Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris)
| Ano de defesa: | 2006 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | , |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de Viçosa
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Mestrado em Microbiologia Agrícola
|
| Departamento: |
Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse
|
| País: |
BR
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Palavras-chave em Inglês: | |
| Área do conhecimento CNPq: | |
| Link de acesso: | http://locus.ufv.br/handle/123456789/5379 |
Resumo: | The gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, nit1, was isolated and characterized. Its nucleotide sequence and regulation in response to different nitrogen sources were analyzed. The gene nit1 has 2,787 base pairs (bp) bearing a single 696 bp intron starting at nucleotide 1,808. This intron is localized in a conserved region when compared to introns present in nitrate reductase genes of other fungi. Hovever, its similarity with them is restricted to the consensus splicing regions. Four TATC sequences, possibly related to binding of the general positive regulatory protein NIT2, were found in the upstream regulatory region of nit1, as well as other consensus sequences such as TATA and GC boxes. A putative binding site for NIT4, a specific regulatory protein, was also found in the 340 position. There is a putative mRNA polyadenilation site at the downstream 2,826 position. The protein translated from nit1 comprises 905 amino acid residues with a molecular mass of 101,1 kDa and presents high degree of identity with the cognate proteins in Metarhizium anisopliae (62,43 %), Magnaporte grisea (62,27%), Verticillium fungicola (60,15%), Botryotinia fuckchiana (58,30%), and Aspergillus fumigatus (51,93%). In mycelia cultivated in the presence of nitrate, nit1 was expressed after 15 min. Transcription was repressed in mycelia grown in medium containing either ammonium, urea, or glutamine. On glutamine, the level of transcription was apparently basal. |
| id |
UFV_8aaeb46fe7d9145af092e4f1a0bb27cb |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:locus.ufv.br:123456789/5379 |
| network_acronym_str |
UFV |
| network_name_str |
LOCUS Repositório Institucional da UFV |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Ribeiro, Ronney Adrianohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4702817J2Araujo, Elza Fernandes dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783675E2Moraes, Célia Alencar dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781007D6Queiroz, Marisa Vieira dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4785812Z5Bazzolli, Denise Mara Soareshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4761710D6Ribon, Andréa de Oliveira Barroshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4727026E62015-03-26T13:52:01Z2006-11-082015-03-26T13:52:01Z2006-08-28RIBEIRO, Ronney Adriano. Cloning and characterization of the gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, a bean (Phaseolus vulgaris) pathogen. 2006. 57 f. Dissertação (Mestrado em Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2006.http://locus.ufv.br/handle/123456789/5379The gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, nit1, was isolated and characterized. Its nucleotide sequence and regulation in response to different nitrogen sources were analyzed. The gene nit1 has 2,787 base pairs (bp) bearing a single 696 bp intron starting at nucleotide 1,808. This intron is localized in a conserved region when compared to introns present in nitrate reductase genes of other fungi. Hovever, its similarity with them is restricted to the consensus splicing regions. Four TATC sequences, possibly related to binding of the general positive regulatory protein NIT2, were found in the upstream regulatory region of nit1, as well as other consensus sequences such as TATA and GC boxes. A putative binding site for NIT4, a specific regulatory protein, was also found in the 340 position. There is a putative mRNA polyadenilation site at the downstream 2,826 position. The protein translated from nit1 comprises 905 amino acid residues with a molecular mass of 101,1 kDa and presents high degree of identity with the cognate proteins in Metarhizium anisopliae (62,43 %), Magnaporte grisea (62,27%), Verticillium fungicola (60,15%), Botryotinia fuckchiana (58,30%), and Aspergillus fumigatus (51,93%). In mycelia cultivated in the presence of nitrate, nit1 was expressed after 15 min. Transcription was repressed in mycelia grown in medium containing either ammonium, urea, or glutamine. On glutamine, the level of transcription was apparently basal.O gene que codifica para a nitrato redutase de Colletotrichum lindemuthianum, nit1, foi isolado e