Estudo das acetilações da histona H4 em Trypanosoma cruzi
| Ano de defesa: | 2015 |
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| Tipo de documento: | Tese |
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| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
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Não Informado pela instituição
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Resumo: | As histonas apresentam uma série de modificações pós-traducionais tais como acetilações, metilações, fosforizações, ADP-ribosilações e ubiquitinações, que modulam o acesso destes fatores regulando os processos de replicação, reparo e recombinação do DNA e a transcrição de mRNA. As histonas são conservadas na maioria dos eucariotos. Entretanto, os tripanosomatídeos, que englobam protozoários parasitas que divergiram muito cedo durante a evolução, tem histonas muito distintas, diferindo em sequência, carga e/ou tamanho quando comparadas com seus homólogos eucariotos. Além disso, os tripanosomatídeos apresentam mecanismos peculiares do controle da expressão gênica. Em nosso laboratório verificamos que a histona 4 pode estar acetilada em três distintas lisinas (K4, K10 e K14) e obtivemos anticorpos que reconhecem especificamente cada uma destas modificações. Resultados ainda não publicados do nosso grupo revelam que as acetilações em K10 e K14 variam durante o ciclo celular e em estados em que há reparo de DNA. Neste projeto, temos como objetivo entender o papel dessas modificações, principalmente em K10 e K14 em Trypanosoma cruzi. Para isso pretendemos: 1) analisar o efeito de inibidores de deacetilase, 2) alterar a suscetibilidade da histona H4 expressando esta proteína modificada no próprio parasita, 3) avaliar o efeito na acetilação da super-expressão e de nocaute de proteínas envolvidas em reparo de DNA, 4) identificar acetilases e deacilases diretamente envolvidas nestas modificações, e 5) gerar linhagens que super-expressem ou tenham a expressão diminuída para estas acetilases. Em conjunto, esperamos entender a relação entre as acetilações da histona H4 e os processos de replicação, transcrição e reparo de DNA em Trypanosoma. |
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http://lattes.cnpq.br/3034565226116594Ramos, Thiago Cesar Prata [UNIFESP]ttp://lattes.cnpq.br/3701068158015591Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)Schenkman, Sergio [UNIFESP]São Paulo2018-07-30T11:45:33Z2018-07-30T11:45:33Z2015-05-27As histonas apresentam uma série de modificações pós-traducionais tais como acetilações, metilações, fosforizações, ADP-ribosilações e ubiquitinações, que modulam o acesso destes fatores regulando os processos de replicação, reparo e recombinação do DNA e a transcrição de mRNA. As histonas são conservadas na maioria dos eucariotos. Entretanto, os tripanosomatídeos, que englobam protozoários parasitas que divergiram muito cedo durante a evolução, tem histonas muito distintas, diferindo em sequência, carga e/ou tamanho quando comparadas com seus homólogos eucariotos. Além disso, os tripanosomatídeos apresentam mecanismos peculiares do controle da expressão gênica. Em nosso laboratório verificamos que a histona 4 pode estar acetilada em três distintas lisinas (K4, K10 e K14) e obtivemos anticorpos que reconhecem especificamente cada uma destas modificações. Resultados ainda não publicados do nosso grupo revelam que as acetilações em K10 e K14 variam durante o ciclo celular e em estados em que há reparo de DNA. Neste projeto, temos como objetivo entender o papel dessas modificações, principalmente em K10 e K14 em Trypanosoma cruzi. Para isso pretendemos: 1) analisar o efeito de inibidores de deacetilase, 2) alterar a suscetibilidade da histona H4 expressando esta proteína modificada no próprio parasita, 3) avaliar o efeito na acetilação da super-expressão e de nocaute de proteínas envolvidas em reparo de DNA, 4) identificar acetilases e deacilases diretamente envolvidas nestas modificações, e 5) gerar linhagens que super-expressem ou tenham a expressão diminuída para estas acetilases. Em conjunto, esperamos entender a relação entre as acetilações da histona H4 e os processos de replicação, transcrição e reparo de DNA em Trypanosoma. Histones have a series of post-translational modifications such as acetylation, methylation, fosforizações, ADP-ribosilações and ubiquitinações, that modulate access of these factors regulating replication processes, repair and recombination of DNA and transcription of mRNA. Histones are conserved in most eukaryotes. However, trypanosoma, which include protozoan parasites that early diverged during evolution, have very different histones, differing in sequence, charge and / or size when compared to their counterparts in eukaryotes. In addition, trypanosomatides have specific mechanisms of control of gene expression. In our laboratory we found that the acetylated histone 4 can be in three different lysines (K4, K10 and K14) and obtained antibodies that specifically recognize each of these modifications. Unpublished results from our group show that acetylation at K10 and K14 vary during the cell cycle and in states where there is DNA repair. In this project, we aim to understand the role of these changes, especially in K10 and K14 in Trypanosoma cruzi. For this we plan to: 1) analyze the effect of deacetylase inhibitors, 2) change the susceptibility of histone H4 expressing this modified protein in the parasite itself, 3) to evaluate the effect on the over-expression of acetylation and knockout of proteins involved in repair DNA, 4) identify acetylases and deacilases directly involved in these changes, and 5) generate lines that over-express or have decreased expression for these acetylases. Together, we hope to understand the relationship between acetylation of histone H4 and replication processes, DNA repair and transcription Trypanosoma.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)RAMOS, Thiago Cesar Prata. Estudo das acetilações da histona H4 em Trypanosoma cruzi. 2015. 108 f. Tese (Doutorado em Biologia Estrutural e Funcional) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, 2015.http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/48000https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=3585503ark:/48912/0013000025hs9porUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)info:eu-repo/semantics/openAccessTrypanosoma cruziHistonaCiclo celularAcetilaçãoDano de DNAHistoneCell cycleAcetylationDNA damageEstudo das acetilações da histona H4 em Trypanosoma cruziStudy of acetylation of histone H4 in Trypanosoma cruziinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionreponame:Repositório Institucional da UNIFESPinstname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)instacron:UNIFESPSão Paulo, Escola Paulista de Medicina (EPM)Biologia Estrutural e FuncionalCiências biológicasBiologia geralORIGINALTese_Thiago Cesar Prata Ramos.pdfapplication/pdf5713753https://repositorio.unifesp.br/bitstreams/5495dc28-e4f2-402f-aca3-2374fd993934/download6a9e997e47f864b49f3836a3e4356cf7MD5111600/480002025-06-06 11:24:21.492oai:repositorio.unifesp.br:11600/48000https://repositorio.unifesp.brRepositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.unifesp.br/oai/requestbiblioteca.csp@unifesp.bropendoar:34652025-06-06T11:24:21Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)false |
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