Aspectos químicos e moleculares do acúmulo de minerais em grãos de arroz

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2023
Autor(a) principal: Oliveira, Victoria Freitas de
Orientador(a): Pegoraro, Camila
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Pelotas
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Agronomia
Departamento: Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/9507
Resumo: O arroz é amplamente cultivado e é considerado um dos cereais mais importantes economicamente. Apesar de ser alimento básico para mais da metade da população mundial, o arroz é carente em elementos essenciais, e por outro lado, pode acumular elementos tóxicos quando cultivado em áreas contaminadas. A deficiência nutricional pode ocorrer por diferentes minerais, dentre eles o ferro (Fe), que causa sérias pertubações como anemia e doenças degenerativas. Uma das estratégias mais viáveis e econômicas para superar a deficiência por Fe é biofortificação genética, que também pode ser utilizada para reduzir o acúmulo elementos tóxicos nos grãos de arroz. A caracterização da variabilidade genética permite identificar os genótipos que apresentam maior teor de elementos essenciais e com menor concentração de metais pesados, os quais podem ser inseridos em blocos de cruzamento visando o desenvolvimento de cultivares biofortificadas. O mapeamento associativo é uma ferramenta para identificar sequencias que controlam características de interesse, contribuindo para superar obstáculos do melhoramento convencional, e evidenciando genes que poderão ser manipulados via transgenia e edição gênica. Essas ferramentas podem ser empregadas no desenvolvimento de cultivares biofortificadas. Desta forma, o objetivo do estudo foi a caracterização de genótipos de arroz quanto ao acúmulo de minerais e elementos tóxicos no grão de arroz; mapeamento associativo para acúmulo de Fe em grãos de arroz; e a construção de um plasmídeo de edição de um gene que participa no metabolismo do Fe. Para o primeiro e segundo estudos um total de 88 acessos de arroz foram genotipados com 7098 marcadores SNPs e fenotipados quanto a concentração de elementos essenciais cobre(Cu), ferro, manganês (Mn), selênio (Se) e zinco (Zn) e elementos tóxicos arsênio (As), cadmio (Cd) e chumbo (Pb), em duas safras. Foi possível observar que os genótipos BRS Fronteira, Epagri 108, IRGA 424 CL e Selênio se caracterizam por apresentar menor acúmulo de As nos grãos. Os genótipos Epagri 107, Epagri 109 e Irat 162 mostraram maior acúmulo de Zn nos grãos. Os maiores teores de Fe foram encontrados nos genótipos BRS A701 CL, Carnaroli, Puitá Inta CL e SCS 112. Esses genótipos podem ser utilizados em blocos de cruzamento visando o desenvolvimento de cultivares biofortificadas. Foram mapeados 13 genes candidatos associados ao acúmulo de Fe em grãos de arroz integral, os quais estão localizados nos cromossomos 1, 5, 6 e 10. No terceiro estudo foi possível construir um plasmídeo para edição de gene envolvido no metabolismo do Fe. A continuidade dessa pesquisa em longo prazo poderá trazer resultados mais concretos para biofortificação de Fe arroz.
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spelling 2023-05-26T16:07:17Z2023-052023-05-26T16:07:17Z2023-03-10OLIVEIRA, Victoria Freitas de. Aspectos químicos e moleculares do acúmulo de minerais em grãos de arroz. 2023. 188f. (Doutorado em Agronomia ) - Programa de Pós-Graduação em Agronomia, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, RS, 2023.http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/9507O arroz é amplamente cultivado e é considerado um dos cereais mais importantes economicamente. Apesar de ser alimento básico para mais da metade da população mundial, o arroz é carente em elementos essenciais, e por outro lado, pode acumular elementos tóxicos quando cultivado em áreas contaminadas. A deficiência nutricional pode ocorrer por diferentes minerais, dentre eles o ferro (Fe), que causa sérias pertubações como anemia e doenças degenerativas. Uma das estratégias mais viáveis e econômicas para superar a deficiência por Fe é biofortificação genética, que também pode ser utilizada para reduzir o acúmulo elementos tóxicos nos grãos de arroz. A caracterização da variabilidade genética permite identificar os genótipos que apresentam maior teor de elementos essenciais e com menor concentração de metais pesados, os quais podem ser inseridos em blocos de cruzamento visando o desenvolvimento de cultivares biofortificadas. O mapeamento associativo é uma ferramenta para identificar sequencias que controlam características de interesse, contribuindo para superar obstáculos do melhoramento convencional, e evidenciando genes que poderão ser manipulados via transgenia e edição gênica. Essas ferramentas podem ser empregadas no desenvolvimento de cultivares biofortificadas. Desta forma, o objetivo do estudo foi a caracterização de genótipos de arroz quanto ao acúmulo de minerais e elementos tóxicos no grão de arroz; mapeamento associativo para acúmulo de Fe em grãos de arroz; e a construção de um plasmídeo de edição de um gene que participa no metabolismo do Fe. Para o primeiro e segundo estudos um total de 88 acessos de arroz foram genotipados com 7098 marcadores SNPs e fenotipados quanto a concentração de elementos essenciais cobre(Cu), ferro, manganês (Mn), selênio (Se) e zinco (Zn) e elementos tóxicos arsênio (As), cadmio (Cd) e chumbo (Pb), em duas safras. Foi possível observar que os genótipos BRS Fronteira, Epagri 108, IRGA 424 CL e Selênio se caracterizam por apresentar menor acúmulo de As nos grãos. Os genótipos Epagri 107, Epagri 109 e Irat 162 mostraram maior acúmulo de Zn nos grãos. Os maiores teores de Fe foram encontrados nos genótipos BRS A701 CL, Carnaroli, Puitá Inta CL e SCS 112. Esses genótipos podem ser utilizados em blocos de cruzamento visando o desenvolvimento de