Perfil proteômico de podócitos editados geneticamente pela tecnologia CRISPR/Cas9 expressando características fenotípicas da doença de Fabry
| Ano de defesa: | 2022 |
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| Tipo de documento: | Tese |
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| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de São Paulo
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| Link de acesso: | https://repositorio.unifesp.br/handle/11600/65653 |
Resumo: | Introdução: Lesão dos podócitos e subsequente nefropatia crônica progressiva são características proeminentes da Doença de Fabry (DF), desordem de depósito lisossômico com padrão de herança ligada ao X provocada por mutações do gene GLA levando à atividade insuficiente da enzima α-GAL (α-galactosidase A). Embora as consequências clínicas tardias da nefropatia da DF sejam bem conhecidas, os eventos moleculares que deflagram a lesão podocitária carecem de estudos. O objetivo do presente estudo foi investigar a expressão diferencial de proteínas em podócitos humanos imortalizados com características fenotípicas da DF obtidas pela edição prévia do gene GLA através da tecnologia CRISPR/Cas9. Métodos: Os podócitos foram avaliados comparativamente: (i) quanto ao padrão proteico e processos biológicos alterados, através da abordagem proteômica e gene ontology (GO), (ii) quanto às vias de sinalização afetadas, por protocolo de western blot (WB) e RT-PCR e (iii) quanto à indução de apoptose, por meio de microscopia de fluorescência utilizando o marcador iodeto de propídio (IP). Resultados: A proteômica exploratória mostrou que as proteínas UCHL1 (<1,42x), HSP60 (<1,43x) e α-enolase1 (<1,61x) apresentavam significativa menor abundância nos podócitos geneticamente modificados em relação aos controles. A avaliação funcional por GO revelou que as proteínas alteradas encontram-se envolvidas nos processos biológicos seguintes: regulação da autofagia, apoptose e resposta ao VEGF. A análise comparativa por WB mostrou que os podócitos editados apresentavam significativa maior expressão das seguintes proteínas: (1) LC3B (>1,4x) e p62 (>1,7x), biomarcadores da autofagia, revelando inibição do fluxo autofágico. (2) TGF- (>1,5x), VEGF (>1,5x) e Vimentina (>2,3x), marcadores das vias pró-fibróticas, resposta vascular e transição epitélio mesenquimal, respectivamente; (3) PI3K 110 (>2,5x) e PI3K 110 (>1,45x), vias associadas com hipertrofia e apoptose. Paralelamente, os podócitos editados, em relação ao grupo controle, apresentaram significativa menor expressão de mRNA das proteínas estruturais podocalixina (<0,5x) e CD2AP (<0,4x) e, também, maior densidade de células apoptóticas. Conclusões: O presente estudo demonstrou que a deficiência de atividade da α-GAL, após a deleção do gene GLA por edição gênica CRIPR/Cas9, induz efeitos adversos sobre os podócitos, incluindo: (1) menor abundância das proteínas: UCHL1, HSP60 e α-enolase; (2) ativação de vias de sinalização adquirindo um padrão proliferativo, pró-fibrótico, de hiperreatividade vascular e desdiferenciação celular; (3) defeitos das vias proteolíticas pela inibição simultânea do sistema ubiquitina-proteassoma e da via autofágica e (4) maior apoptose. Essas alterações representam efeitos deletérios sobre a funcionalidade e viabilidade dos podócitos, podendo estar potencialmente implicadas na patogênese da nefropatia da DF. |
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Perfil proteômico de podócitos editados geneticamente pela tecnologia CRISPR/Cas9 expressando características fenotípicas da doença de FabryPodócitoDoença de FabryCRISPR/Cas 9ProteômicaAutofagiaPodocyteFabry diseaseCRISPR/Cas9ProteomicAutophagyIntrodução: Lesão dos podócitos e subsequente nefropatia crônica progressiva são características proeminentes da Doença de Fabry (DF), desordem de depósito lisossômico com padrão de herança ligada ao X provocada por mutações do gene GLA levando à atividade insuficiente da enzima α-GAL (α-galactosidase A). Embora as consequências clínicas tardias da nefropatia da DF sejam bem conhecidas, os eventos moleculares que deflagram a lesão podocitária carecem de estudos. O objetivo do presente estudo foi investigar a expressão diferencial de proteínas em podócitos humanos imortalizados com características fenotípicas da DF obtidas pela edição prévia do gene GLA através da tecnologia CRISPR/Cas9. Métodos: Os