to yield and tuber appearance. The correlation between traits indicates very strong and direct association between tuber general appearance and roughness of tuber; strong and direct association of the intensity of the periderm color and tuber general appearance; between number of tubers per plant and average tuber weight; between average tuber weight and intensity of the periderm color and between the total mass of tubers per plant and total number of tubers per plant. Also, strong and inverse associations between tuber shape and flesh color and between periderm color and average tuber weight were detected. The results of our study showed that the molecular markers RYSC3 and M45 are important tools to be used by potato breeding programs to accelerate the development of cultivars with resistance to PVY.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESporUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em AgronomiaUFPelBrasilFaculdade de Agronomia Eliseu MacielCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIADosagem alélicaSolanum tuberosumSCARVírus YAllelic dosagePVYIdentificação e dosagem alélica de marcadores moleculares associados a resistência ao vírus PVY em batataIdentification and allelic dosage of molecular markers linked to resistance to potato virus PVYinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELTEXTDissertação Raque Bartz Kneib.pdf.txtDissertação Raque Bartz Kneib.pdf.txtExtracted texttext/plain80278http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/3061/6/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Raque%20Bartz%20Kneib.pdf.txte0ed26cd2455b9abe356d3087d429a71MD56open accessTHUMBNAILDissertação Raque Bartz Kneib.pdf.jpgDissertação Raque Bartz Kneib.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1335http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/3061/7/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Raque%20Bartz%20Kneib.pdf.jpgc4311fd56bdb02e7bc094c3cdeab293cMD57open accessORIGINALDissertação Raque Bartz Kneib.pdfDissertação Raque Bartz Kneib.pdfapplication/pdf709774http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/3061/1/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Raque%20Bartz%20Kneib.pdfed9b7474064e09348586e51c9221a9faMD51open accessCC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-849http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/3061/2/license_url4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2fMD52open accesslicense_textlicense_texttext/html; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/3061/3/license_textd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD53open accesslicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/3061/4/license_rdfd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD54open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-867http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/3061/5/license.txtfbd6c74465857056e3ca572d7586661bMD55open accessprefix/30612023-07-13 05:12:16.347open accessoai:guaiaca.ufpel.edu.br:prefix/3061VG9kb3Mgb3MgaXRlbnMgZGVzc2EgY29tdW5pZGFkZSBzZWd1ZW0gYSBsaWNlbsOnYSBDcmVhdGl2ZSBDb21tb25zLg==Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2023-07-13T08:12:16Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false |
| dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Identificação e dosagem alélica de marcadores moleculares associados a resistência ao vírus PVY em batata |
| dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv |
Identification and allelic dosage of molecular markers linked to resistance to potato virus PVY |
| title |
Identificação e dosagem alélica de marcadores moleculares associados a resistência ao vírus PVY em batata |
| spellingShingle |
Identificação e dosagem alélica de marcadores moleculares associados a resistência ao vírus PVY em batata Kneib, Raquel Bartz CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA Dosagem alélica Solanum tuberosum SCAR Vírus Y Allelic dosage PVY |
| title_short |
Identificação e dosagem alélica de marcadores moleculares associados a resistência ao vírus PVY em batata |
| title_full |
Identificação e dosagem alélica de marcadores moleculares associados a resistência ao vírus PVY em batata |
| title_fullStr |
Identificação e dosagem alélica de marcadores moleculares associados a resistência ao vírus PVY em batata |
| title_full_unstemmed |
Identificação e dosagem alélica de marcadores moleculares associados a resistência ao vírus PVY em batata |
| title_sort |
Identificação e dosagem alélica de marcadores moleculares associados a resistência ao vírus PVY em batata |
| author |
Kneib, Raquel Bartz |
| author_facet |
Kneib, Raquel Bartz |
| author_role |
author |
| dc.contributor.authorLattes.pt_BR.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/3510424678815101 |
| dc.contributor.advisorLattes.pt_BR.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/6461716944613921 |
| dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Castro, Caroline Marques |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Kneib, Raquel Bartz |
| contributor_str_mv |
Castro, Caroline Marques |
| dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA |
| topic |
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA Dosagem alélica Solanum tuberosum SCAR Vírus Y Allelic dosage PVY |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Dosagem alélica Solanum tuberosum SCAR Vírus Y Allelic dosage PVY |
| description |