cultivares biofortificadas. Foram mapeados 13 genes candidatos associados ao acúmulo de Fe em grãos de arroz integral, os quais estão localizados nos cromossomos 1, 5, 6 e 10. No terceiro estudo foi possível construir um plasmídeo para edição de gene envolvido no metabolismo do Fe. A continuidade dessa pesquisa em longo prazo poderá trazer resultados mais concretos para biofortificação de Fe arroz.The rice crop, considered one of the most economically important cereals, widely cultivated. Despite being a staple food for more than half of the world's population, rice is lacking in essential elements and, on the other hand, can accumulate toxic elements when grown in contaminated areas. Nutritional deficiency may occur due to different minerals, including iron (Fe), which causes serious disorders such as anemia and degenerative diseases. One of the most viable and economical strategies to overcome Fe deficiency is genetic biofortification, which can also be used to reduce the accumulation of toxic elements in rice grains. The characterization of genetic variability makes it possible to identify genotypes that have a higher content of essential elements and a lower concentration of heavy metals, which can be inserted in crossing blocks aiming at the development of biofortified cultivars. Associative mapping is a tool to identify sequences that control traits of interest, helping to overcome obstacles in conventional breeding, and highlighting genes that can be manipulated via transgenics and gene editing. These tools can be used in the development of biofortified cultivars. Thus, the objective of the study was the characterization of rice genotypes regarding the accumulation of minerals and toxic elements in the rice grain; associative mapping for Fe accumulation in rice grains; and the construction of a gene editing plasmid that participates in Fe metabolism. For the first and second studies, a total of 88 accessions of rice were genotyped with 7098 SNPs markers and phenotyped for the concentration of essential elements copper (Cu), iron, manganese (Mn), selenium (Se) and zinc (Zn) and toxic elements arsenic (As), cadmium (Cd) and lead (Pb), in two harvest seasons. It was possible to observe that the genotypes BRS Fronteira, Epagri 108, IRGA 424 CL and Selênio are characterized by presenting less accumulation of As in the grains. The genotypes Epagri 107, Epagri 109 and Irat 162 showed greater accumulation of Zn in the grains. The highest Fe contents were found in the genotypes BRS A701 CL, Carnaroli, Puitá Inta CL and SCS 112. These genotypes can be used in crossing blocks aiming at the development of biofortified cultivars. Thirteen candidate genes associated with Fe accumulation in brown rice grains, which are located on chromosomes 1, 5, 6 and 10, were mapped. In the third study, it was possible to construct a plasmid for editing a gene involved in Fe metabolism. The continuity of this research in the long term may bring more concrete results for the biofortification of Fe in rice.Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPqporUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em AgronomiaUFPelBrasilFaculdade de Agronomia Eliseu MacielOLIVEIRA, Victoria Freitas de. Aspectos químicos e moleculares do acúmulo de minerais em grãos de arroz. 2023. 188f. (Doutorado em agronomia – área de concentração: Fitomelhoramento) - Programa de Pós-Graduação em Agronomia, Departamento de Fitotecnia, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, RS, 2023.CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIAMapeamento genéticoOryza sativa L.Metais pesadosElementos traçosEdição de genomasHeavy metalsTrace elementsGenome editingAspectos químicos e moleculares do acúmulo de minerais em grãos de arrozChemical and molecular aspects of mineral accumulation in rice grainsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesishttp://lattes.cnpq.br/6426753952893515http://lattes.cnpq.br/5859282913464169Venske, Eduardohttp://lattes.cnpq.br/8953935036814149Karter, MartinPegoraro, CamilaOliveira, Victoria Freitas deinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELTEXTTese_Victoria_Oliveira.pdf.txtTese_Victoria_Oliveira.pdf.txtExtracted texttext/plain385232http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/9507/6/Tese_Victoria_Oliveira.pdf.txt69829915fe9bd7a0d1201c5c61b0360aMD56open accessTHUMBNAILTese_Victoria_Oliveira.pdf.jpgTese_Victoria_Oliveira.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1228http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/9507/7/Tese_Victoria_Oliveira.pdf.jpg53068d1f7d04efb24f124bae6601359fMD57open accessORIGINALTese_Victoria_Oliveira.pdfTese_Victoria_Oliveira.pdfapplication/pdf2846634http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/9507/1/Tese_Victoria_Oliveira.pdf89fb2869776509506eb82992c633eb3bMD51open accessCC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-849http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/9507/2/license_url924993ce0b3ba389f79f32a1b2735415MD52open accesslicense_textlicense_texttext/html; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/9507/3/license_textd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD53open accesslicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/9507/4/license_rdfd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD54open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-867http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/9507/5/license.txtfbd6c74465857056e3ca572d7586661bMD55open accessprefix/95072023-07-17 23:19:39.12open accessoai:guaiaca.ufpel.edu.br:prefix/9507VG9kb3Mgb3MgaXRlbnMgZGVzc2EgY29tdW5pZGFkZSBzZWd1ZW0gYSBsaWNlbsOnYSBDcmVhdGl2ZSBDb21tb25zLg==Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2023-07-18T02:19:39Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false
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