Avaliação da degradação de hidrocarbonetos por bactérias provenientes de compostagem

• Ano de defesa: 2016
• Autor(a) principal: Araujo e Oliveira, Aline Marcia Silva [UNIFESP]
• Orientador(a): Niero, Cristina Viana [UNIFESP]
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• dARK ID: ark:/48912/001300001fsms
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de São Paulo
• Palavras-chave em Português: Compostagem; Hidrocarbonetos; Alcanos; Gordonia; Biorremediação
• Palavras-chave em Inglês: Composting; Hydrocarbons; Alkanes; Gordonia; Bioremediation
• Link de acesso: https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=3605881; http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/46520

A compostagem é uma alternativa para transformar resíduos orgânicos em fertilizante que ocorre predominantemente pela ação de microrganismos. Assim, espera-se que habitem nas composteiras microrganismos com capacidade de degradar os mais diversos compostos. O objetivo geral deste trabalho visou isolar bactérias presentes na compostagem com capacidade de degradar hidrocarbonetos. Foram estudadas três amostras de uma composteira proveniente da Fundação Parque Zoológico de São Paulo utilizando métodos de cultivo em meio pobre em nutrientes contendo n-hexadecano como fonte única de carbono. Quarenta e quatro microrganismos foram isolados e identificados utilizando a espectrometria de massas (Maldi-TOF) ou sequenciamento de um fragmento do gene 16S rRNA. Os isolados foram identificados como pertencentes aos gêneros Acinetobacter, Pseudomonas, Stenotrophomonas, Gordonia, Elizabethkingia, Pandorea, Aquamicrobium, Bacillus, Klebsiella e Chryseobacterium. Três isolados do gênero Gordonia foram submetidos a curvas de crescimento e a ensaios de degradação com o reagente 2,6-DCPIP em hidrocarbonetos distintos como fonte única de carbono, e demonstraram capacidade de assimilar hidrocarbonetos alifáticos, sendo que um dos isolados destacou-se dos outros pelo maior crescimento nos meios. Os genomas destes três isolados foram sequenciados e a análise de bioinformática revelou a presença do sistema CYP153, um dos responsáveis pelo início da degradação de hidrocarbonetos. Experimentos de qPCR foram realizados em isolados de Gordonia da mesma espécie e por meio destes foi possível verificar que dois genes deste sistema (ferredoxina e CYP153) possuem a expressão aumentada nos dois isolados na presença de n-hexadecano e dodecano quando comparada à expressão dos mesmos na presença de glicose. Pode-se verificar, entretanto, um perfil distinto tanto na curva de crescimento quanto no qPCR entre os isolados da mesma espécie. O sistema CYP153 dos dois isolados foram clonados e expressos em E.coli BL21(DE3). A comprovação da atividade enzimática desse sistema em E.coli não pode ser confirmada. Os resultados demonstram que a compostagem estudada abriga microrganismos que podem expressar proteínas responsáveis pela degradação de hidrocarbonetos.