Importância da análise da expressão gênica em tecidos e células-únicas no estudo das neurociências: do desenvolvimento do neocórtex ao estudo da doença de Alzheimer

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2021
Autor(a) principal: Coelho, Diego Marques
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal do Rio Grande do Norte
Brasil
UFRN
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOINFORMÁTICA
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/33237
Resumo: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
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spelling Importância da análise da expressão gênica em tecidos e células-únicas no estudo das neurociências: do desenvolvimento do neocórtex ao estudo da doença de AlzheimerTranscriptômicaAnálise da expressão gênicaDoença de AlzheimerDesenvolvimento do neocórtexscRNAseqCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESO sequenciamento de RNA mensageiro em larga escala (RNAseq) permite avaliar a diversidade de transcritos expressos em um determinado momento de um sistema biológico. Através da bioinformática, podemos analisar os dados de sequenciamento para obter informações quantitativas sobre a expressão gênica, tais como a expressão diferencial de genes e suas isoformas (splices alternativos). Nesta tese, apresentamos dois estudos independentes que se valeram da bioinformática para obter informações relevantes sobre diferentes fenômenos biológicos. No primeiro caso, nós utilizamos dados de sequenciamento de RNAm em cérebros de pacientes com a doença de Alzheimer para estudar a expressão diferencial de genes e transcritos associadas com a progressão desta doença. Nós demonstramos que a análise de transcritos permite a identificação de alterações gênicas ignoradas em estudos anteriores avaliando apenas a expressão global dos genes. Utilizando dados de sequenciamento de RNAm em células únicas (scRNAseq), nós também mapeamos as alterações da expressão gênica no cérebro de pacientes com a doença de Alzheimer para tipos celulares específicos. Os resultados deste primeiro trabalho contribuem para uma melhor compreensão da patofisiologia da doença de Alzheimer e indicam potenciais alterações moleculares associadas com a doença em tipos celulares individuais. No segundo trabalho desenvolvido nesta tese, nós utilizamos a técnica de scRNAseq para estudar a diversidade de células progenitoras em estágios iniciais do desenvolvimento do neocórtex. Através de análises de expressão diferencial de genes e a utilização de uma abordagem utilizando redes de regulação da expressão gênica, nós identificamos o fator de transcrição Sox9 como um regulador-mestre do comportamento de diferentes subtipos de progenitores neurais. Confirmando estes achados da bioinformática, experimentos genéticos para manipular os níveis de expressão de Sox9 em progenitores neurais demonstraram a importância deste fator de transcrição na regulação da proliferação e diferenciação celular. Em conjunto, os resultados desta tese demonstram a importância da análise transcriptômica através de métodos complementares para uma melhor identificação das alterações da expressão gênica relevantes em diferentes contextos biológicos.Universidade Federal do Rio Grande do NorteBrasilUFRNPROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOINFORMÁTICACosta, Marcos Romualdohttp://lattes.cnpq.br/2074007934768692http://lattes.cnpq.br/6118493598074445Souza, Sandro José dehttp://lattes.cnpq.br/8479967495464590Lourenço, Mychael Vinícius da Costahttp://lattes.cnpq.br/4749634096638221Garcez, Patricia Pestanahttp://lattes.cnpq.br/7284551536353300Dalmolin, Rodrigo Juliani Siqueirahttp://lattes.cnpq.br/4065178015615979Velho, Tarciso André Ferreirahttp://lattes.cnpq.br/8194534389725093Coelho, Diego Marques2021-08-23T19:29:03Z2021-08-23T19:29:03Z2021-05-31info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfCOELHO, Diego Marques. Importância da análise da expressão gênica em tecidos e células-únicas no estudo das neurociências: do desenvolvimento do neocórtex ao estudo da doença de Alzheimer. 2021. 205f. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto Metrópole Digital, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2021.https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/33237info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFRNinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)instacron:UFRN2021-08-23T19:30:02Zoai:repositorio.ufrn.br:123456789/33237Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufrn.br/oai/repositorio@bczm.ufrn.bropendoar:2021-08-23T19:30:02Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)false
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