Metataxonomia, perfil de virulência e susceptibilidade a antifúngicos de leveduras verdadeiras e fungos semelhantes a leveduras em um ambiente aquático em região subtropical da América do Sul

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2021
Autor(a) principal: Pagani, Danielle Machado
Orientador(a): Silva, Patrícia Valente da
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Suscetibilidade a doenças
Leveduras
Lagoas
Farmacorresistência fúngica
Link de acesso: http://hdl.handle.net/10183/254384
Resumo: As Lagoas são um ecossistema frágil, utilizado por várias espécies como refúgio e zona de reprodução, sendo também local de desenvolvimento da pesca em certas comunidades. Com a crescente urbanização em torno desse ecossistema, os pesticidas usados na agricultura e as águas residuais urbanas não tratadas são drenados para a bacia do rio, dispersando a matéria orgânica e os antifúngicos usados pela população e pelos agricultores. Esse fato pode favorecer a seleção de patógenos diretamente no meio ambiente e fazendo com que diversos fungos resistentes tenham surgido nas últimas décadas. Para investigar a presença de leveduras potencialmente patogênicas e entender a sua presença no ambiente, amostras de água de 4 pontos em 4 coletas sazonais, nas estações seca e chuvosa, foram analisadas para a presença de pesticidas através do sistema SPE-LC-ESI-MS / MS, e as leveduras ambientais foram isoladas da lagoa. Um meio seletivo contendo antifúngicos foi utilizado para isolar leveduras com possível resistência aos antifúngicos. Isolados com concentração inibitória mínima elevada e perfil enzimático de virulência foram recuperados, além da identificação de agentes antifúngicos como triciclazol, carbendazim, azoxistrobina, tiabendazol e tebuconazol na lagoa em amostras de água. Caracterizando o ambiente como reservatório de possíveis genes de resistência e fonte de infecção fúngica. Amostras de duas coletas foram utilizadas para a análise de metataxonômica utilizando o gene ITS como marcador. A primeira análise foi realizada com Íon Torrent em amostras compostas de cada um dos quatro pontos analisados. A segunda análise foi realizada através da plataforma Illumina em triplicata para cada uma das amostras. Através de análises das sequências obtidas, em ambas as abordagens podemos perceber a grande diversidade de fungos ainda não descritos em ambientes aquáticos e a sua variação sazonal.
id UFRGS-2_fa5b0c13e0d7b35347ecef83a1085620
oai_identifier_str oai:www.lume.ufrgs.br:10183/254384
network_acronym_str UFRGS-2
network_name_str Repositório Institucional da UFRGS
repository_id_str
spelling Pagani, Danielle MachadoSilva, Patrícia Valente daScroferneker, Maria LuciaThey, Ng Haig2023-02-08T05:01:50Z2021http://hdl.handle.net/10183/254384001161461As Lagoas são um ecossistema frágil, utilizado por várias espécies como refúgio e zona de reprodução, sendo também local de desenvolvimento da pesca em certas comunidades. Com a crescente urbanização em torno desse ecossistema, os pesticidas usados na agricultura e as águas residuais urbanas não tratadas são drenados para a bacia do rio, dispersando a matéria orgânica e os antifúngicos usados pela população e pelos agricultores. Esse fato pode favorecer a seleção de patógenos diretamente no meio ambiente e fazendo com que diversos fungos resistentes tenham surgido nas últimas décadas. Para investigar a presença de leveduras potencialmente patogênicas e entender a sua presença no ambiente, amostras de água de 4 pontos em 4 coletas sazonais, nas estações seca e chuvosa, foram analisadas para a presença de pesticidas através do sistema SPE-LC-ESI-MS / MS, e as leveduras ambientais foram isoladas da lagoa. Um meio seletivo contendo antifúngicos foi utilizado para isolar leveduras com possível resistência aos antifúngicos. Isolados com concentração inibitória mínima elevada e perfil enzimático de virulência foram recuperados, além da identificação de agentes antifúngicos como triciclazol, carbendazim, azoxistrobina, tiabendazol e tebuconazol na lagoa em amostras de água. Caracterizando o ambiente como reservatório de possíveis genes de resistência e fonte de infecção fúngica. Amostras de duas coletas foram utilizadas para a análise de metataxonômica utilizando o gene