Engenharia de software aplicada a softwares biológicos: um estudo de caso em documentação de software bioinformático
| Ano de defesa: | 2021 |
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| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de Uberlândia
Brasil Programa de Pós-graduação em Biotecnologia |
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/34046 http://doi.org/10.14393/ufu.di.2022.19 |
Resumo: | Software Engineering is the knowledge field that deals with the construction of computacional systems. One of its disciplines deals with system documentation, essential for the proper development of the project, the correct understanding of the software’s operation, its maintenance and user orientation. Biological software are computacional systems used in various activities related to biology and biotechnology, mainly used by researchers in biological areas. Efficiently documenting biological software can ease its use by interdisciplinary teams. It is assumed that Software Engineering, combined with an exploratory effort over the source code, may serve as support for developing bioinformatics software documentation. This work proposes to identify the most useful artifacts for the user of biological software, through a case study in which the documentation of a bioinformatics system aimed at identifying microRNAs in a given genome was carried out. The documents generated will help end users in using the analyzed system, and will provide means to other researchers who wish or need to perform its maintenance. |
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Engenharia de software aplicada a softwares biológicos: um estudo de caso em documentação de software bioinformáticoSoftware engineering applied to biological software: a case study in bioinformatics software documentationengenharia de softwareprojetos de softwaredocumentação de softwaresoftwares biológicosbioinformáticasoftware engineeringsoftware projectsoftware documentationbiological softwarebioinformaticsbiotecnologiabiotechnologyCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASCNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAOBiotecnologiaEngenharia de softwareBioinformáticaSoftware Engineering is the knowledge field that deals with the construction of computacional systems. One of its disciplines deals with system documentation, essential for the proper development of the project, the correct understanding of the software’s operation, its maintenance and user orientation. Biological software are computacional systems used in various activities related to biology and biotechnology, mainly used by researchers in biological areas. Efficiently documenting biological software can ease its use by interdisciplinary teams. It is assumed that Software Engineering, combined with an exploratory effort over the source code, may serve as support for developing bioinformatics software documentation. This work proposes to identify the most useful artifacts for the user of biological software, through a case study in which the documentation of a bioinformatics system aimed at identifying microRNAs in a given genome was carried out. The documents generated will help end users in using the analyzed system, and will provide means to other researchers who wish or need to perform its maintenance.Dissertação (Mestrado)A Engenharia de Software é a área do conhecimento que trata da construção de sistemas computacionais. Uma de suas disciplinas trata da documentação do sistema, imprescindível para o bom desenvolvimento do projeto, a correta compreensão do funcionamento do software, sua manutenção e orientação ao usuário. Softwares biológicos são sistemas computacionais empregados em diversas atividades ligadas à biologia e biotecnologia, utilizados principalmente por pesquisadores das áreas biológicas. Documentar eficientemente um software biológico pode facilitar sua utilização por equipes interdisciplinares. Estima-se que a Engenharia de Software, aliada a um trabalho de exploração do código-fonte, pode ser utilizada como suporte para a documentação de um software de bioinformática. Este trabalho propõe identificar os artefatos mais úteis para o usuário de softwares biológicos, por meio de um estudo de caso em que se realizou a documentação de um sistema bioinformático voltado à identificação de microRNAs em um dado genoma. Os documentos gerados auxiliarão os usuários finais na utilização do sistema analisado, e fornecerão subsídios a outros pesquisadores que desejem ou precisem realizar sua manutenção.2024-01-10Universidade Federal de UberlândiaBrasilPrograma de Pós-graduação em BiotecnologiaAmaral, Laurence Rodrigues dohttp://lattes.cnpq.br/6978567037098928Bertarini, Pedro Luiz Limahttp://lattes.cnpq.br/6101890440707894Freitas, Joslaine Cristina Jeske dehttp://lattes.cnpq.br/2394348610492496Marques, Vinicius Soares Silva2022-02-04T16:54:28Z2022-02-04T16:54:28Z2021-12-20info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfMARQUES, Vinicius Soares Silva. Engenharia de software aplicada a softwares biológicos: um estudo de caso em documentação de software bioinformático. 2021. 44 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal de Uberlândia, Patos de Minas, 2021. DOI http://doi.org/10.14393/ufu.di.2022.19.https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/34046http://doi.org/10.14393/ufu.di.2022.19porhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFUinstname:Universidade Federal de Uberlândia (UFU)instacron:UFU2024-08-05T12:56:22Zoai:repositorio.ufu.br:123456789/34046Repositório InstitucionalONGhttp://repositorio.ufu.br/oai/requestdiinf@dirbi.ufu.bropendoar:2024-08-05T12:56:22Repositório Institucional da UFU - Universidade Federal de Uberlândia (UFU)false |
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