Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris)

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2006
Autor(a) principal: Ribeiro, Ronney Adriano
Orientador(a): Queiroz, Marisa Vieira de lattes
Banca de defesa: Bazzolli, Denise Mara Soares lattes, Ribon, Andréa de Oliveira Barros lattes
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Viçosa
Programa de Pós-Graduação: Mestrado em Microbiologia Agrícola
Departamento: Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse
País: BR
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://locus.ufv.br/handle/123456789/5379
Resumo: The gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, nit1, was isolated and characterized. Its nucleotide sequence and regulation in response to different nitrogen sources were analyzed. The gene nit1 has 2,787 base pairs (bp) bearing a single 696 bp intron starting at nucleotide 1,808. This intron is localized in a conserved region when compared to introns present in nitrate reductase genes of other fungi. Hovever, its similarity with them is restricted to the consensus splicing regions. Four TATC sequences, possibly related to binding of the general positive regulatory protein NIT2, were found in the upstream regulatory region of nit1, as well as other consensus sequences such as TATA and GC boxes. A putative binding site for NIT4, a specific regulatory protein, was also found in the 340 position. There is a putative mRNA polyadenilation site at the downstream 2,826 position. The protein translated from nit1 comprises 905 amino acid residues with a molecular mass of 101,1 kDa and presents high degree of identity with the cognate proteins in Metarhizium anisopliae (62,43 %), Magnaporte grisea (62,27%), Verticillium fungicola (60,15%), Botryotinia fuckchiana (58,30%), and Aspergillus fumigatus (51,93%). In mycelia cultivated in the presence of nitrate, nit1 was expressed after 15 min. Transcription was repressed in mycelia grown in medium containing either ammonium, urea, or glutamine. On glutamine, the level of transcription was apparently basal.
id UFV_8aaeb46fe7d9145af092e4f1a0bb27cb
oai_identifier_str oai:locus.ufv.br:123456789/5379
network_acronym_str UFV
network_name_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
repository_id_str
spelling Ribeiro, Ronney Adrianohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4702817J2Araujo, Elza Fernandes dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783675E2Moraes, Célia Alencar dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781007D6Queiroz, Marisa Vieira dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4785812Z5Bazzolli, Denise Mara Soareshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4761710D6Ribon, Andréa de Oliveira Barroshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4727026E62015-03-26T13:52:01Z2006-11-082015-03-26T13:52:01Z2006-08-28RIBEIRO, Ronney Adriano. Cloning and characterization of the gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, a bean (Phaseolus vulgaris) pathogen. 2006. 57 f. Dissertação (Mestrado em Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2006.http://locus.ufv.br/handle/123456789/5379The gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, nit1, was isolated and characterized. Its nucleotide sequence and regulation in response to different nitrogen sources were analyzed. The gene nit1 has 2,787 base pairs (bp) bearing a single 696 bp intron starting at nucleotide 1,808. This intron is localized in a conserved region when compared to introns present in nitrate reductase genes of other fungi. Hovever, its similarity with them is restricted to the consensus splicing regions. Four TATC sequences, possibly related to binding of the general positive regulatory protein NIT2, were found in the upstream regulatory region of nit1, as well as other consensus sequences such as TATA and GC boxes. A putative binding site for NIT4, a specific regulatory protein, was also found in the 340 position. There is a putative mRNA polyadenilation site at the downstream 2,826 position. The protein translated from nit1 comprises 905 amino acid residues with a molecular mass of 101,1 kDa and presents high degree of identity with the cognate proteins in Metarhizium anisopliae (62,43 %), Magnaporte grisea (62,27%), Verticillium fungicola (60,15%), Botryotinia fuckchiana (58,30%), and Aspergillus fumigatus (51,93%). In mycelia cultivated in the presence of nitrate, nit1 was expressed after 15 min. Transcription was repressed in mycelia grown in medium containing either ammonium, urea, or glutamine. On glutamine, the level of transcription was apparently