Explorando a expressão gênica na biotransformação de aves marinhas

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Geraldo, Márcia Eduarda
Orientador(a): Silva, Guilherme de Toledo e
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Link de acesso: https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/261224
Resumo: Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e do Desenvolvimento, Florianópolis, 2024.
id UFSC_5e8ee2f44fa6f23b720025f4b89802d8
oai_identifier_str oai:repositorio.ufsc.br:123456789/261224
network_acronym_str UFSC
network_name_str Repositório Institucional da UFSC
repository_id_str
spelling Universidade Federal de Santa CatarinaGeraldo, Márcia EduardaSilva, Guilherme de Toledo eBainy, Afonso Celso Dias2024-11-28T23:40:57Z2024-11-28T23:40:57Z2024388843https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/261224Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e do Desenvolvimento, Florianópolis, 2024.Nos últimos anos, observou-se um aumento significativo das atividades humanas, resultando no aumento do descarte de resíduos domésticos, industriais e agrícolas no ambiente aquático. Esses eventos têm gerado consequências significativas para os organismos que habitam esses locais. A biotransformação de xenobióticos, um processo metabólico crucial na resposta desses organismos à exposição a substâncias químicas exógenas, desencadeia uma série complexa de eventos metabólicos. As ciências ômicas compreendem diversas subáreas dedicadas à análise de dados biológicos, como a genômica e a transcriptômica. Quando combinadas com a ecotoxicologia, surgem novos campos de estudo, como a ecotoxicogenômica, que se concentra na expressão gênica em espécies não-alvo expostas a contaminantes. Essa abordagem é interessante para esclarecer os processos biológicos subjacentes às respostas fisiológicas diante da contaminação. Nesse contexto, este estudo teve como objetivo realizar a montagem e a anotação do transcriptoma hepático de duas espécies de aves marinhas: Puffinus puffinus, encontrada encalhada na praia em estado post mortem, e Larus dominicanus, que foi encontrada viva na praia e faleceu durante o processo de reabilitação. Ambas as espécies foram coletadas pelo Projeto de Monitoramento de Praias - Bacia de Santos (PMP-BS). O material sequenciado foi montado, apresentando alta qualidade e anotado de acordo com o banco de dados UniProt/SwissProt. A partir da anotação funcional, identificamos genes associados aos processos de biotransformação de fase I e fase II, incluindo genes de CYP, FMO, GST, SULT, UGT e o receptor AHR. As análises de ontologia genética revelaram uma variedade de processos biológicos, destacando-se a atividade transferase. Já as análises de vias metabólicas do KEGG identificaram algumas vias comuns entre as espécies, como necroptose e infecção por Salmonella. Esses achados indicam a presença de genes que desempenham papéis biológicos importantes, mesmo em tecidos de aves no estado post mortem. Esses resultados abrem novas possibilidades para estudos futuros, além de validar o uso de animais moribundos ou mortos em determinadas análises e projetos científicos.Abstract: In recent years, there has been a significant increase in human activities, resulting in the heightened disposal of domestic, industrial, and agricultural waste into the aquatic environment. These events have led to significant consequences for the organisms inhabiting these areas. The biotransformation of xenobiotics, a crucial metabolic process in the response of these organisms to exposure to exogenous chemical substances, triggers a complex series of metabolic events. Omics sciences comprise various subfields dedicated to the analysis of biological data, such as genomics and transcriptomics. When combined with ecotoxicology, new fields of study emerge, such as ecotoxicogenomics, which focuses on gene expression in non-target species exposed to contaminants. This approach is useful in elucidating the biological processes underlying physiological responses to contamination. In this context, this study aimed to perform the assembly and annotation of the hepatic transcriptome of two species of seabirds: Puffinus puffinus, found stranded on the beach post mortem, and Larus dominicanus, which was found alive on the beach and died during the rehabilitation process. Both species were collected by Projeto de Monitoramento de Praias - Bacia de Santos (PMP-BS). The sequenced material was assembled, showing