podócitos foram avaliados comparativamente: (i) quanto ao padrão proteico e processos biológicos alterados, através da abordagem proteômica e gene ontology (GO), (ii) quanto às vias de sinalização afetadas, por protocolo de western blot (WB) e RT-PCR e (iii) quanto à indução de apoptose, por meio de microscopia de fluorescência utilizando o marcador iodeto de propídio (IP). Resultados: A proteômica exploratória mostrou que as proteínas UCHL1 (<1,42x), HSP60 (<1,43x) e α-enolase1 (<1,61x) apresentavam significativa menor abundância nos podócitos geneticamente modificados em relação aos controles. A avaliação funcional por GO revelou que as proteínas alteradas encontram-se envolvidas nos processos biológicos seguintes: regulação da autofagia, apoptose e resposta ao VEGF. A análise comparativa por WB mostrou que os podócitos editados apresentavam significativa maior expressão das seguintes proteínas: (1) LC3B (>1,4x) e p62 (>1,7x), biomarcadores da autofagia, revelando inibição do fluxo autofágico. (2) TGF- (>1,5x), VEGF (>1,5x) e Vimentina (>2,3x), marcadores das vias pró-fibróticas, resposta vascular e transição epitélio mesenquimal, respectivamente; (3) PI3K 110 (>2,5x) e PI3K 110 (>1,45x), vias associadas com hipertrofia e apoptose. Paralelamente, os podócitos editados, em relação ao grupo controle, apresentaram significativa menor expressão de mRNA das proteínas estruturais podocalixina (<0,5x) e CD2AP (<0,4x) e, também, maior densidade de células apoptóticas. Conclusões: O presente estudo demonstrou que a deficiência de atividade da α-GAL, após a deleção do gene GLA por edição gênica CRIPR/Cas9, induz efeitos adversos sobre os podócitos, incluindo: (1) menor abundância das proteínas: UCHL1, HSP60 e α-enolase; (2) ativação de vias de sinalização adquirindo um padrão proliferativo, pró-fibrótico, de hiperreatividade vascular e desdiferenciação celular; (3) defeitos das vias proteolíticas pela inibição simultânea do sistema ubiquitina-proteassoma e da via autofágica e (4) maior apoptose. Essas alterações representam efeitos deletérios sobre a funcionalidade e viabilidade dos podócitos, podendo estar potencialmente implicadas na patogênese da nefropatia da DF.Background: Podocyte damage and subsequent chronic progressive nephropathy are prominent features of Fabry disease, a lysosomal storage disorder with an X-linked pattern of inheritance caused by mutations in the GLA gene, leading to insufficient α-GAL enzyme activity. Although the late clinical manifestations of FD nephropathy are well known, the molecular events responsible for the pathogenesis need to be studied. The aim of the present work was to investigate the differential expression of proteins in immortalized human podocytes with FD phenotypic characteristics obtained with previous editing of the GLA gene using CRISPR/Cas9 technology. Methods: The podocytes were comparatively evaluated: (i) regarding the protein pattern and altered biological processes, through the proteomic approach and gene ontology (GO), (ii) regarding the affected signaling pathways, by western blotting protocol (WB) and (iii) ) regarding the induction of apoptosis, by means of fluorescence microscopy using the propidium iodide (IP) marker. Results: Proteomics results showed: UCHL1 (<1.42x), HSP60 (<1.43x) and α-enolase1 (<1.61x) proteins were significantly less abundant in genetically modified podocytes than in controls. GO functional analysis revealed that the changed proteins were involved in biological processes such as autophagy control, apoptosis and VEGF response. Comparative analysis by WB showed that edited podocytes showed significantly higher expression of the following proteins: (1) LC3 (>1.4x) and p62 (>1.7x), biomarkers of autophagy, revealing inhibition of autophagic flux. (2) TGF-β (>1.5x), VEGF (>1.5x) and Vimentin (>2.3x), markers of profibrotic pathways, vascular response and mesenchymal epithelial transition, respectively; (3) PI3K 110 (>2.5x) and PI3K 110 (>1.45x) associated with hypertrophy and apoptosis. In parallel, significantly lower mRNA expression of the structural proteins podocalyxin (<0.5x) and CD2AP (<0.4x) were detected by RT-PCR in the edited podocytes compared to the control group, in addition to a higher density of apoptotic cells. Conclusions: Our study demonstrated that α-GAL deficiency due to GLA gene editing induced changes to podocyte homeostasis including: (1) lower