Modelagem computacional de redes genéticas regulatórias

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2016
Autor(a) principal: Gupta, Shantanu
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
dARK ID: ark:/26339/001300000qjq3
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Santa Maria
BR
Física
UFSM
Programa de Pós-Graduação em Física
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://repositorio.ufsm.br/handle/1/9263
Resumo: In biology, regulatory networks are sets of macromolecules, mostly proteins and RNAs that interact to execute task. The main players in regulatory networks are DNAbinding proteins, also called transcription factors as they modulate the first step in gene expression. A gene regulatory network (GRN) is a set of genes or proteins that interact with each other to control a specific cell function. Gene regulatory networks are important in development, differentiation and to respond to environmental cues. Gene regulatory networks (GRNs) are the on-off switches of a cell operating at the gene and/or protein level. The modeling methods can be broadly categorized into continuous and discrete. In this work , we dedicate attention to discrete models on cell senescence models for Astrocyte [35], the modelling of drug synergies to control gastric cancer [38], and we also wrote a paper about Discrete and Continuous Model, advantage or disadvantage of these models and a list of available softwares for using these kind of approaches.
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spelling Modelagem computacional de redes genéticas regulatóriasComputational modelling of gene regulatory networksRede regulatóriaRedes regulatória de genesExpressão gênicaAstrócitoSinergia de drogaRegulatory networksGene regulatory networkGene expressionAstrocyteDrug synergiesCNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::FISICAIn biology, regulatory networks are sets of macromolecules, mostly proteins and RNAs that interact to execute task. The main players in regulatory networks are DNAbinding proteins, also called transcription factors as they modulate the first step in gene expression. A gene regulatory network (GRN) is a set of genes or proteins that interact with each other to control a specific cell function. Gene regulatory networks are important in development, differentiation and to respond to environmental cues. Gene regulatory networks (GRNs) are the on-off switches of a cell operating at the gene and/or protein level. The modeling methods can be broadly categorized into continuous and discrete. In this work , we dedicate attention to discrete models on cell senescence models for Astrocyte [35], the modelling of drug synergies to control gastric cancer [38], and we also wrote a paper about Discrete and Continuous Model, advantage or disadvantage of these models and a list of available softwares for using these kind of approaches.Em biologia, redes regulatórias são conjuntos de macromoléculas, principalmente proteínas e RNAs que interagem para executar uma tarefa. As proteínas de ligação de DNA, também chamadas de fatores de transcrição, são as principais executoras nas redes regulatórias, visto que modulam o primeiro passo na expressão gênica. Uma rede genética regulatória (RRG) é um conjunto de genes ou proteínas que interagem uns com os outros para controlar uma função celular específica. Redes regulatórias são importantes no desenvolvimento, diferenciação e para responder aos sinais ambientais. Elas são os botões de liga/desliga de uma célula operando no nível do gene e/ou proteína. Seus métodos de modelagem podem ser geralmente classificados em contínuos e discretos. Neste trabalho, dedicamos atenção aos modelos discretos em senescência celular para astrócitos [35], a modelagem de sinergias de drogas para controle do câncer gástrico [38] e também escrevemos um artigo sobre Modelos Discretos e Contínuos, vantagens e desvantagens desses modelos e listagem dos softwares disponíveis para uso nesse tipo de abordagem.Universidade Federal de Santa MariaBRFísicaUFSMPrograma de Pós-Graduação em FísicaMombach, Jose Carlos Merinohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4784663P5Acevedo, Otávio Costahttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4796988J8Fagan, Solange Binottohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4700282T5Gupta, Shantanu2017-05-102017-05-102016-09-30info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfapplication/pdfGUPTA, Shantanu. Computational modelling of gene regulatory networks. 2016. 58 f. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Federal de Santa Maria, Santa Maria, 2016.http://repositorio.ufsm.br/handle/1/9263ark:/26339/001300000qjq3porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Manancial - Repositório Digital da UFSMinstname:Universidade Federal de Santa Maria (UFSM)instacron:UFSM2017-07-25T14:52:26Zoai:repositorio.ufsm.br:1/9263Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://repositorio.ufsm.br/PUBhttps://repositorio.ufsm.br/oai/requestatendimento.sib@ufsm.br||tedebc@gmail.com||manancial@ufsm.bropendoar:2017-07-25T14:52:26Manancial - Repositório Digital da UFSM - Universidade Federal de Santa Maria (UFSM)false
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