Avaliação da presença de resistência transmitida e/ou polimorfismos aos antirretrovirais raltegravir, darunavir e etravirina, em indivíduos infectados pelo vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1) agrupados de acordo com o tempo de infecção

• Ano de defesa: 2017
• Autor(a) principal: Arnold, Rafael [UNIFESP]
• Orientador(a): Komninakis, Shirley Vasconcelos [UNIFESP]
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• dARK ID: ark:/48912/001300002fk5q
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
• Palavras-chave em Português: Darunavir; Polimorfismos; Antirretrovirais; HIV-1; Vírus da imunodeficiência humana; Raltegravir; Etravirina
• Palavras-chave em Inglês: Polimorfismos; Antirretrovirais; HIV-1; Human immunodeficiency virus; Raltegravir; Darunavir; Etravirine
• Link de acesso: https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=5054390; http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/50704

RESUMO A infecção pelo HIV tem atingido níveis alarmantes em todo o mundo, sendo o território brasileiro o país mais afetado da América Latina. A alta taxa de recombinação do genoma viral, associada à alta frequência de polimorfismos, pressão seletiva causada pelos antirretrovirais, e transmissão de formas resistentes às drogas colocam em cheque a eficácia do tratamento, especialmente quando considerados indivíduos com diagnóstico tardio pois apresentam deterioração do sistema imune e consequentemente diminuição na qualidade e expectativa de vida. O presente estudo avaliou e diferenciou o perfil de resistência transmitida e polimorfismos aos antirretrovirais Raltegravir, Darunavir e Etravirina em indivíduos com diagnóstico tardio (n= 17) versus infecção recente (n=22) pelo HIV-1. Integrase, protease e transcriptase reversa foram amplificados por nested-PCR e sequenciados utilizando Sequenciamento de Segunda Geração através da plataforma MiSeq, Illumina. Mutações e polimorfismos com frequência inferior a 1% foram excluídos da análise. Dados clínicos do grupo de diagnóstico tardio mostraram que a danos causados no sistema imune levaram os indivíduos a desenvolver comorbidades definidoras de aids e apresentar baixos níveis de linfócitos TCD4+, ainda assim, apresentando reconstituição imune acima de 30% com a terapia adequada, apesar de ainda permanecerem com baixos níveis celulares, dificultando o tratamento e impactando negativamente o prognóstico. No grupo de indivíduos com detecção tardia duas mutações para a Etravirina foram encontradas (V106I e E138Q uma mutação para Raltegravir (T97A) e nenhuma mutação para o Darunavir. Nos indivíduos com infecção recente, nenhuma mutação de resistência para o Darunavir e Raltegravir foi encontrada, porém para a Etravirina foi possível observar a presença da mutação acessória A98G em dois indivíduos, além das mutações majoritárias K101P e V179E em três e dois indivíduos respectivamente. A mutação K103N foi encontrada em ambos os grupos e em diversos indivíduos, o que exerce grande impacto no tratamento. A diferença na diversidade viral entre os dos dois grupos bem como o número de mutações encontradas não foi estatisticamente significativa. Maior atenção dever ser dada aos inibidores de protease, que em ambos os grupos esteve expressivamente presente. Um melhor aproveitamento dos dados gerados é possível, com a sugestão do uso da técnica multiplex através do DNA barcoding, diminuindo o tempo do sequenciamento e o ônus a ele agregado.