Identificação e caracterização de genes de resistência a antimicrobianos e fatores de virulência em isolados clínicos multirresistentes de Enterococcus faecalis e Enterococcus faecium

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2022
Autor(a) principal: ROTTA, Isabela Sguilla lattes
Orientador(a): PAIVA, Aline Dias lattes
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal do Triângulo Mineiro
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Ciências Fisiológicas
Departamento: Instituto de Ciências da Saúde - ICS::Curso de Medicina
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
CRISPR.
Enterococcus.
Resistência a antibiótico.
Fatores de virulência.
Antibiotic resistance.
Virulence factors.
Área do conhecimento CNPq:
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA
Link de acesso: http://bdtd.uftm.edu.br/handle/123456789/1366
Resumo: No estudo, avaliamos a susceptibilidade antimicrobiana, a presença de fatores de virulência codificadores de genes e do sistema CRISPR, bem como a capacidade de produzir enzimas líticas entre isolados clínicos (n=44) de E. faecalis e E. faecium. Todos os isolados de enterococos apresentaram fenótipo de multirresistência. Metade dos isolados de E. faecalis exibiram alto nível de resistência a gentamicina pelo teste fenotípico, vários deles abrigando o gene aac(6')Ie-aph(2″)Ia. O gene vanA foi o mais frequente entre os isolados de E. faecium resistentes à vancomicina. Foram observadas altas prevalências dos genes de virulência esp e efaA; o gene hyl foi mais associado com E. faecium, enquanto os genes ace and efaA foram mais frequentemente detectados em E. faecalis. A atividade de caseinase foi frequentemente detectada entre os isolados. Gelatinase e DNAse foram predominantes entre E. faecalis, enquanto a capacidade hemolítica foi frequente entre os isolados de E. faecium. Vinte e nove isolados apresentaram pelo menos um sistema CRISPR. Vários isolados de E. faecalis abrigavam o gene aac(6’)-Ie-aph(2’’)-Ia e um lócus CRISPR. Os lócus CRISPR foram positivamente correlacionados com a presença dos genes efaA e gelE, e as atividades de gelatinase e DNAse, enquanto a ausência de CRISPR foi relacionada com a presença do gene hyl. Esses resultados mostram que cepas de E. faecalis e E. faecium isolados de hospital contendo genes de fatores de virulência apresentam concomitantemente lócus CRISPR e determinantes de resistência a antimicrobianos.
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Foram observadas altas prevalências dos genes de virulência esp e efaA; o gene hyl foi mais associado com E. faecium, enquanto os genes ace and efaA foram mais frequentemente detectados em E. faecalis. A atividade de caseinase foi frequentemente detectada entre os isolados. Gelatinase e DNAse foram predominantes entre E. faecalis, enquanto a capacidade hemolítica foi frequente entre os isolados de E. faecium. Vinte e nove isolados apresentaram pelo menos um sistema CRISPR. Vários isolados de E. faecalis abrigavam o gene aac(6’)-Ie-aph(2’’)-Ia e um lócus CRISPR. Os lócus CRISPR foram positivamente correlacionados com a presença dos genes efaA e gelE, e as atividades de gelatinase e DNAse, enquanto a ausência de CRISPR foi relacionada com a presença do gene hyl. Esses resultados mostram que cepas de E. faecalis e E. faecium isolados de hospital contendo genes de fatores de virulência apresentam concomitantemente lócus CRISPR e determinantes de resistência a antimicrobianos.In this study, we evaluated the antimicrobial susceptibility, the presence of gene-encoding virulence factors and CRISPR systems, as well as the ability to produce lytic enzymes among clinical E. faecalis and E. faecium isolates (n=44). All enterococci isolates showed phenotypes of multi-drug resistance. Half of the E. faecalis isolates exhibited high-level gentamicin resistance phenotype, several of them harboring the aac(6')Ie-aph(2″)Ia gene. The gene vanA was the most frequent among vancomycin-resistant E. faecium. High prevalence of the virulence genes esp and efaA were observed; hyl gene was more associated with E. faecium, while ace and efaA genes were more frequently detected in E. faecalis. Caseinase activity was frequently detected among the isolates. Gelatinase and DNAse activities predominated among E. faecalis, while hemolytic capability was frequent among E. faecium isolates. Twenty-nine isolates showed at least one CRISPR system investigated. Several E. faecalis isolates harbored the aac(6’)-Ie-aph(2’’)-Ia gene and a CRISPR loci. CRISPR loci were positively correlated to efaA and gelE genes, and gelatinase and DNAse activities, while CRISPR loci absence was related to hyl gene presence. These results show that hospital- adapted strains of E. faecalis and E. faecium harboring virulence genes show the concomitant presence of CRISPR loci and antibiotic resistance determinants.Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais - FAPEMIGporUniversidade Federal do Triângulo MineiroPrograma de Pós-Graduação em Ciências FisiológicasUFTMBrasilInstituto de Ciências da Saúde - ICS::Curso de MedicinaCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIACRISPR.Enterococcus.Resistência a antibiótico.Fatores de virulência.CRISPR.Enterococcus.Antibiotic resistance.Virulence factors.Identificação e caracterização de genes de resistência a antimicrobianos e fatores de virulência em isolados clínicos multirresistentes de Enterococcus faecalis e Enterococcus faeciumHospital-adapted strains of E. faecalis and E. faecium harboring virulence genes showthe concomitant presence of CRISPR loci and antibiotic resistance determinantsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFTMinstname:Universidade Federal do Triangulo Mineiro (UFTM)instacron:UFTMORIGINALDissert Isabela S Rotta.pdfDissert Isabela S Rotta.pdfDissert Isabela S Rottaapplication/pdf951638http://bdtd.uftm.edu.br/bitstream/123456789/1366/1/Dissert%20Isabela%20S%20Rotta.pdf33d144824d1226abf2b89f530397c49fMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://bdtd.uftm.edu.br/bitstream/123456789/1366/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXTDissert Isabela S Rotta.pdf.txtDissert Isabela S Rotta.pdf.txtExtracted texttext/plain107471http://bdtd.uftm.edu.br/bitstream/123456789/1366/3/Dissert%20Isabela%20S%20Rotta.pdf.txt92855b9ac92b03dfc8b6205ffb371674MD53THUMBNAILDissert Isabela S Rotta.pdf.jpgDissert Isabela S Rotta.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1196http://bdtd.uftm.edu.br/bitstream/123456789/1366/4/Dissert%20Isabela%20S%20Rotta.pdf.jpgb35a55ab10b060a8e7f75ba845e548fbMD54123456789/13662022-08-10 23:02:51.011oai:bdtd.uftm.edu.br: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Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://bdtd.uftm.edu.br/PUBhttp://bdtd.uftm.edu.br/oai/requestbdtd@uftm.edu.br||bdtd@uftm.edu.bropendoar:2022-08-11T02:02:51Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFTM - Universidade Federal do Triangulo Mineiro (UFTM)false
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