ITS como marcador. A primeira análise foi realizada com Íon Torrent em amostras compostas de cada um dos quatro pontos analisados. A segunda análise foi realizada através da plataforma Illumina em triplicata para cada uma das amostras. Através de análises das sequências obtidas, em ambas as abordagens podemos perceber a grande diversidade de fungos ainda não descritos em ambientes aquáticos e a sua variação sazonal.Lagoons are a fragile ecosystem, used by several species as a refuge and breeding area, and are also a place for fishing development in certain communities. With increasing urbanization around this ecosystem, pesticides used in agriculture and untreated urban wastewater are drained into the river basin, dispersing organic matter and antifungals used by the population and farmers. This fact may favor the selection of pathogens directly in the environment and cause several resistant fungi to have emerged in recent decades. Water samples from 4 points in 4 seasonal collections in the dry and rainy seasons were analyzed for the existence of pesticides in the environment using the SPE-LC-ESI-MS system. / MS and environmental yeasts were isolated from the pond. A selective medium containing antifungals was used to isolate yeasts with possible antifungal resistance. Isolates with high minimum inhibitory concentration and enzymatic virulence profile were recovered. Also, antifungal agents such as tricyclazole, carbendazim, azoxystrobin, thiabendazole, and tebuconazole were identified in the lagoon in water samples. These findings characterize the environment as a reservoir of possible resistance genes and a source of fungal infection. Samples from two field sampling were used for metataxonomic analysis using the ITS gene as a marker. The first analysis was performed with Ion Torrent in composed samples of each of the four analyzed points. The second analysis was performed using the Illumina platform in triplicate for each sample. Through analysis of the sequences obtained, we can perceive the great diversity of fungi not yet described in aquatic environments and their seasonal variation.application/pdfporSuscetibilidade a doençasLevedurasLagoasFarmacorresistência fúngicaMetataxonomia, perfil de virulência e susceptibilidade a antifúngicos de leveduras verdadeiras e fungos semelhantes a leveduras em um ambiente aquático em região subtropical da América do Sulinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulInstituto de Ciências Básicas da SaúdePrograma de Pós-Graduação em Microbiologia Agrícola e do AmbientePorto Alegre, BR-RS2021doutoradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSTEXT001161461.pdf.txt001161461.pdf.txtExtracted Texttext/plain206546http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/254384/2/001161461.pdf.txt5d65c813c8dfc8e62c871347e4199e37MD52ORIGINAL001161461.pdfTexto completoapplication/pdf5252753http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/254384/1/001161461.pdf80f9a9ff0aa81a6d952d437c394a84a3MD5110183/2543842026-01-30 09:01:48.2309oai:www.lume.ufrgs.br:10183/254384Repositório InstitucionalPUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestlume@ufrgs.bropendoar:2026-01-30T11:01:48Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Metataxonomia, perfil de virulência e susceptibilidade a antifúngicos de leveduras verdadeiras e fungos semelhantes a leveduras em um ambiente aquático em região subtropical da América do Sul
title Metataxonomia, perfil de virulência e susceptibilidade a antifúngicos de leveduras verdadeiras e fungos semelhantes a leveduras em um ambiente aquático em região subtropical da América do Sul
spellingShingle Metataxonomia, perfil de virulência e susceptibilidade a antifúngicos de leveduras verdadeiras e fungos semelhantes a leveduras em um ambiente aquático em região subtropical da América do Sul
Pagani, Danielle Machado
Suscetibilidade a doenças
Leveduras
Lagoas
Farmacorresistência fúngica
title_short Metataxonomia, perfil de virulência e susceptibilidade a antifúngicos de leveduras verdadeiras e fungos semelhantes a leveduras em um ambiente aquático em região subtropical da América do Sul
title_full Metataxonomia, perfil de virulência e susceptibilidade a antifúngicos de leveduras verdadeiras e fungos semelhantes a leveduras em um ambiente aquático em região subtropical da América do Sul
