Diversidade populacional de microssatélites do complexo principal de histocompatibilidade (MHC) em populações indígenas do Paraná e do Mato Grosso do Sul

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2007
Autor(a) principal: Oliveira, Liana Alves de
Orientador(a): Petzl-Erler, Maria Luiza, 1953-
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Teses
Genetica de populaçoes
Histocompatibilidade
Índios Guarani - Paraná
Indios Kaingang - Paraná
Genetica
Marcadores genéticos
Link de acesso: https://hdl.handle.net/1884/8545
Resumo: Orientadora : Marta Luiza Petzl-Erler
id UFPR_45202abba07eb9b22203eb77cb29bf01
oai_identifier_str oai:acervodigital.ufpr.br:1884/8545
network_acronym_str UFPR
network_name_str Repositório Institucional da UFPR
repository_id_str
spelling Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em GenéticaPetzl-Erler, Maria Luiza, 1953-Oliveira, Liana Alves de2025-04-14T14:44:09Z2025-04-14T14:44:09Z2007https://hdl.handle.net/1884/8545Orientadora : Marta Luiza Petzl-ErlerDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba, 2007Inclui bibliografiaÁrea de concentração : Maria Luiza Petzl-ErlerMicrossatélites são seqüências curtas de DNA, repetidas em tandem, que ocorrem em todo o genoma. Muitos apresentam alto grau de polimorfismo e são bons marcadores genéticos para estudos populacionais. A genética de populações é uma ótima ferramenta para melhorar nosso entendimento da história das populações humanas e da evolução de genes e de genomas. Neste trabalho, caracterizamos 14 microssatélites da região genômica do MHC em populações ameríndias dos estados do Paraná e do Mato Grosso do Sul. Foram descritas as freqüências alélicas e genotípicas, o desequilíbrio de ligação dos microssatélites com genes desta região cromossômica estudados anteriormente e as distâncias genéticas entre as populações. Foram feitas comparações das freqüências alélicas entre as populações deste estudo e com populações descritas na literatura. Além disso, foi construído um dendrograma baseado nas freqüências alélicas dos microssatélites. Os microssatélites com a maior diversidade genética estão na região do MHC de classe I, o que é consistente com um resultado anterior que encontrou maior diversidade próximo ao gene HLA-B. A população com maior diversidade foi Guarani Ñandeva, que também teve a menor distância genética em relação a uma população euro-brasileira. Estes resultados são consistentes com o maior fluxo gênico com populações não ameríndias observado anteriormente para essa população. Nos Kaingang, foi encontrado pela primeira vez em um estudo populacional uma alta freqüência do alelo STR_MICA*A10. Este alelo parece ter surgido associado ao HLA-B*3505, que é evolutivamente novo e exclusivo de ameríndios e que teria sido favorecido pela seleção natural balanceadora e/ou por deriva genética, fazendo com que a freqüência do alelo STR_MICA*A10 também aumentasse. Os resultados deste estudo evidenciam a grande distância genética entre os Kaingang e os Guarani, apesar da grande proximidade geográfica. Os resultados também confirmam o forte desequilíbrio de ligação entre genes do MHC, principalmente entre os genes HLA clássicos. Além disso, os resultados apontam para uma evolução mais rápida na região do MHC de classe I.Microsatellites are short tandem repeats (STR) found throughout the genome. Many are highly polymorphic, being good markers for genetics studies. In the present work, we analysed 14 microsatellites of the MHC region in the Brazilian Amerindian populations, Guarani and Kaingang, with the aim of characterizing the populations and improving the knowledge on MHC evolution. The allelic and genotypic frequencies of all markers are described and compared to those in the literature for other populations. The allelic frequencies were also used to estimate the genetic distances between the populations, which were then used to construct a dendrogram. The patterns of linkage disequilibrium among the microsatellites and with other MHC loci are described. Haplotypic frequencies were estimated for the loci in strong linkage disequilibrium. First, the most polymorphic loci were those located in the MHC class I region. The population found to have the greatest diversity was Guarani Ñandeva, that also has the smallest distance to an Euro-Brazilian population, what can be explained by more intense gene flow with non Amerindian populations, which was observed previously. Additionally, the allele STR_MICA*A10 was observed for the first time with a significant frequency in a population, the Kaingang. It was found in a haplotype containing HLA-B*3505, an allele exclusive to the Amerindians and thought to have emerged in South America. It is possible that the high frequency of STR_MICA*A10 in the Kaingang is explained by the balancing selection and genetic drift that have favored the new HLA alleles in the Amerindians, as proposed in the turnover hypotesis. The results also highlight the great genetic distance between the Kaingang and Guarani, despite the short geographic distance. Finally, the results point to a faster evolution in the class I region, with stronger patterns of linkage disequilibrium, greater