Uso de código de barras de DNA para estudo da fauna de flebotomíneos (diptera, psychodidae) no estado de Tocantins, Brasil

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2023
Autor(a) principal: Soares, Cleia de Sousa Rodrigues
Orientador(a): Shimabukuro, Paloma Helena Fernandes
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal do Tocantins
Porto Nacional
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Ecologia de Ecótonos - PPGEE
Departamento: Não Informado pela instituição
País: BR
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://hdl.handle.net/11612/5736
Resumo: Os flebotomíneos são insetos pertencentes à ordem Diptera, família Psychodidae, subfamília Phlebotominae. Considerados vetores naturais de agentes infecciosos, como vírus, bactérias e protozoários, dentre estes Leishmania, que causam as leishmanioses no homem e em outros animais. Cerca de 1.003 espécies ou subespécies são reconhecidas, das quais aproximadamente 537 estão presentes nas Américas, sendo 277 registradas no Brasil. No estado de Tocantins (TO), até o momento foram registradas 70 espécies, e destas, 32 ocorrem no Distrito de Taquaruçu, município de Palmas. Os estudos realizados sobre a fauna de flebotomíneos e registro de novas espécies no estado de Tocantins, utilizou-se apenas identificação através de análises morfológicas. Considerando o uso de dados morfológicos por si só pode subestimar ou superestimar o número de espécies, o presente trabalho tem como objetivo realizar a identificação molecular de espécies de flebotomíneos capturadas no município de Palmas/TO, utilizando-se o fragmento parcial do gene citocromo c oxidase subunidade I (COI). Portanto, realizou-se coletas mensais, durante três noites consecutivas, no período de janeiro a junho, em quatro pontos: Caverna Boa Esperança, Gruta do Evilson, Chácara Serra do Carmo e Chácara do Iago, com armadilhas luminosas modelo HP. Antes do processamento dos insetos (diafanização e montagem), foi realizada a coleta e congelamento a -20°C das pernas de cada exemplar para sequenciamento e posterior identificação molecular. A identificação morfológica dos espécimes revelou 28 espécies distribuídas em 13 gêneros. Três espécies (Deanemyia samueli, Pintomyia gruta, Psathyromyia barretti), ainda não haviam sido registradas no estado de Tocantins, desta forma, a fauna flebotomínica do município e do estado fica composta, até o momento, por 35 e 73 espécies, respectivamente. Edentomyia sp. e Lutzomyia (Lutzomyia) sp., provavelmente são espécies ainda não descritas, e novos estudos são necessários para verificar sua real identidade taxonômica. O uso do DNA barcode mostrou-se eficiente para identificação das espécies de flebotomíneos do estado de Tocantins, e revelou a existência de diversidade críptica em três espécies, Nyssomyia whitmani, Psychodopygus sp. série Chagasi e Psathyromyia aragaoi, porém a quantidade de amostras sequenciadas é um fator que influencia a eficácia da técnica do DNA Barcode. Dessa forma, o presente estudo encontrou dois obstáculos no que diz respeito à identificação das espécies com o uso de sequências COI: o número reduzido de amostras analisadas para algumas espécies, assim como a falta de sequências depositadas no GenBank.
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No estado de Tocantins (TO), até o momento foram registradas 70 espécies, e destas, 32 ocorrem no Distrito de Taquaruçu, município de Palmas. Os estudos realizados sobre a fauna de flebotomíneos e registro de novas espécies no estado de Tocantins, utilizou-se apenas identificação através de análises morfológicas. Considerando o uso de dados morfológicos por si só pode subestimar ou superestimar o número de espécies, o presente trabalho tem como objetivo realizar a identificação molecular de espécies de flebotomíneos capturadas no município de Palmas/TO, utilizando-se o fragmento parcial do gene citocromo c oxidase subunidade I (COI). Portanto, realizou-se coletas mensais, durante três noites consecutivas, no período de janeiro a junho, em quatro pontos: Caverna Boa Esperança, Gruta do Evilson, Chácara Serra do Carmo e Chácara do Iago, com armadilhas luminosas modelo HP. Antes do processamento dos insetos (diafanização e montagem), foi realizada a coleta e congelamento a -20°C das pernas de cada exemplar para sequenciamento e posterior identificação molecular. A identificação morfológica dos espécimes revelou 28 espécies distribuídas em 13 gêneros. Três espécies (Deanemyia samueli, Pintomyia gruta, Psathyromyia barretti), ainda não haviam sido registradas no estado de Tocantins, desta forma, a fauna flebotomínica do município e do estado fica composta, até o momento, por 35 e 73 espécies, respectivamente. Edentomyia sp. e Lutzomyia (Lutzomyia) sp., provavelmente são espécies ainda não descritas, e novos estudos são necessários para verificar sua real identidade taxonômica. O uso do DNA barcode mostrou-se eficiente para identificação das espécies de flebotomíneos do estado de Tocantins, e revelou a existência de diversidade críptica em três espécies, Nyssomyia whitmani, Psychodopygus