A batata é o terceiro principal alimento produzido no mundo, e é um dos cultivos mais promissores para suprimir a fome em países em desenvolvimento. Cerca de 40 viroses infectam a cultura da batata, entre estas, o Potato virus Y (PVY) é, atualmente, o que causa maior impacto negativo na cultura. O PVY é transmitido de diversas formas, todas com controle e manejo deficitários, tornando a resistência genética a medida de controle mais eficaz. Esta resistência é controlada pelos genes Ry encontrados em espécies silvestres de batata. Marcadores do tipo SCAR (Sequence Characterized Amplified Region), os quais amplificam a região que contém o gene Ry, foram desenvolvidos e estão disponíveis para uso pelos programas de melhoramento de batata. Este trabalho foi realizado com o objetivo de aumentar a eficiência dos programas de melhoramento de batata em relação à resistência ao PVY fazendo uso da seleção assistida por marcadores moleculares. A dissertação foi dividida em dois capítulos. No primeiro, visando estimar a dosagem alélica do gene Ry e selecionar clones com múltiplas cópias do gene Ry para serem usados como genitores no programa de melhoramento de batata, foram genotipadas sete famílias clonais, envolvendo cinco genitores com resistência ao PVY, utilizando os marcadores SCAR RYSC3 e M45. Para o gene Ryadg, com base no marcador RYSC 3, dos cinco genitores resistentes ao PVY avaliados, quatro, C1883-22-97, C2372-02-02, C2388-01-02, e MB9846-1, são simplex, e o genitor C2389-01-02 é duplex. Para o gene Rysto, com base no marcador M45, dois genitores, C2388-01-02 e MB9846-1, são simplex, e o genitor C2389-01-02 é duplex. Para os genitores C1883-22-97 e C2372-02-02, as frequências observadas de presença do gene Rysto, nas progênies avaliadas, não se adequaram estatisticamente a nenhuma das constituições genotípicas propostas. No segundo capítulo, com objetivo de identificar germoplasma de batata com resistência extrema ao vírus Y associada aos componentes da aparência e do rendimento de tubérculos, além verificar as associações entre esses caracteres, foram avaliados clones portadores do gene Ry, oriundos de oito combinações genéticas distintas. As combinações genéticas C2389-01-02 x Asterix, e, BRS Ana x C1883-22-97, mostraram maior potencial para serem exploradas visando agregar a resistência ao vírus Y aos caracteres desejáveis de rendimento e de aparência de tubérculo. O grau de correlação entre caracteres indica fortíssima e direta associação entre aparência geral e aspereza de tubérculo; forte e direta associação da intensidade da cor de película com aspereza e aparência geral de tubérculo, entre número e massa média de tubérculo, entre massa média e cor da película, e entre massa total e número total de tubérculos; e forte e inversa associação de formato com cor da polpa, cor da película e massa média de tubérculos. Os resultados encontrados no nosso estudo mostraram que os marcadores moleculares RYSC3 e M45 são uma importante ferramenta para ser usada pelos programas de melhoramento de batata visando acelerar o processo de desenvolvimento de cultivares com resistência ao PVY. |
| publishDate |
2014 |
| dc.date.issued.fl_str_mv |
2014-07-31 |
| dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2016-09-28T17:06:46Z |
| dc.date.available.fl_str_mv |
2016-09-27 2016-09-28T17:06:46Z |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.citation.fl_str_mv |
KNEIB, Raquel Bartz. Identificação e dosagem alélica de marcadores moleculares associados a resistência ao vírus Y em batata. 2014. 45f. Dissertação (Mestrado) – Programa de Pós-Graduação em Agronomia. Universidade Federal de Pelotas, Pelotas. |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/3061 |
| identifier_str_mv |
KNEIB, Raquel Bartz. Identificação e dosagem alélica de marcadores moleculares associados a resistência ao vírus Y em batata. 2014. 45f. Dissertação (Mestrado) – Programa de Pós-Graduação em Agronomia. Universidade Federal de Pelotas, Pelotas. |
| url |
http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/3061 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Pelotas |
| dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Agronomia |
| dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFPel |
| dc.publisher.country.fl_str_mv |
Brasil |
| dc.publisher.department.fl_str_mv |
Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Pelotas |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca instname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL) instacron:UFPEL |
| instname_str |
Universidade Federal de Pelotas (UFPEL) |
| instacron_str |
UFPEL |
| institution |
UFPEL |
| reponame_str |
Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca |
| collection |
Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca |
| bitstream.url.fl_str_mv |
http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/3061/6/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Raque%20Bartz%20Kneib.pdf.txt http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/3061/7/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Raque%20Bartz%20Kneib.pdf.jpg http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/3061/1/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Raque%20Bartz%20Kneib.pdf http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/3061/2/license_url http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/3061/3/license_text http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/3061/4/license_rdf http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/3061/5/license.txt |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
e0ed26cd2455b9abe356d3087d429a71 c4311fd56bdb02e7bc094c3cdeab293c ed9b7474064e09348586e51c9221a9fa 4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2f d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e fbd6c74465857056e3ca572d7586661b |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL) |
| repository.mail.fl_str_mv |
rippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.br |
| _version_ |
1862741494935322624 |