diversity and greater differentiation among populations.104f. : il. algumas color. grafs., tabs.application/pdfDisponível em formato digitalTesesGenetica de populaçoesHistocompatibilidadeÍndios Guarani - ParanáIndios Kaingang - ParanáGeneticaMarcadores genéticosDiversidade populacional de microssatélites do complexo principal de histocompatibilidade (MHC) em populações indígenas do Paraná e do Mato Grosso do Sulinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALDissertação Liana.pdfapplication/pdf1280107https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/8545/1/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Liana.pdf086496e8a720c9b27e378f1194bb509dMD51open accessTEXTDissertação Liana.pdf.txtExtracted Texttext/plain218141https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/8545/2/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Liana.pdf.txt9172f06bb3f06cb2366d8130f85522e7MD52open accessTHUMBNAILDissertação Liana.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1261https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/8545/3/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Liana.pdf.jpg6203d556c7ae85ad8e1970938a7793ecMD53open access1884/85452025-04-14 11:44:09.787open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/8545Repositório InstitucionalPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestinformacaodigital@ufpr.bropendoar:3082025-04-14T14:44:09Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Diversidade populacional de microssatélites do complexo principal de histocompatibilidade (MHC) em populações indígenas do Paraná e do Mato Grosso do Sul
title Diversidade populacional de microssatélites do complexo principal de histocompatibilidade (MHC) em populações indígenas do Paraná e do Mato Grosso do Sul
spellingShingle Diversidade populacional de microssatélites do complexo principal de histocompatibilidade (MHC) em populações indígenas do Paraná e do Mato Grosso do Sul
Oliveira, Liana Alves de
Teses
Genetica de populaçoes
Histocompatibilidade
Índios Guarani - Paraná
Indios Kaingang - Paraná
Genetica
Marcadores genéticos
title_short Diversidade populacional de microssatélites do complexo principal de histocompatibilidade (MHC) em populações indígenas do Paraná e do Mato Grosso do Sul
title_full Diversidade populacional de microssatélites do complexo principal de histocompatibilidade (MHC) em populações indígenas do Paraná e do Mato Grosso do Sul
title_fullStr Diversidade populacional de microssatélites do complexo principal de histocompatibilidade (MHC) em populações indígenas do Paraná e do Mato Grosso do Sul
title_full_unstemmed Diversidade populacional de microssatélites do complexo principal de histocompatibilidade (MHC) em populações indígenas do Paraná e do Mato Grosso do Sul
title_sort Diversidade populacional de microssatélites do complexo principal de histocompatibilidade (MHC) em populações indígenas do Paraná e do Mato Grosso do Sul
author Oliveira, Liana Alves de
author_facet Oliveira, Liana Alves de
author_role author
dc.contributor.other.pt_BR.fl_str_mv Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Genética
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Petzl-Erler, Maria Luiza, 1953-
dc.contributor.author.fl_str_mv Oliveira, Liana Alves de
contributor_str_mv Petzl-Erler, Maria Luiza, 1953-
dc.subject.por.fl_str_mv Teses
Genetica de populaçoes
Histocompatibilidade
Índios Guarani - Paraná
Indios Kaingang - Paraná
Genetica
Marcadores genéticos
topic Teses
Genetica de populaçoes
Histocompatibilidade
Índios Guarani - Paraná
Indios Kaingang - Paraná
Genetica
Marcadores genéticos
description Orientadora : Marta Luiza Petzl-Erler
publishDate 2007
dc.date.issued.fl_str_mv 2007
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2025-04-14T14:44:09Z
dc.date.available.fl_str_mv 2025-04-14T14:44:09Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://hdl.handle.net/1884/8545
url https://hdl.handle.net/1884/8545
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.pt_BR.fl_str_mv Disponível em formato digital
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 104f. : il. algumas color. grafs., tabs.
application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPR
instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron:UFPR
instname_str Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron_str UFPR
institution UFPR
reponame_str Repositório Institucional da UFPR
collection Repositório Institucional da UFPR
bitstream.url.fl_str_mv https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/8545/1/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Liana.pdf
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/8545/2/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Liana.pdf.txt
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/8545/3/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Liana.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 086496e8a720c9b27e378f1194bb509d
9172f06bb3f06cb2366d8130f85522e7
6203d556c7ae85ad8e1970938a7793ec
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)
repository.mail.fl_str_mv informacaodigital@ufpr.br
_version_ 1847526241215709184

Registros relacionados