Disentangling environmental effects on plant disease epidemics at the regional scale

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2022
Autor(a) principal: Alves, Kaique dos Santos
Orientador(a): Del Ponte, Emerson Medeiros
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: eng
Instituição de defesa: Universidade Federal de Viçosa
Programa de Pós-Graduação: Fitopatologia
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://locus.ufv.br//handle/123456789/30725
https://doi.org/10.47328/ufvbbt.2023.053
Resumo: O ambiente desempenha um papel essencial para ocorrência e dinâmica de epidemias de doenças de plantas. O tempo (meteorológico) é conhecido por influenciar a biologia do patógeno e do hospedeiro e por isso desempenha papel na modulação dos estágios do ciclo das doenças. Por outro lado, o clima, dado como a média do tempo (meteorológico) durante longos períodos (30 anos), deve definir a predominância de patógenos e genótipos hospedeiros nas regiões e, portanto, a distribuição espacial das doenças de plantas e suas respectivas intensidades. Nesta tese, serão apresentados três estudos com o objetivo de desvendar os efeitos de fatores ambientais em epidemias de doenças de plantas. O primeiro estudo demonstrará como o clima molda a distribuição espacial da prevalência do Huanglongbing (também conhecido como greening) dos citros em Minas Gerais. No segundo estudo, o tempo de aparecimento da ferrugem da soja em lavouras comerciais de soja do Sul do Brasil foi associado ao El Nino-Southern Oscillation, fenômeno que desencadeia eventos climáticos extremos ao redor do globo e também no Brasil; O terceiro estudo integra metodologia estatística de ponta para associar séries temporais de variáveis meteorológicas e dados de propriedades do solo à prevalência de mofo branco em campos de feijão-vagem em Nova York, Estados Unidos. Os resultados levaram a novos entendimentos sobre a biologia dos patógenos e o risco de doenças nas escalas regional e local para os três patossistemas em estudo. Palavras-chave: Epidemiologia. Huanglongbing. Ferrugem da soja. Mofo branco. Bayesiano. Aprendizado de máquina.
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spelling Alves, Kaique dos Santoshttp://lattes.cnpq.br/3166163630863998Del Ponte, Emerson Medeiros2023-04-14T18:54:03Z2023-04-14T18:54:03Z2022-11-17ALVES, Kaique dos Santos. Disentangling environmental effects on plant disease epidemics at the regional scale. 2022. 84 f. Tese (Doutorado em Fitopatologia) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2022.https://locus.ufv.br//handle/123456789/30725https://doi.org/10.47328/ufvbbt.2023.053O ambiente desempenha um papel essencial para ocorrência e dinâmica de epidemias de doenças de plantas. O tempo (meteorológico) é conhecido por influenciar a biologia do patógeno e do hospedeiro e por isso desempenha papel na modulação dos estágios do ciclo das doenças. Por outro lado, o clima, dado como a média do tempo (meteorológico) durante longos períodos (30 anos), deve definir a predominância de patógenos e genótipos hospedeiros nas regiões e, portanto, a distribuição espacial das doenças de plantas e suas respectivas intensidades. Nesta tese, serão apresentados três estudos com o objetivo de desvendar os efeitos de fatores ambientais em epidemias de doenças de plantas. O primeiro estudo demonstrará como o clima molda a distribuição espacial da prevalência do Huanglongbing (também conhecido como greening) dos citros em Minas Gerais. No segundo estudo, o tempo de aparecimento da ferrugem da soja em lavouras comerciais de soja do Sul do Brasil foi associado ao El Nino-Southern Oscillation, fenômeno que desencadeia eventos climáticos extremos ao redor do globo e também no Brasil; O terceiro estudo integra metodologia estatística de ponta para associar séries temporais de variáveis meteorológicas e dados de propriedades do solo à prevalência de mofo branco em campos de feijão-vagem em Nova York, Estados Unidos. Os resultados levaram a novos entendimentos sobre a biologia dos patógenos e o risco de doenças nas escalas regional e local para os três patossistemas em estudo. Palavras-chave: Epidemiologia. Huanglongbing. Ferrugem da soja. Mofo branco. Bayesiano. Aprendizado de máquina.The environment plays an essential role in driving the occurrence and dynamics of plant disease epidemics. The weather is known to influence pathogen and host biology and should modulate the stages of the disease cycle. On the other hand, climate, the average of weather within long periods of time (i.e. 30 years), should set the predominance of pathogens and host genotypes across regions, and therefore the spatial distribution of plant diseases and their respective intensities. In this thesis, three studies aiming to unravel the effects of environmental factors on plant disease epidemics will be presented. The first study will demonstrate how the climate shapes the spatial distribution of citrus Huanglongbing prevalence in Minas Gerais. In the second study, the time to onset of soybean rust in commercial soybean fields from Southern Brazil was associated with the El Nino Southern Oscillation, a phenomenon that triggers extreme weather events around the globe and also in Brazil; The third study integrates cutting- edge statistical methodology to associate weather time series and soil properties data to white mold prevalence in snap bean fields in New York, United States. The results led to novel insights into pathogen biology and disease risk at the regional and local scales for the three pathosystems under study. Keywords: Epidemiology. Huanglongbing. Soybean rust. White mold. Bayesian. Machine learning.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorengUniversidade Federal de ViçosaFitopatologiaPlantas - Doenças e pragas - Fatores climáticosHuanglongbingFrutas cítricas - Doenças e pragasFerrugem da soja (Doença)Mofos brancosVagem - Doenças e pragasFitopatologiaDisentangling environmental effects on plant disease epidemics at the regional scaleDesembaraçando efeitos ambientais em epidemias de doenças de plantas em escalas regionaisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisUniversidade Federal de ViçosaDepartamento de FitopatologiaDoutor em FitopatologiaViçosa - MG2022-11-17Doutoradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdftexto completo.pdftexto completoapplication/pdf2236934https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/30725/1/texto%20completo.pdf598e1fb350037479968e342092c2d12fMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/30725/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52123456789/307252023-04-14 15:54:03.805oai:locus.ufv.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452023-04-14T18:54:03LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
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