basal.O gene que codifica para a nitrato redutase de Colletotrichum lindemuthianum, nit1, foi isolado e caracterizado. Sua seqüência e regulação em resposta a diferentes fontes de nitrogênio foram analisadas. A análise da seqüência do gene nit1 indicou que ele possui 2.787 pb com um único íntron de 69 pb iniciando no nucleotídeo 1.808. Este íntron está localizado numa região conservada de íntrons presentes no gene da nitrato redutase em outros fungos. No entanto, a identidade entre eles se restringe às regiões consenso responsáveis pela excisão. A região reguladora do gene nit1, além das seqüências consenso gerais, apresenta quatro seqüências TATC responsáveis pela ligação da proteína reguladora geral positiva NIT2. Um possível sítio da ligação da proteína reguladora da via específica, NIT4, também foi localizado nessa região, na posição -340. Além disso, na região 3 não traduzida foi encontrado um possível sítio para poliadenilação do mRNA localizado na posição 2.826. A proteína deduzida do gene nit1 gerou uma seqüência de 905 aminoácidos com massa molecular de 101,1 kDa e apresentou alta identidade com as proteínas correspondentes em Metarhizium anisopliae (62,43%), Magnaporthe grisea (62,27%), Verticillium fungicola (60,15%), Botryotinia fuckeliana (58,30%) e Aspergillus fumigatus (51,93%). A expressão do gene nit1 em C. lindemuthianum foi avaliada em micélios cultivados em diferentes fontes de nitrogênio, em condições de ativação e repressão. O gene foi expresso na presença de nitrato a partir de 15 minutos após entrar em contato com esta fonte de nitrogênio, tendo atingido a expressão máxima com 360 minutos. A transcrição foi reprimida em micélios cultivados em amônio, uréia e glutamina. Em glutamina, após 60 minutos de repressão, não foi possível detectar a presença de transcritos desse gene.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológicoapplication/pdfporUniversidade Federal de ViçosaMestrado em Microbiologia AgrícolaUFVBRAssociações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesseColletotrichum lindemuthianumNitrato redutaseGene nit1Colletotrichum lindemuthianumNitrate reductaseGene nit1CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOSClonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris)Cloning and characterization of the gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, a bean (Phaseolus vulgaris) pathogeninfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdfapplication/pdf297814https://locus2.dti.ufv.br:4000/bitstreams/513467d1-664a-4afb-861b-a5c041a4ffcb/download8b9399570272dbe1ec41db69f73626b6MD51trueAnonymousREADTEXTtexto completo.pdf.txttexto completo.pdf.txtExtracted texttext/plain95637https://locus2.dti.ufv.br:4000/bitstreams/07cc790e-dd9a-4547-b08d-df989964b88d/download03a533e0beae24e361054b896cff8024MD52falseAnonymousREADTHUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3759https://locus2.dti.ufv.br:4000/bitstreams/317aca80-31ea-4ab9-87cf-7d7e920f788e/download4fb56a62d680351d0346b8d3e7b4743dMD53falseAnonymousREAD123456789/53792016-04-10 23:18:39.289open.accessoai:locus.ufv.br:123456789/5379https://locus2.dti.ufv.br:4000Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452016-04-11T02:18:39LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
dc.title.por.fl_str_mv Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris)
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv Cloning and characterization of the gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, a bean (Phaseolus vulgaris) pathogen
title Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris)
spellingShingle Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris)
Ribeiro, Ronney Adriano
Colletotrichum lindemuthianum
Nitrato redutase
Gene nit1
Colletotrichum lindemuthianum
Nitrate reductase
Gene nit1
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOS
title_short Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris)
title_full Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris)
title_fullStr Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris)
title_full_unstemmed Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris)
title_sort Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris)
author Ribeiro, Ronney Adriano
author_facet Ribeiro, Ronney Adriano
author_role author
dc.contributor.authorLattes.por.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4702817J2
dc.contributor.author.fl_str_mv Ribeiro, Ronney Adriano
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Araujo, Elza Fernandes de
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783675E2
dc.contributor.advisor-co2.fl_str_mv Moraes, Célia Alencar de
