Análise por sequenciamento paralelo maciço da resistência aos antirretrovirais em pacientes infectados pelo HIV-1 em terapia de resgate

• Ano de defesa: 2017
• Autor(a) principal: Castro, Daniela Funayama de [UNIFESP]
• Orientador(a): Komninakis, Shirley Vasconcelos [UNIFESP]
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
• Palavras-chave em Português: HIV; Sequenciamento; Mutações; Antirretrovirais
• Palavras-chave em Inglês: HIV; Sequencing; Mutations; Anti-retroviral agents
• Link de acesso: https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=5018763; http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/50711

A Terapia Antirretroviral (TARV) melhorou a qualidade e a expectativa de vida dos indivíduos infectados pelo HIV-1, reduzindo tanto a mortalidade quanto a morbidade. Porém, junto com a TARV houve a emergência de populações virais resistentes selecionadas pela pressão seletiva dos medicamentos. Essas populações virais podem levar o paciente à falha virológica. Embora as taxas de sucesso da TARV sejam elevadas, pacientes em falha virológica normalmente necessitam de alterações em seus esquemas antirretrovirais, sendo este tratamento denominado “terapia de resgate”. Objetivos: 1- Analisar mutações de resistência em amostras de pacientes em falha à TARV e em uso dos antirretrovirais de resgate: Darunavir, Etravirina e/ou Raltegravir; 2- Comparar o perfil mutacional obtido pelo Sequenciamento Paralelo Maciço com o identificado pelo sequenciamento convencional - método de Sanger. Metodologia: Foram selecionadas 28 amostras com resultados de genotipagem do HIV com falha virológica aos medicamentos antirretrovirais entre março de 2014 e maio de 2015. As amostras selecionadas foram de pacientes com falha à TARV e em uso de um ou mais antirretroviral de resgate deste estudo. Para a análise das amostras foi feito o Sequenciamento Paralelo Maciço. Resultados: A mutação mais prevalente entre todas as analisadas foi a I84V na protease (39,1%). Entre as mutações que reduzem a suscetibilidade ao Darunavir, depois da I84V, a mais frequente foi a L33F, representando 26%. Nas mutações que conferem redução de suscetibilidade à Etravirina, foram identificadas as mutações K101P, Y181I e Y181V, representando uma frequência de 4,3% cada uma delas. Com relação ao Raltegravir foi observada uma frequência acima de 21% da mutação N155H, a qual confere uma importante redução na suscetibilidade a este medicamento. Também foram identificadas mutações com prevalências minoritárias e as TAMs M41L, D67N, K70R, L210W, T215F, T215Y e K219Q. Conclusão: Atualmente as mutações de resistência minoritárias não são identificadas pelo método empregado na prática clínica, como o sequenciamento populacional (método de Sanger), cujo limite de detecção é superior a 20-30%. O Sequenciamento Paralelo Maciço possibilita identificar mutações com frequência de até 1%. A análise de mutações minoritárias poderia, em algumas situações, auxiliar na escolha de um antirretroviral mais adequado.