sp. série Chagasi e Psathyromyia aragaoi, porém a quantidade de amostras sequenciadas é um fator que influencia a eficácia da técnica do DNA Barcode. Dessa forma, o presente estudo encontrou dois obstáculos no que diz respeito à identificação das espécies com o uso de sequências COI: o número reduzido de amostras analisadas para algumas espécies, assim como a falta de sequências depositadas no GenBank.Sandflies are insects belonging to the order Diptera, family Psychodidae, and subfamily Phlebotominae. Considered natural vectors of infectious agents, such as viruses, bacteria and protozoa, including Leishmania, which cause leishmaniasis in humans and other animals. About 1,003 species or subspecies are recognized, of which approximately 537 are present in the Americas, 277 of which are registered in Brazil. In the state of Tocantins (TO), so far, 70 species have been recorded, and of these, 32 occur in the District of Taquaruçu, municipality of Palmas. The studies carried out on the sand fly fauna and recorded of new species in the state of Tocantins, when only identification through morphological analysis was used. Considering the use of morphological data alone can underestimate or overestimate the number of species, the present work aims to carry out the molecular identification of sand fly species captured in the municipality of Palmas/TO, using the partial fragment of the cytochrome c gene subunit I oxidase (COI). Therefore, monthly collections were carried out during three consecutive nights, from January to June, at four sites: Cave Boa Esperança, Grotto’s Evilson, and Chácara Serra do Carmo and Chácara do Iago, with HP model light traps. Before processing the insects (clearing and mounting), the legs of each specimen were collected and frozen at -20°C for sequencing and subsequent molecular identification. The morphological identification of the specimens revealed 28 species distributed in 13 genera. Three species (Deanemyia samueli, Pintomyia gruta, Psathyromyia barretti), had not yet been registered in the state of Tocantins, thus, the sand fly fauna of the municipality and the state is composed, so far, of 35 and 73 species, respectively. Edentomyia sp. and Lutzomyia (Lutzomyia) sp., are probably still undescribed species, and new studies are needed to verify their real taxonomic identity. The use of DNA barcode proved to be efficient for identifying sand fly species in the state of Tocantins, and revealed the existence of cryptic diversity in three species, Nyssomyia whitmani, Psychodopygus sp. Chagasi series and Psathyromyia aragaoi, but the number of sequenced samples is a factor that influences the efficiency of the DNA Barcode technique. Thus, the present study encountered two obstacles with regard to the identification of species using COI sequences: the reduced number of samples analyzed for some species, as well as the lack of sequences deposited in GenBank.application/pdfUniversidade Federal do TocantinsPorto NacionalPrograma de Pós-Graduação em Ecologia de Ecótonos - PPGEEBRCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASPhlebotominae; DNA Barcode; Taxonomia molecular; Caverna; Diversidade alfa; Sandflies, DNA Barcode; Molecular taxonomy; Cave; Alpha diversityUso de código de barras de DNA para estudo da fauna de flebotomíneos (diptera, psychodidae) no estado de Tocantins, Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFTinstname:Universidade Federal do Tocantins (UFT)instacron:UFTLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8508http://repositorio.uft.edu.br/bitstream/11612/5736/2/license.txt0a9e77404315487775b2e0c2b887ae47MD52ORIGINALCleia de Sousa Rodrigues Soares - Dissertação.pdfCleia de Sousa Rodrigues Soares - Dissertação.pdfapplication/pdf2639998http://repositorio.uft.edu.br/bitstream/11612/5736/1/Cleia%20de%20Sousa%20Rodrigues%20Soares%20-%20Disserta%c3%a7%c3%a3o.pdf1d13d93aa836eb03082bc59d2118a5baMD51TEXTCleia de Sousa Rodrigues Soares - Dissertação.pdf.txtCleia de Sousa Rodrigues Soares - Dissertação.pdf.txtExtracted texttext/plain93686http://repositorio.uft.edu.br/bitstream/11612/5736/3/Cleia%20de%20Sousa%20Rodrigues%20Soares%20-%20Disserta%c3%a7%c3%a3o.pdf.txtdc260143b4ddd841aaa1c03a3df3505eMD53THUMBNAILCleia de Sousa Rodrigues Soares - Dissertação.pdf.jpgCleia de Sousa Rodrigues Soares - Dissertação.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1280http://repositorio.uft.edu.br/bitstream/11612/5736/4/Cleia%20de%20Sousa%20Rodrigues%20Soares%20-%20Disserta%c3%a7%c3%a3o.pdf.jpg036a52a8de76370397b6a31e2d43ba02MD5411612/57362023-08-29 03:02:55.714oai:repositorio.uft.edu.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.uft.edu.br/oai/requestcoordbiblio@uft.edu.br||biblioarraias@uft.edu.br || bibliogpi@uft.edu.br || bibliomira@uft.edu.br || bibliopalmas@uft.edu.br || biblioporto@uft.edu.br || biblioarag@uft.edu.br || dirbib@ufnt.edu.br || bibliocca@uft.edu.br || bibliotoc@uft.edu.bropendoar:2023-08-29T06:02:55Repositório Institucional da UFT - Universidade Federal do Tocantins (UFT)false
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