dc.contributor.advisor-co2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781007D6
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Queiroz, Marisa Vieira de
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4785812Z5
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Bazzolli, Denise Mara Soares
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4761710D6
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Ribon, Andréa de Oliveira Barros
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4727026E6
contributor_str_mv Araujo, Elza Fernandes de
Moraes, Célia Alencar de
Queiroz, Marisa Vieira de
Bazzolli, Denise Mara Soares
Ribon, Andréa de Oliveira Barros
dc.subject.por.fl_str_mv Colletotrichum lindemuthianum
Nitrato redutase
Gene nit1
topic Colletotrichum lindemuthianum
Nitrato redutase
Gene nit1
Colletotrichum lindemuthianum
Nitrate reductase
Gene nit1
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOS
dc.subject.eng.fl_str_mv Colletotrichum lindemuthianum
Nitrate reductase
Gene nit1
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOS
description The gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, nit1, was isolated and characterized. Its nucleotide sequence and regulation in response to different nitrogen sources were analyzed. The gene nit1 has 2,787 base pairs (bp) bearing a single 696 bp intron starting at nucleotide 1,808. This intron is localized in a conserved region when compared to introns present in nitrate reductase genes of other fungi. Hovever, its similarity with them is restricted to the consensus splicing regions. Four TATC sequences, possibly related to binding of the general positive regulatory protein NIT2, were found in the upstream regulatory region of nit1, as well as other consensus sequences such as TATA and GC boxes. A putative binding site for NIT4, a specific regulatory protein, was also found in the 340 position. There is a putative mRNA polyadenilation site at the downstream 2,826 position. The protein translated from nit1 comprises 905 amino acid residues with a molecular mass of 101,1 kDa and presents high degree of identity with the cognate proteins in Metarhizium anisopliae (62,43 %), Magnaporte grisea (62,27%), Verticillium fungicola (60,15%), Botryotinia fuckchiana (58,30%), and Aspergillus fumigatus (51,93%). In mycelia cultivated in the presence of nitrate, nit1 was expressed after 15 min. Transcription was repressed in mycelia grown in medium containing either ammonium, urea, or glutamine. On glutamine, the level of transcription was apparently basal.
publishDate 2006
dc.date.available.fl_str_mv 2006-11-08
2015-03-26T13:52:01Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2006-08-28
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-03-26T13:52:01Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv RIBEIRO, Ronney Adriano. Cloning and characterization of the gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, a bean (Phaseolus vulgaris) pathogen. 2006. 57 f. Dissertação (Mestrado em Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2006.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://locus.ufv.br/handle/123456789/5379
identifier_str_mv RIBEIRO, Ronney Adriano. Cloning and characterization of the gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, a bean (Phaseolus vulgaris) pathogen. 2006. 57 f. Dissertação (Mestrado em Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2006.
url http://locus.ufv.br/handle/123456789/5379
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.publisher.program.fl_str_mv Mestrado em Microbiologia Agrícola
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFV
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.source.none.fl_str_mv reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV
instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron:UFV
instname_str Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron_str UFV
institution UFV
reponame_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
collection LOCUS Repositório Institucional da UFV
bitstream.url.fl_str_mv https://locus2.dti.ufv.br:4000/bitstreams/513467d1-664a-4afb-861b-a5c041a4ffcb/download
https://locus2.dti.ufv.br:4000/bitstreams/07cc790e-dd9a-4547-b08d-df989964b88d/download
https://locus2.dti.ufv.br:4000/bitstreams/317aca80-31ea-4ab9-87cf-7d7e920f788e/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 8b9399570272dbe1ec41db69f73626b6
03a533e0beae24e361054b896cff8024
4fb56a62d680351d0346b8d3e7b4743d
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)
repository.mail.fl_str_mv fabiojreis@ufv.br
_version_ 1876497395352600576