title_fullStr Metataxonomia, perfil de virulência e susceptibilidade a antifúngicos de leveduras verdadeiras e fungos semelhantes a leveduras em um ambiente aquático em região subtropical da América do Sul
title_full_unstemmed Metataxonomia, perfil de virulência e susceptibilidade a antifúngicos de leveduras verdadeiras e fungos semelhantes a leveduras em um ambiente aquático em região subtropical da América do Sul
title_sort Metataxonomia, perfil de virulência e susceptibilidade a antifúngicos de leveduras verdadeiras e fungos semelhantes a leveduras em um ambiente aquático em região subtropical da América do Sul
author Pagani, Danielle Machado
author_facet Pagani, Danielle Machado
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Pagani, Danielle Machado
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Silva, Patrícia Valente da
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Scroferneker, Maria Lucia
They, Ng Haig
contributor_str_mv Silva, Patrícia Valente da
Scroferneker, Maria Lucia
They, Ng Haig
dc.subject.por.fl_str_mv Suscetibilidade a doenças
Leveduras
Lagoas
Farmacorresistência fúngica
topic Suscetibilidade a doenças
Leveduras
Lagoas
Farmacorresistência fúngica
description As Lagoas são um ecossistema frágil, utilizado por várias espécies como refúgio e zona de reprodução, sendo também local de desenvolvimento da pesca em certas comunidades. Com a crescente urbanização em torno desse ecossistema, os pesticidas usados na agricultura e as águas residuais urbanas não tratadas são drenados para a bacia do rio, dispersando a matéria orgânica e os antifúngicos usados pela população e pelos agricultores. Esse fato pode favorecer a seleção de patógenos diretamente no meio ambiente e fazendo com que diversos fungos resistentes tenham surgido nas últimas décadas. Para investigar a presença de leveduras potencialmente patogênicas e entender a sua presença no ambiente, amostras de água de 4 pontos em 4 coletas sazonais, nas estações seca e chuvosa, foram analisadas para a presença de pesticidas através do sistema SPE-LC-ESI-MS / MS, e as leveduras ambientais foram isoladas da lagoa. Um meio seletivo contendo antifúngicos foi utilizado para isolar leveduras com possível resistência aos antifúngicos. Isolados com concentração inibitória mínima elevada e perfil enzimático de virulência foram recuperados, além da identificação de agentes antifúngicos como triciclazol, carbendazim, azoxistrobina, tiabendazol e tebuconazol na lagoa em amostras de água. Caracterizando o ambiente como reservatório de possíveis genes de resistência e fonte de infecção fúngica. Amostras de duas coletas foram utilizadas para a análise de metataxonômica utilizando o gene ITS como marcador. A primeira análise foi realizada com Íon Torrent em amostras compostas de cada um dos quatro pontos analisados. A segunda análise foi realizada através da plataforma Illumina em triplicata para cada uma das amostras. Através de análises das sequências obtidas, em ambas as abordagens podemos perceber a grande diversidade de fungos ainda não descritos em ambientes aquáticos e a sua variação sazonal.
publishDate 2021
dc.date.issued.fl_str_mv 2021
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2023-02-08T05:01:50Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10183/254384
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv 001161461
url http://hdl.handle.net/10183/254384
identifier_str_mv 001161461
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRGS
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron:UFRGS
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron_str UFRGS
institution UFRGS
reponame_str Repositório Institucional da UFRGS
collection Repositório Institucional da UFRGS
bitstream.url.fl_str_mv http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/254384/2/001161461.pdf.txt
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/254384/1/001161461.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 5d65c813c8dfc8e62c871347e4199e37
80f9a9ff0aa81a6d952d437c394a84a3
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
repository.mail.fl_str_mv lume@ufrgs.br
_version_ 1864542811400962048

Registros relacionados