caracterizado. Sua seqüência e regulação em resposta a diferentes fontes de nitrogênio foram analisadas. A análise da seqüência do gene nit1 indicou que ele possui 2.787 pb com um único íntron de 69 pb iniciando no nucleotídeo 1.808. Este íntron está localizado numa região conservada de íntrons presentes no gene da nitrato redutase em outros fungos. No entanto, a identidade entre eles se restringe às regiões consenso responsáveis pela excisão. A região reguladora do gene nit1, além das seqüências consenso gerais, apresenta quatro seqüências TATC responsáveis pela ligação da proteína reguladora geral positiva NIT2. Um possível sítio da ligação da proteína reguladora da via específica, NIT4, também foi localizado nessa região, na posição -340. Além disso, na região 3 não traduzida foi encontrado um possível sítio para poliadenilação do mRNA localizado na posição 2.826. A proteína deduzida do gene nit1 gerou uma seqüência de 905 aminoácidos com massa molecular de 101,1 kDa e apresentou alta identidade com as proteínas correspondentes em Metarhizium anisopliae (62,43%), Magnaporthe grisea (62,27%), Verticillium fungicola (60,15%), Botryotinia fuckeliana (58,30%) e Aspergillus fumigatus (51,93%). A expressão do gene nit1 em C. lindemuthianum foi avaliada em micélios cultivados em diferentes fontes de nitrogênio, em condições de ativação e repressão. O gene foi expresso na presença de nitrato a partir de 15 minutos após entrar em contato com esta fonte de nitrogênio, tendo atingido a expressão máxima com 360 minutos. A transcrição foi reprimida em micélios cultivados em amônio, uréia e glutamina. Em glutamina, após 60 minutos de repressão, não foi possível detectar a presença de transcritos desse gene.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológicoapplication/pdfporUniversidade Federal de ViçosaMestrado em Microbiologia AgrícolaUFVBRAssociações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesseColletotrichum lindemuthianumNitrato redutaseGene nit1Colletotrichum lindemuthianumNitrate reductaseGene nit1CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOSClonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris)Cloning and characterization of the gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, a bean (Phaseolus vulgaris) pathogeninfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdfapplication/pdf297814https://locus2.dti.ufv.br:4000/bitstreams/513467d1-664a-4afb-861b-a5c041a4ffcb/download8b9399570272dbe1ec41db69f73626b6MD51trueAnonymousREADTEXTtexto completo.pdf.txttexto completo.pdf.txtExtracted texttext/plain95637https://locus2.dti.ufv.br:4000/bitstreams/07cc790e-dd9a-4547-b08d-df989964b88d/download03a533e0beae24e361054b896cff8024MD52falseAnonymousREADTHUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3759https://locus2.dti.ufv.br:4000/bitstreams/317aca80-31ea-4ab9-87cf-7d7e920f788e/download4fb56a62d680351d0346b8d3e7b4743dMD53falseAnonymousREAD123456789/53792016-04-10 23:18:39.289open.accessoai:locus.ufv.br:123456789/5379https://locus2.dti.ufv.br:4000Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452016-04-11T02:18:39LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false |
| dc.title.por.fl_str_mv |
Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris) |
| dc.title.alternative.eng.fl_str_mv |
Cloning and characterization of the gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, a bean (Phaseolus vulgaris) pathogen |
| title |
Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris) |
| spellingShingle |
Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris) Ribeiro, Ronney Adriano Colletotrichum lindemuthianum Nitrato redutase Gene nit1 Colletotrichum lindemuthianum Nitrate reductase Gene nit1 CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOS |
| title_short |
Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris) |
| title_full |
Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris) |
| title_fullStr |
Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris) |
| title_full_unstemmed |
Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris) |
| title_sort |
Clonagem e caracterização do gene que codifica a nitrato redutase em Colletotrichum lindemuthianum, patógeno do feijoeiro (Phaseolus vulgaris) |
| author |
Ribeiro, Ronney Adriano |
| author_facet |
Ribeiro, Ronney Adriano |
| author_role |
author |
| dc.contributor.authorLattes.por.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4702817J2 |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Ribeiro, Ronney Adriano |
| dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv |
Araujo, Elza Fernandes de |
| dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783675E2 |
| dc.contributor.advisor-co2.fl_str_mv |
Moraes, Célia Alencar de |