abundance of the proteins UCHL1, HSPD1 and α-enolase1, which are involved in important biological processes; (2) activation of signaling pathways involved in a proliferative, profibrotic and vascular hyperreactivity pattern; (3) simultaneous dysregulation of the ubiquitin-proteasome system and autophagic pathway, affecting proteolysis processes and (4) increased apoptosis. These alterations, although may represent adaptive responses of the podocyte to injury, could potentially be implicated in the pathogenesis of Fabry disease nephropathy.Universidade Federal de São PauloKirsztajn, Gianna Mastroianni [UNIFESP]Silva, Adalberto Socorro dahttp://lattes.cnpq.br/7880499442397668http://lattes.cnpq.br/5744106277657588http://lattes.cnpq.br/3325008253038327Monte Neto, Jose Tiburcio [UNIFESP]2022-09-30T13:19:09Z2022-09-30T13:19:09Z2022-09-01info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion117 f.application/pdfhttps://repositorio.unifesp.br/handle/11600/65653ark:/48912/001300002w55vporSão Pauloinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNIFESPinstname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)instacron:UNIFESP2024-08-11T23:33:06Zoai:repositorio.unifesp.br:11600/65653Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.unifesp.br/oai/requestbiblioteca.csp@unifesp.bropendoar:34652024-08-11T23:33:06Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)false |
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Introdução: Lesão dos podócitos e subsequente nefropatia crônica progressiva são características proeminentes da Doença de Fabry (DF), desordem de depósito lisossômico com padrão de herança ligada ao X provocada por mutações do gene GLA levando à atividade insuficiente da enzima α-GAL (α-galactosidase A). Embora as consequências clínicas tardias da nefropatia da DF sejam bem conhecidas, os eventos moleculares que deflagram a lesão podocitária carecem de estudos. O objetivo do presente estudo foi investigar a expressão diferencial de proteínas em podócitos humanos imortalizados com características fenotípicas da DF obtidas pela edição prévia do gene GLA através da tecnologia CRISPR/Cas9. Métodos: Os podócitos foram avaliados comparativamente: (i) quanto ao padrão proteico e processos biológicos alterados, através da abordagem proteômica e gene ontology (GO), (ii) quanto às vias de sinalização afetadas, por protocolo de western blot (WB) e RT-PCR e (iii) quanto à indução de apoptose, por meio de microscopia de fluorescência utilizando o marcador iodeto de propídio (IP). Resultados: A proteômica exploratória mostrou que as proteínas UCHL1 (<1,42x), HSP60 (<1,43x) e α-enolase1 (<1,61x) apresentavam significativa menor abundância nos podócitos geneticamente modificados em relação aos controles. A avaliação funcional por GO revelou que as proteínas alteradas encontram-se envolvidas nos processos biológicos seguintes: regulação da autofagia, apoptose e resposta ao VEGF. A análise comparativa por WB mostrou que os podócitos editados apresentavam significativa maior expressão das seguintes proteínas: (1) LC3B (>1,4x) e p62 (>1,7x), biomarcadores da autofagia, revelando inibição do fluxo autofágico. (2) TGF- (>1,5x), VEGF (>1,5x) e Vimentina (>2,3x), marcadores das vias pró-fibróticas, resposta vascular e transição epitélio mesenquimal, respectivamente; (3) PI3K 110 (>2,5x) e PI3K 110 (>1,45x), vias associadas com hipertrofia e apoptose. Paralelamente, os podócitos editados, em relação ao grupo controle, apresentaram significativa menor expressão de mRNA das proteínas estruturais podocalixina (<0,5x) e CD2AP (<0,4x) e, também, maior densidade de células apoptóticas. Conclusões: O presente estudo demonstrou que a deficiência de atividade da α-GAL, após a deleção do gene GLA por edição gênica CRIPR/Cas9, induz efeitos adversos sobre os podócitos, incluindo: (1) menor abundância das proteínas: UCHL1, HSP60 e α-enolase; (2) ativação de vias de sinalização adquirindo um padrão proliferativo, pró-fibrótico, de hiperreatividade vascular e desdiferenciação celular; (3) defeitos das vias proteolíticas pela inibição simultânea do sistema ubiquitina-proteassoma e da via autofágica e (4) maior apoptose. Essas alterações representam efeitos deletérios sobre a funcionalidade e viabilidade dos podócitos, podendo estar potencialmente implicadas na patogênese da nefropatia da DF. |
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