Caracterização de genes Whirly em acessos selvagens do gênero Oryza e resposta a salinidade e baixas temperaturas em arroz cultivado

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2021
Autor(a) principal: Zenker, Stefânia Garcia
Orientador(a): Pegoraro, Camila
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Pelotas
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Agronomia
Departamento: Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/8129
Resumo: Condições ambientais desfavoráveis, como salinidade e baixas temperaturas fazem com que a produtividade do arroz (Oryza sativa L.) seja afetada. Na principal região produtora de arroz do Brasil, o estado do Rio Grande do Sul, a incidência de baixas temperaturas acarreta em perdas significativas na produtividade. Além disso, problemas com salinidade são comuns, pois a fonte de água para irrigação das lavouras, em destaque a Planície Costeira, é advinda da Laguna dos Patos, que dependendo da precipitação mensal acaba recebendo água do Oceano Atlântico, o que faz aumentar o teor de sal na água. A utilização de genótipos tolerantes é uma das estratégias para minimizar as perdas ocasionadas por estresses abióticos. A identificação de genes envolvidos com a resposta de tolerância a estresses abióticos pode auxiliar no desenvolvimento de novos genótipos. A expressão gênica é fundamental para a sinalização frente a estresses abióticos, iniciando com a ativação de fatores de transcrição (FTs), que se ligam a elementos regulatórios de ação cis (ERACs), localizados na região promotora e outras regiões regulatórias dos genes envolvidos na resposta a estresse, formando uma cascata de sinalização. A busca por FTs que estejam envolvidos na resposta das plantas sob estresses é constante, e várias pesquisas têm sido conduzidas. No entanto, há poucos estudos relacionados com a família Whirly. Nesse contexto, este estudo buscou identificar e caracterizar genes Whirly em espécies do gênero Oryza e investigar a participação desses genes em plântulas de arroz submetidas a baixas temperaturas e salinidade. O primeiro estudo demonstrou que os genes Whirly são conservados quanto ao número e localização entre as espécies do gênero Oryza, no entanto possuem variações estruturais, o que pode ser utilizado como fonte de variabilidade genética para tolerância a estresses. Ainda, a região promotora dos genes Whirly é composta por ERACs alvos de FTs DREB/CBF, AREB/ABF, MYB, MYC, WRKYs, que possuem envolvimento na sinalização de estresses abióticos. Estes resultados sugerem que os genes Whirly podem estar envolvidos na resposta aos estresses por baixas temperaturas e salinidade em arroz. No segundo estudo, conduzido com plântulas das cultivares BRS Pampa (sensível) e BRS Bojuru (tolerante) submetidas a baixas temperaturas e salinidade, verificou-se que, de maneira geral, que a condição de estresse ocasionou a indução dos genes Whirly2 e Whirly6 no genótipo tolerante. Os promotores dos genes Whirly diferem quanto ao tipo e número de ocorrências de elementos de ação cis entre as cultivares sensível e tolerante, o que pode explicar a diferença no acúmulo de transcritos observado entre elas. Os resultados encontrados mostram os primeiros indícios do envolvimento dos genes Whirly na sinalização a resposta a estresse por salinidade e baixas temperaturas em plântulas de arroz
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spelling 2022-01-19T21:57:38Z2022-012022-01-19T21:57:38Z2021-02-25ZENKER, Stefânia G. Caracterização de genes Whirly em acessos selvagens do gênero Oryza e resposta a salinidade e baixas temperaturas em arroz cultivado. 2021. 120 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia) – Programa de Pós-Graduação em Agronomia, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2021http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/8129Condições ambientais desfavoráveis, como salinidade e baixas temperaturas fazem com que a produtividade do arroz (Oryza sativa L.) seja afetada. Na principal região produtora de arroz do Brasil, o estado do Rio Grande do Sul, a incidência de baixas temperaturas acarreta em perdas significativas na produtividade. Além disso, problemas com salinidade são comuns, pois a fonte de água para irrigação das lavouras, em destaque a Planície Costeira, é advinda da Laguna dos Patos, que dependendo da precipitação mensal acaba recebendo água do Oceano Atlântico, o que faz aumentar o teor de sal na água. A utilização de genótipos tolerantes é uma das estratégias para minimizar as perdas ocasionadas por estresses abióticos. A identificação de genes envolvidos com a resposta de tolerância a estresses abióticos pode auxiliar no desenvolvimento de novos genótipos. A expressão gênica é fundamental para a sinalização frente a estresses abióticos, iniciando com a ativação de fatores de transcrição (FTs), que se ligam a elementos regulatórios de ação cis (ERACs), localizados na região promotora e outras regiões regulatórias dos genes envolvidos na resposta a estresse, formando uma cascata de sinalização. A busca por FTs que estejam envolvidos na resposta das plantas sob estresses é constante, e várias pesquisas têm sido conduzidas. No entanto, há poucos estudos relacionados com a família Whirly. Nesse contexto, este estudo buscou identificar e caracterizar genes Whirly em espécies do gênero Oryza e investigar a participação desses genes em plântulas de arroz submetidas a baixas temperaturas e salinidade. O primeiro estudo demonstrou que os genes Whirly são conservados quanto ao número e localização entre as espécies do gênero Oryza, no entanto possuem variações estruturais, o que pode ser utilizado como fonte de variabilidade genética para tolerância a estresses. Ainda, a região promotora dos genes Whirly é composta por ERACs alvos de FTs DREB/CBF, AREB/ABF, MYB, MYC, WRKYs, que possuem envolvimento na sinalização de estresses abióticos. Estes resultados sugerem que os genes Whirly podem estar envolvidos na resposta aos estresses por baixas temperaturas e salinidade em arroz. No segundo