Efeito da adição de fenol em culturas de Herbaspirillum seropedicae SmR1

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2014
Autor(a) principal: Perez, Rafaela
Orientador(a): Chubatsu, Leda Satie, 1966-
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Bioquímica
Herbaspirillum
Tolerancia
Link de acesso: http://hdl.handle.net/1884/41255
Resumo: Orientadora : Profª Drª Leda Satie Chubatsu
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spelling Perez, RafaelaSfeir, Michelle Zibetti TadraUniversidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Ciências (Bioquímica)Chubatsu, Leda Satie, 1966-2016-02-23T13:40:18Z2016-02-23T13:40:18Z2014http://hdl.handle.net/1884/41255Orientadora : Profª Drª Leda Satie ChubatsuCo-orientadora : Profª. Drª. Michelle Zibetti Tadra SfeirDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ciências : Bioquímica. Defesa: Curitiba, 2014Inclui referências : f. 69-74Resumo: Herbaspirillum seropedicae é uma bactéria fixadora de nitrogênio (diazotrófica) encontrada no interior de diversas plantas de interesse agrícola como o milho, arroz, trigo, sorgo, cana-de-açúcar, entre outras. Através do sequenciamento genômico deste organismo foi possível a identificação de genes que codificam produtos potencialmente envolvidos na degradação de compostos aromáticos Estes genes também podem estar relacionados com a comunicação planta-bactéria. Fenol é um poluente ambiental de distribuição mundial, de baixa taxa de degradação e de alta toxicidade para microrganismos. A tolerância a este composto aromático envolve diversos mecanismos como alterações na membrana plasmática, alterações na transcrição de genes, bombas de efluxo, entre outros. Neste contexto, o presente trabalho verificou que a bactéria H. seropedicae apresenta tolerância a fenol em concentrações iguais ou inferiores a 2,5 mM. Análise de transcriptoma por RNA-seq de células incubadas na ausência ou presença de 5 mM de fenol indicou que 485 genes estavam diferencialmente expressos dos quais 275 estavam induzidos e 210 reprimidos. Entre os genes mais induzidos na presença de fenol estão presentes os genes que codificam para biossíntese de exopolissacarídeos (EPS), transportadores ABC, genes envolvidos na degradação de flavonoides e compostos aromáticos. Os resultados indicam que estes genes ativados agem em resposta a adição ao fenol tentando minimizar os efeitos causados no metabolismo de H. seropedicae podendo ser atribuídos a eles a tolerância a concentrações elevadas de fenol e também como uma tentativa de reestabelecer o estado energético da célula e manter o crescimento bacteriano. Palavras-chave: Herbaspirillum seropedicae SmR1. Fenol. Tolerância.Abstract: Herbaspirillum seropedicae is a nitrogen fixing bacteria (diazotroph) found in endophytic association with important agricultural crops such as maize, rice, wheat, sorghum, sugar cane and others. The genome of H. seropedicae strain SmR1 was sequenced allowing the identification of genes coding for proteins potentially involved in degradation of aromatic compounds. These genes also may be involved in plantbacteria communication. Phenol is an environmental pollutant found in different world regions, showing high toxicity and low degradation rate. Some microorganisms show phenol tolerance through mechanisms involving modification of their cellular membrane, transcription activation, efflux pumps, among others. In this work, we determine that H. seropedicae is able to grow in the presence of up to 2.5 mM phenol. Transcriptome analysis (RNA-seq) of cells incubated in the absence or presence of 5 mM phenol showed that 485 genes were differentially expressed (275 genes were induced and 210 genes were repressed). Among the induced genes are those involved in exopolysaccharides metabolism (EPS), ABC transporters, flavonoids and aromatic compounds degradation. The results suggested that the activated genes in response to phenol minimize its effect on the H. seropedicae metabolism allowing the establishment of an energetic state allowing the bacterial growth. Key-words: Herbaspirillum seropedicae SmR1. Phenol. Tolerance.89 f. : il. algumas color., tabs.application/pdfDisponível em formato digitalBioquímicaHerbaspirillumToleranciaEfeito da adição de fenol em culturas de Herbaspirillum seropedicae SmR1info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALR - D - RAFAELA PEREZ.pdfapplication/pdf3650097https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/41255/1/R%20-%20D%20-%20RAFAELA%20PEREZ.pdf3d1dcd303438321aef1d62bee873d543MD51open accessTEXTR - D - RAFAELA PEREZ.pdf.txtExtracted Texttext/plain148091https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/41255/2/R%20-%20D%20-%20RAFAELA%20PEREZ.pdf.txtf4ea9230bc50459817b797b43e8813baMD52open accessTHUMBNAILR - D - RAFAELA PEREZ.pdf.jpgR - D - RAFAELA PEREZ.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1192https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/41255/3/R%20-%20D%20-%20RAFAELA%20PEREZ.pdf.jpg7e7afc8793704296afd700d7db7965ccMD53open access1884/412552016-04-08 04:18:18.208open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/41255Repositório InstitucionalPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestinformacaodigital@ufpr.bropendoar:3082016-04-08T07:18:18Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
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