Análise comparativa de expressão proteica entre amostras tumorais e não tumorais de carcinomas mamários

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2015
Autor(a) principal: Costa, Gustavo Góes
Orientador(a): Ribeiro, Enilze Maria de Souza Fonseca, 1958-
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Genética
Mamas - Cancer
Proteômica
Link de acesso: http://hdl.handle.net/1884/40903
Resumo: Orientadora : Profª Drª Enilze Maria de Souza Fonseca Ribeiro
id UFPR_01bc1d50332f00ee57c2bd8ffb5e2448
oai_identifier_str oai:acervodigital.ufpr.br:1884/40903
network_acronym_str UFPR
network_name_str Repositório Institucional da UFPR
repository_id_str
spelling Costa, Gustavo GóesCavalli, Iglenir JoãoUniversidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em GenéticaRibeiro, Enilze Maria de Souza Fonseca, 1958-2016-01-18T11:06:15Z2016-01-18T11:06:15Z2015http://hdl.handle.net/1884/40903Orientadora : Profª Drª Enilze Maria de Souza Fonseca RibeiroCo-orientador : Prof. Dr.Iglenir João CavalliTese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba, 26/06 2015Inclui referências : f. 89-119Resumo: O câncer de mama é o tipo de câncer mais comum entre as mulheres e cerca de 57.000 novos casos são esperados para a população brasileira em 2015. Um conhecimento sólido sobre a expressão proteica é essencial para a compreensão biológica, diagnóstico precoce e tratamento do câncer de mama. Os principais objetivos deste trabalho foram identificar proteínas diferencialmente expressas entre amostras pareadas de carcinoma ductal invasivo e tecido não tumoral de mama, e na seleção de possíveis alvos, avaliar e comparar a expressão de RNAm e proteica de STIP1 entre amostras de tecido de mama tumoral, não tumoral e de linfonodo metastático. A análise proteômica comparativa foi realizada pelo método de eletroforese bidimensional em gel de poliacrilamida para cinco amostras pareadas, sendo consideradas apenas as bandas com diferença de expressão acima de duas vezes (p<0,05). As proteínas foram identificadas por espectrometria de massa (MALDI-TOF). A expressão de RNAm foi avaliada por PCR quantitativa em tempo real utilizando 53 amostras de tumor e oito de linfonodos metastáticos. Oito trios de amostras de tecido não tumoral, tumoral e linfonodo metastático tiveram a expressão de STIP1 comparada por western blotting (WB). A análise proteômica gerou 35 proteínas identificadas presentes em pelo menos duas amostras e, entre estas, as dez com maior variação de expressão foram: CASPE, ENOG, TPM1, CAPG, VIME, TPM3, TRFE, PDIA6, WDR61 e PDIA3. A expressão de RNAm de STIP1 foi maior na amostra de tumor em relação ao tecido não tumoral e ao linfonodo, enquanto a análise por WB mostrou aumento significante de expressão apenas entre tecido tumoral e não tumoral. Neste trabalho, identificamos mais de uma centena de proteínas diferencialmente expressas entre o tecido mamário não tumoral e tumoral, sendo muitas delas com participação já conhecida no câncer de mama enquanto outras ainda carecem de mais estudos. Entre elas encontra-se a proteína STIP1. A expressão de RNAm de STIP1 se mostrou aumentada nas amostras de tumor e linfonodo em relação ao controle não tumoral. Também houve aumento em nos linfonodos em relação aos tumores, mas não houve diferença significativa em relação a quaisquer outros parâmetros avaliados. STIP1 apresentou um aumento de expressão significativo no tecido tumoral em relação ao tecido não tumoral, mas não houve diferença na expressão de amostras de tumor e linfonodo metastático em análise por WB. Esses dados preliminares sugerem o aumento de expressão de STIP1 já no início da tumorigênese, permanecendo no processo metastático. Em conclusão, descrevemos várias proteínas diferencialmente expressas, discutindo a função de algumas pré-selecionadas no câncer de mama e avaliando a potencial utilização das mesmas como marcadores de diagnóstico e prognóstico. Este conhecimento é útil não só na carcinogênese mamária, mas na compreensão dos mecanismos básicos dos cânceres em geral.Abstract: Breast cancer is the most common type of cancer among women worldwide, and about 57,000 new cases are expected for the Brazilian population in 2015. A solid knowledge of protein expression is essential for biological understanding, early diagnosis and therapeutics of breast cancer. The main objectives of this study were the comparisons between the proteome of paired samples of invasive ductal breast tumors and non-tumor tissues, selecting possible targets to evaluate and compare the mRNA and protein expression of STIP1 among samples from tumor, non-tumor and metastatic lymph node. The comparative proteomic analysis was performed by two-dimensional electrophoresis in polyacrilamyde gel using five paired samples and considering for analysis just the spots with an expression difference over two fold (p<0.05). The proteins were identified by mass spectrometry (MALDI-TOF). Quantitative real time PCR was used to evaluate mRNA using 53 tumor samples and eight metastatic lymph nodes. ACTB and GAPDH were used as housekeeping controls and a pool of non-tumor samples as a calibrator. Eight triplets' tumor, nontumor and lymph node tissues had the expression of STIP1 compared by Western Blotting (WB). The proteomic analysis identified 35 proteins common to at least two samples and, among them, the ten with the highest differences in expression were CASPE, ENOG, TPM1, CAPG, VIME, TPM3, TRFE, PDIA6, WDR61 and PDIA3. The STIP1 mRNA expression was higher