estudo, conduzido com plântulas das cultivares BRS Pampa (sensível) e BRS Bojuru (tolerante) submetidas a baixas temperaturas e salinidade, verificou-se que, de maneira geral, que a condição de estresse ocasionou a indução dos genes Whirly2 e Whirly6 no genótipo tolerante. Os promotores dos genes Whirly diferem quanto ao tipo e número de ocorrências de elementos de ação cis entre as cultivares sensível e tolerante, o que pode explicar a diferença no acúmulo de transcritos observado entre elas. Os resultados encontrados mostram os primeiros indícios do envolvimento dos genes Whirly na sinalização a resposta a estresse por salinidade e baixas temperaturas em plântulas de arrozUnfavorable environmental conditions, such as salinity and low temperatures affect rice (Oryza sativa L.) produtivity. In Rio Grande do Sul state, the main rice growing region in Brazil, incidence of low temperatures results in significant yield losses. In addition, problems with salinity are common, as the source of the water for the irrigation in the field, especially in the Coastal Plain, comes from Laguna dos Patos, and depending on the monthly precipitation receives water from the Atlantic Ocean, which increases its salt content. The use of tolerant genotypes is one of the strategies to minimize the losses caused by abiotic stresses. The identification of genes involved in the tolerance response to abiotic stresses can help the development of new tolerant genotypes. The gene expression is essential in abiotic stress signaling, starting with the activation of transcription factors (TFs), which are linked to cis-acting regulatory elements (CREs), located in the promoter and other regulatory regions in genes involved in stress responses, activating a signaling cascate. The search for TFs involved in plant response to stresses is constant, and several researches have been conducted. However, there are few studies related to Whirly family. In this context, this study aimed at identify and characterize Whirly genes in species of Oryza genus and to investigate the role of these genes in rice seedlings submitted to low temperatures and salinity. The first study demonstrated that the Whirly genes are conserved in terms of number of copies and location in chromossomes among the species of Oryza genus. However, they have structural variations, that can be used as a source of genetic variability for stress tolerance. In addition, the promoter region of Whirly genes has CREs targeted by TFs DREB/CBF, AREB/ABF, MYB, MYC, WRKYs, which are involved in abiotic stress signaling. These results suggest that Whirly genes can be involved in low temperatures and salinity stress response in rice. The second study was performed using seedlings of BRS Pampa (sensitive) and BRS Bojuru (tolerant) cultivars submitted to low temperatures and salinity. In general, the studied stress condition leads to a transcriptional activation of Whirly2 and Whirly6 genes in the tolerant genotype. Whirly gene promotores differ in type and occurrences of CREs between the sensitive and tolerant cultivars. This finding may explain the difference in the transcript accumulation observed between them. The results found show the first insights in the involvement of Whirly genes in stress response signaling to salinity and low temperatures in rice seedlings.porUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em AgronomiaUFPelBrasilFaculdade de Agronomia Eliseu MacielCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIAOryza sativa L.CREsAbiotic stressGene expressionEstresse abióticoExpressão gênicaCaracterização de genes Whirly em acessos selvagens do gênero Oryza e resposta a salinidade e baixas temperaturas em arroz cultivadoCharacterization of Whirly genes in wild accessions of the Oryza genus and response to salinity and low preparations im cultivated riceinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesishttp://lattes.cnpq.br/8595408834809582http://lattes.cnpq.br/5859282913464169Viana, Vívian Ebelinghttp://lattes.cnpq.br/9091770603971407Luz, Viviane Kopp dahttp://lattes.cnpq.br/2992895464516060Pegoraro, CamilaZenker, Stefânia Garciainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELTEXTDissertacao_Stefania_Garcia_Zenker.pdf.txtDissertacao_Stefania_Garcia_Zenker.pdf.txtExtracted texttext/plain246717http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8129/6/Dissertacao_Stefania_Garcia_Zenker.pdf.txtd931e6ff9f5c6573800a2a485959a0ccMD56open accessTHUMBNAILDissertacao_Stefania_Garcia_Zenker.pdf.jpgDissertacao_Stefania_Garcia_Zenker.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1224http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8129/7/Dissertacao_Stefania_Garcia_Zenker.pdf.jpg99881d9565b27b1733dca3a619efb66eMD57open accessORIGINALDissertacao_Stefania_Garcia_Zenker.pdfDissertacao_Stefania_Garcia_Zenker.pdfapplication/pdf2892162http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8129/1/Dissertacao_Stefania_Garcia_Zenker.pdf38c155a9cd003fdc588e9534ae09928aMD51open accessCC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-849http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8129/2/license_url4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2fMD52open accesslicense_textlicense_texttext/html; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8129/3/license_textd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD53open accesslicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8129/4/license_rdfd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD54open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-867http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8129/5/license.txtfbd6c74465857056e3ca572d7586661bMD55open accessprefix/81292023-07-13 03:56:28.192open accessoai:guaiaca.ufpel.edu.br:prefix/8129VG9kb3Mgb3MgaXRlbnMgZGVzc2EgY29tdW5pZGFkZSBzZWd1ZW0gYSBsaWNlbsOnYSBDcmVhdGl2ZSBDb21tb25zLg==Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2023-07-13T06:56:28Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false
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