Modos de ligação e interação entre mediadores lipídicos das séries Ômega-3 e Ômega-6 e o receptor ativado por proliferadores de peroxissomo gama (PPARy)

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: SILVA, Fernando Freitas Siqueira lattes
Orientador(a): ABRAHÃO JUNIOR, Odonírio lattes
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal do Triângulo Mineiro
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Ciências Fisiológicas
Departamento: Instituto de Ciências da Saúde - ICS::Curso de Medicina
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://bdtd.uftm.edu.br/handle/123456789/2056
Resumo: Os Receptores Ativados por Proliferadores de Peroxissomo (PPARs) são fatores de transcrição que pertencem à superfamília dos Receptores Nucleares (NRs) e desempenham papéis fundamentais na regulação de genes envolvidos no metabolismo de lipídeos e carboidratos, regulação da resposta inflamatória e controle da diferenciação celular. Três isotipos são expressos no organismo humano, PPARα, PPARβ/δ, e PPARγ, cada um apresentando distribuição tecidual e funções distintas. Estruturalmente, os PPARs compartilham domínios em comum com a maioria dos NRs, e sua atividade transcricional depende da heterodimerização com outro NR, o Receptor Retinóide X RXR, e da ativação por moléculas agonistas, que desencadeiam alterações conformacionais essenciais para o recrutamento de proteínas co-ativadoras e a iniciação da transcrição dos genes alvos. O grande do interesse nos efeitos do PPARγ na melhora da sensibilidade à insulina e permitiu a descoberta de seu papel como agente imunomodulador e de seus ligantes naturais genuínos, os ácidos graxos e seus metabólitos oxidados, como as oxilipinas, geradas por estímulos do microambiente inflamatório. Entre esses ligantes estão ácidos graxos essenciais (AGEs), das séries n-3 e n-6, e derivados, que atuam como mediadores lipídicos (MLs), influenciando de forma significativa a resolução dos processos inflamatórios. Embora agonistas totais do PPARy, como as tiazolidinedionas (TZDs), sejam eficazes na melhora da sensibilidade à insulina, seus inúmeros efeitos adversos impulsionaram a pesquisa por agonistas parciais, geralmente ligantes naturais, como os MLs, como alternativas eficazes de ativação do PPARγ com redução dos efeitos adversos. Após uma busca sistemática no PDB foram identificados 20 complexos do PPARy com 17 diferentes MLs n-3 e n-6 ligados ao sítio de ligação do receptor. Esta revisão detalha, a partir desses cristais e de estudos experimentais e computacionais, os modos de l igação e as interações entre os resíduos de aminoácidos do sítio de ligação do PPARy e seus potenciais MLs agonistas, destacando também as mudanças conformacionais de regiões cruciais para ativação do receptor, como o loop-Ω, as folhas beta e as -hélices H3 e H12, decorrentes das interações com os diferentes ligantes. Os achados evidenciam a complexidade e a diversidade das interações dos MLs n-3 e n-6 com o PPARγ, ressaltando resíduos chave para o desenho racional de novos fármacos que mimetizam ligantes endógenos e modulam seletivamente a atividade do receptor. Além de reafirmar a importância de uma alimentação que forneça quantidades ideais de AGEs para a homeostase imune e metabólica, a compreensão aprofundada dos mecanismos de ligação e ativação do PPARy por seus ligantes endógenos naturais tem se mostrado crucial para o desenvolvimento de novos agonistas, que alcancem resultados terapêuticos eficazes e mais seguros.