high quality, and annotated according to the UniProt/SwissProt database. From the functional annotation, we identified genes associated with phase I and phase II biotransformation processes, including CYP, FMO, GST, SULT, UGT genes, and the AHR receptor. Gene ontology analyses revealed a variety of biological processes, with transferase activity standing out. KEGG pathway analyses identified some common pathways between the species, such as necroptosis and Salmonella infection. These findings indicate the presence of genes that play important biological roles, even in tissues from post mortem birds. These results open new possibilities for future studies and validate the use of moribund or deceased animals in certain analyses and scientific projects.81 p.| il., gráfs.porBiologia celularExpressão gênicaTranscriptomaXenobióticaToxicologia ambientalAves marinhasMonitorização ambientalBiomarcadoresExplorando a expressão gênica na biotransformação de aves marinhasinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisreponame:Repositório Institucional da UFSCinstname:Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)instacron:UFSCinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALPBCD0171-D.pdfPBCD0171-D.pdfapplication/pdf2932717https://repositorio.ufsc.br/bitstream/123456789/261224/-1/PBCD0171-D.pdffc89dcc2b5ca8856ab0aace97b56b0f7MD5-1123456789/2612242024-11-28 20:40:57.819oai:repositorio.ufsc.br:123456789/261224Repositório InstitucionalPUBhttp://150.162.242.35/oai/requestsandra.sobrera@ufsc.bropendoar:23732024-11-28T23:40:57Repositório Institucional da UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)false
dc.title.none.fl_str_mv Explorando a expressão gênica na biotransformação de aves marinhas
title Explorando a expressão gênica na biotransformação de aves marinhas
spellingShingle Explorando a expressão gênica na biotransformação de aves marinhas
Geraldo, Márcia Eduarda
Biologia celular
Expressão gênica
Transcriptoma
Xenobiótica
Toxicologia ambiental
Aves marinhas
Monitorização ambiental
Biomarcadores
title_short Explorando a expressão gênica na biotransformação de aves marinhas
title_full Explorando a expressão gênica na biotransformação de aves marinhas
title_fullStr Explorando a expressão gênica na biotransformação de aves marinhas
title_full_unstemmed Explorando a expressão gênica na biotransformação de aves marinhas
title_sort Explorando a expressão gênica na biotransformação de aves marinhas
author Geraldo, Márcia Eduarda
author_facet Geraldo, Márcia Eduarda
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Universidade Federal de Santa Catarina
dc.contributor.author.fl_str_mv Geraldo, Márcia Eduarda
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Silva, Guilherme de Toledo e
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Bainy, Afonso Celso Dias
contributor_str_mv Silva, Guilherme de Toledo e
Bainy, Afonso Celso Dias
dc.subject.classification.none.fl_str_mv Biologia celular
Expressão gênica
Transcriptoma
Xenobiótica
Toxicologia ambiental
Aves marinhas
Monitorização ambiental
Biomarcadores
topic Biologia celular
Expressão gênica
Transcriptoma
Xenobiótica
Toxicologia ambiental
Aves marinhas
Monitorização ambiental
Biomarcadores
description Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e do Desenvolvimento, Florianópolis, 2024.
publishDate 2024
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2024-11-28T23:40:57Z
dc.date.available.fl_str_mv 2024-11-28T23:40:57Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2024
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/261224
dc.identifier.other.none.fl_str_mv 388843
identifier_str_mv 388843
url https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/261224
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 81 p.| il., gráfs.
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFSC
instname:Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
instacron:UFSC
instname_str Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
instacron_str UFSC
institution UFSC
reponame_str Repositório Institucional da UFSC
collection Repositório Institucional da UFSC
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufsc.br/bitstream/123456789/261224/-1/PBCD0171-D.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv fc89dcc2b5ca8856ab0aace97b56b0f7
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
repository.mail.fl_str_mv sandra.sobrera@ufsc.br
_version_ 1851759214159986688

Registros relacionados