| dc.contributor.advisor-co2Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781007D6 |
| dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Queiroz, Marisa Vieira de |
| dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4785812Z5 |
| dc.contributor.referee1.fl_str_mv |
Bazzolli, Denise Mara Soares |
| dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4761710D6 |
| dc.contributor.referee2.fl_str_mv |
Ribon, Andréa de Oliveira Barros |
| dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4727026E6 |
| contributor_str_mv |
Araujo, Elza Fernandes de Moraes, Célia Alencar de Queiroz, Marisa Vieira de Bazzolli, Denise Mara Soares Ribon, Andréa de Oliveira Barros |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Colletotrichum lindemuthianum Nitrato redutase Gene nit1 |
| topic |
Colletotrichum lindemuthianum Nitrato redutase Gene nit1 Colletotrichum lindemuthianum Nitrate reductase Gene nit1 CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOS |
| dc.subject.eng.fl_str_mv |
Colletotrichum lindemuthianum Nitrate reductase Gene nit1 |
| dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOS |
| description |
The gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, nit1, was isolated and characterized. Its nucleotide sequence and regulation in response to different nitrogen sources were analyzed. The gene nit1 has 2,787 base pairs (bp) bearing a single 696 bp intron starting at nucleotide 1,808. This intron is localized in a conserved region when compared to introns present in nitrate reductase genes of other fungi. Hovever, its similarity with them is restricted to the consensus splicing regions. Four TATC sequences, possibly related to binding of the general positive regulatory protein NIT2, were found in the upstream regulatory region of nit1, as well as other consensus sequences such as TATA and GC boxes. A putative binding site for NIT4, a specific regulatory protein, was also found in the 340 position. There is a putative mRNA polyadenilation site at the downstream 2,826 position. The protein translated from nit1 comprises 905 amino acid residues with a molecular mass of 101,1 kDa and presents high degree of identity with the cognate proteins in Metarhizium anisopliae (62,43 %), Magnaporte grisea (62,27%), Verticillium fungicola (60,15%), Botryotinia fuckchiana (58,30%), and Aspergillus fumigatus (51,93%). In mycelia cultivated in the presence of nitrate, nit1 was expressed after 15 min. Transcription was repressed in mycelia grown in medium containing either ammonium, urea, or glutamine. On glutamine, the level of transcription was apparently basal. |
| publishDate |
2006 |
| dc.date.available.fl_str_mv |
2006-11-08 2015-03-26T13:52:01Z |
| dc.date.issued.fl_str_mv |
2006-08-28 |
| dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2015-03-26T13:52:01Z |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.citation.fl_str_mv |
RIBEIRO, Ronney Adriano. Cloning and characterization of the gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, a bean (Phaseolus vulgaris) pathogen. 2006. 57 f. Dissertação (Mestrado em Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2006. |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://locus.ufv.br/handle/123456789/5379 |
| identifier_str_mv |
RIBEIRO, Ronney Adriano. Cloning and characterization of the gene encoding nitrate reductase in Colletotrichum lindemuthianum, a bean (Phaseolus vulgaris) pathogen. 2006. 57 f. Dissertação (Mestrado em Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2006. |
| url |
http://locus.ufv.br/handle/123456789/5379 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Viçosa |
| dc.publisher.program.fl_str_mv |
Mestrado em Microbiologia Agrícola |
| dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFV |
| dc.publisher.country.fl_str_mv |
BR |
| dc.publisher.department.fl_str_mv |
Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Viçosa |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV) instacron:UFV |
| instname_str |
Universidade Federal de Viçosa (UFV) |
| instacron_str |
UFV |
| institution |
UFV |
| reponame_str |
LOCUS Repositório Institucional da UFV |
| collection |
LOCUS Repositório Institucional da UFV |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://locus2.dti.ufv.br:4000/bitstreams/513467d1-664a-4afb-861b-a5c041a4ffcb/download https://locus2.dti.ufv.br:4000/bitstreams/07cc790e-dd9a-4547-b08d-df989964b88d/download https://locus2.dti.ufv.br:4000/bitstreams/317aca80-31ea-4ab9-87cf-7d7e920f788e/download |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
8b9399570272dbe1ec41db69f73626b6 03a533e0beae24e361054b896cff8024 4fb56a62d680351d0346b8d3e7b4743d |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV) |
| repository.mail.fl_str_mv |
fabiojreis@ufv.br |
| _version_ |
1876497395352600576 |