in tumor samples than in non-tumor and lymph nodes. WB analysis showed a significant increase just between tumor and non-tumor samples. In the present work, we identified more than a hundred proteins with differential expression comparing tumor and non-tumor tissue, most of them with a recognized role in breast cancer and others needing more studies, like STIP1. The mRNA levels of STIP1 were different between tumor and normal control and between tumor and lymph node, but no difference was seen with all other parameters analyzed. STIP1 was significantly overexpressed in tumor tissue compared with nontumor but no difference was seen between tumor and metastatic lymph node in WB analysis. These preliminary data suggest the increase of STIP1 expression in early tumorigenesis, persisting during the metastatic process. In conclusion, we describe several differentially expressed proteins, discussing the function of pre-selected ones in breast cancer and evaluating their potential use as diagnosis or prognosis markers. This knowledge is useful not only to mammary carcinogenesis but also to the understanding of basic mechanisms of cancer in general.159 f. : il. algumas color., grafs., tabs.application/pdfDisponível em formato digitalGenéticaMamas - CancerProteômicaAnálise comparativa de expressão proteica entre amostras tumorais e não tumorais de carcinomas mamáriosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessTEXTR - T - GUSTAVO GOES DA COSTA.pdf.txtExtracted Texttext/plain308237https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/40903/1/R%20-%20T%20-%20GUSTAVO%20GOES%20DA%20COSTA.pdf.txtc99f6fa8585da582321dd1a5c1baafbdMD51open accessORIGINALR - T - GUSTAVO GOES DA COSTA.pdfapplication/pdf3659821https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/40903/2/R%20-%20T%20-%20GUSTAVO%20GOES%20DA%20COSTA.pdf90893aca3b7f30a89c4d421935f8ba30MD52open accessTHUMBNAILR - T - GUSTAVO GOES DA COSTA.pdf.jpgR - T - GUSTAVO GOES DA COSTA.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1442https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/40903/3/R%20-%20T%20-%20GUSTAVO%20GOES%20DA%20COSTA.pdf.jpgded087167ad505aa61f64c29ba509275MD53open access1884/409032016-04-07 11:38:09.336open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/40903Repositório InstitucionalPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestinformacaodigital@ufpr.bropendoar:3082016-04-07T14:38:09Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
dc.title.none.fl_str_mv Análise comparativa de expressão proteica entre amostras tumorais e não tumorais de carcinomas mamários
title Análise comparativa de expressão proteica entre amostras tumorais e não tumorais de carcinomas mamários
spellingShingle Análise comparativa de expressão proteica entre amostras tumorais e não tumorais de carcinomas mamários
Costa, Gustavo Góes
Genética
Mamas - Cancer
Proteômica
title_short Análise comparativa de expressão proteica entre amostras tumorais e não tumorais de carcinomas mamários
title_full Análise comparativa de expressão proteica entre amostras tumorais e não tumorais de carcinomas mamários
title_fullStr Análise comparativa de expressão proteica entre amostras tumorais e não tumorais de carcinomas mamários
title_full_unstemmed Análise comparativa de expressão proteica entre amostras tumorais e não tumorais de carcinomas mamários
title_sort Análise comparativa de expressão proteica entre amostras tumorais e não tumorais de carcinomas mamários
author Costa, Gustavo Góes
author_facet Costa, Gustavo Góes
author_role author
dc.contributor.other.none.fl_str_mv Cavalli, Iglenir João
Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Genética
dc.contributor.author.fl_str_mv Costa, Gustavo Góes
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Ribeiro, Enilze Maria de Souza Fonseca, 1958-
contributor_str_mv Ribeiro, Enilze Maria de Souza Fonseca, 1958-
dc.subject.por.fl_str_mv Genética
Mamas - Cancer
Proteômica
topic Genética
Mamas - Cancer
Proteômica
description Orientadora : Profª Drª Enilze Maria de Souza Fonseca Ribeiro
publishDate 2015
dc.date.issued.fl_str_mv 2015
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2016-01-18T11:06:15Z
dc.date.available.fl_str_mv 2016-01-18T11:06:15Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/1884/40903
url http://hdl.handle.net/1884/40903
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv Disponível em formato digital
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 159 f. : il. algumas color., grafs., tabs.
application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPR
instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron:UFPR
instname_str Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron_str UFPR
institution UFPR
reponame_str Repositório Institucional da UFPR
collection Repositório Institucional da UFPR
bitstream.url.fl_str_mv https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/40903/1/R%20-%20T%20-%20GUSTAVO%20GOES%20DA%20COSTA.pdf.txt
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/40903/2/R%20-%20T%20-%20GUSTAVO%20GOES%20DA%20COSTA.pdf
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/40903/3/R%20-%20T%20-%20GUSTAVO%20GOES%20DA%20COSTA.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv c99f6fa8585da582321dd1a5c1baafbd
90893aca3b7f30a89c4d421935f8ba30
ded087167ad505aa61f64c29ba509275
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)
repository.mail.fl_str_mv informacaodigital@ufpr.br
_version_ 1847526108770074624

Registros relacionados