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Estruturalmente, os PPARs compartilham domínios em comum com a maioria dos NRs, e sua atividade transcricional depende da heterodimerização com outro NR, o Receptor Retinóide X RXR, e da ativação por moléculas agonistas, que desencadeiam alterações conformacionais essenciais para o recrutamento de proteínas co-ativadoras e a iniciação da transcrição dos genes alvos. O grande do interesse nos efeitos do PPARγ na melhora da sensibilidade à insulina e permitiu a descoberta de seu papel como agente imunomodulador e de seus ligantes naturais genuínos, os ácidos graxos e seus metabólitos oxidados, como as oxilipinas, geradas por estímulos do microambiente inflamatório. Entre esses ligantes estão ácidos graxos essenciais (AGEs), das séries n-3 e n-6, e derivados, que atuam como mediadores lipídicos (MLs), influenciando de forma significativa a resolução dos processos inflamatórios. Embora agonistas totais do PPARy, como as tiazolidinedionas (TZDs), sejam eficazes na melhora da sensibilidade à insulina, seus inúmeros efeitos adversos impulsionaram a pesquisa por agonistas parciais, geralmente ligantes naturais, como os MLs, como alternativas eficazes de ativação do PPARγ com redução dos efeitos adversos. Após uma busca sistemática no PDB foram identificados 20 complexos do PPARy com 17 diferentes MLs n-3 e n-6 ligados ao sítio de ligação do receptor. Esta revisão detalha, a partir desses cristais e de estudos experimentais e computacionais, os modos de l igação e as interações entre os resíduos de aminoácidos do sítio de ligação do PPARy e seus potenciais MLs agonistas, destacando também as mudanças conformacionais de regiões cruciais para ativação do receptor, como o loop-Ω, as folhas beta e as -hélices H3 e H12, decorrentes das interações com os diferentes ligantes. 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Three isotypes are expressed in the human body: PPARα, PPARβ/δ and PPARγ, each with distinct tissue distribution and functions. Structurally, PPARs have domains in common with most NRs, and their transcriptional activity depends on heterodimerization with another NR, the Retinoid X Receptor RXR, and on activation by agonist molecules, which trigger conformational changes essential for the recruitment of coactivator proteins and the initiation of transcription of target genes. The great interest in the effects of PPARγ in improving insulin sensitivity has led to the discovery of its role as immunomodulator agent and of its genuine natural ligands, fatty acids and their oxidized metabolites, such as oxylipins, generated by stimuli from the inflammatory microenvironment. These ligands include the n-3 and n-6 series essential fatty acids (EFAs) and their derivatives, which act as lipid mediators (LMs), significantly influencing the resolution of inflammatory processes. Although full PPARγ agonists, such as thiazolidinediones (TZDs), are effective in improving insulin sensitivity, their considerable adverse effects boosted the search for partial agonists, usually natural ligands, such as LMs, as alternatives for PPARγ activation with reduced adverse effects. Through a systematic search on PDB, 20 PPARγ complexes were identified with 17 different n-3 and n-6 LMs bound to the receptor’s ligand binding site. Based on these crystals and on experimental and computational studies, this review details the binding modes and interactions between PPARγ ligand binding site’s amino acid residues and its potential agonist MLs, also highlighting the conformational changes of crucial regions for receptor activation, such as the Ω-loop, beta sheets and -helices H3 and H12, resulting from the interactions with different ligands. The findings made evident the complexity and diversity of the interactions of MLs n-3 and n-6 with PPARγ, highlighting key residues for the rational design of new drugs that mimic endogenous ligands and selectively modulate receptor activity. In addition to reaffirming the importance of a diet, that provides optimal amounts of EFAs for immune and metabolic homeostasis, a deeper understanding of the mechanisms of binding and activation of PPARγ by its natural endogenous ligands has proven crucial for the development of new agonists that achieve effective and safer therapeutic results.porUniversidade Federal do Triângulo MineiroPrograma de Pós-Graduação em Ciências FisiológicasUFTMBrasilInstituto de Ciências da Saúde - ICS::Curso de MedicinaCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASPPARy.Mediadores lipídicos.Ômega-3.Ômega-6.Interações receptorligante.PPARy.Lipid mediators.Omega-3.Omega-6.Ligand-receptor interactions.Modos de ligação e interação entre mediadores lipídicos das séries Ômega-3 e Ômega-6 e o receptor ativado por proliferadores de peroxissomo gama (PPARy)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFTMinstname:Universidade Federal do Triangulo Mineiro (UFTM)instacron:UFTMORIGINALTese Fernando F S Silva.pdfTese Fernando F S Silva.pdfTese Fernando F S Silvaapplication/pdf2983233http://bdtd.uftm.edu.br/bitstream/123456789/2056/1/Tese%20Fernando%20F%20S%20Silva.pdf5ec440027b50d842877668db0f7d2619MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://bdtd.uftm.edu.br/bitstream/123456789/2056/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXTTese Fernando F S Silva.pdf.txtTese Fernando F S Silva.pdf.txtExtracted texttext/plain172974http://bdtd.uftm.edu.br/bitstream/123456789/2056/3/Tese%20Fernando%20F%20S%20Silva.pdf.txt982ab6b38257ba2a03ddb72b59eaa6c3MD53THUMBNAILTese Fernando F S Silva.pdf.jpgTese Fernando F S Silva.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1217http://bdtd.uftm.edu.br/bitstream/123456789/2056/4/Tese%20Fernando%20F%20S%20Silva.pdf.jpg935176e1d35e70a740752aa7f5c7ff78MD54123456789/20562025-11-28 00:02:40.017oai:bdtd.uftm.edu.br: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Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://bdtd.uftm.edu.br/PUBhttp://bdtd.uftm.edu.br/oai/requestbdtd@uftm.edu.br||bdtd@uftm.edu.bropendoar:2025-11-28T02:02:40Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFTM - Universidade Federal do Triangulo Mineiro (UFTM)false
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