Concerns about antimicrobial use and phenotypic resistance pattern in pig nasal microbiome

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2025
Autor(a) principal: Rigueira, Luciana Lana
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: eng
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Vigilância epidemiológica
Resistência antimicrobiana
Microbiota
Suínos
Link de acesso: http://repositorio.unb.br/handle/10482/52211
Resumo: Tese (doutorado) — Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Saúde Animal, 2025.
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spelling Concerns about antimicrobial use and phenotypic resistance pattern in pig nasal microbiomeConsiderações sobre uso de antimicrobianos via oral em porcas e perfil de resistência fenotípica no microbioma nasal de suínosVigilância epidemiológicaResistência antimicrobianaMicrobiotaSuínosTese (doutorado) — Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Saúde Animal, 2025.Este estudo foi dividido em duas partes, ambas com o objetivo de avaliar o fenótipo dos habitantes da microbiota nasal suína. O primeiro estudo, realizado na Universidade de Brasília, consistiu no isolamento de agentes bacterianos coletados de swabs nasais de 50 matrizes suínas alojadas em 10 granjas comerciais com diferentes manejos sanitários no Distrito Federal, Brasil. Um total de 132 cepas cultivadas foram caracterizadas. A suscetibilidade microbiana foi avaliada pelo método qualitativo de Kirby-Bauer e estimouse 55% de resistência antimicrobiana global (1573/2840 testes). Entre os 23 discos de antibióticos testados, bacitracina exibiu maior resistência (92%). Pasteurella multocida foi detectada em 60% das granjas, Glaesserella parasuis em 40% e Actinobacillus pleuropneumoniae em 10% das explorações. Não foi detectada a presença de M. hyopneumoniae. Foi encontrada uma associação positiva entre a redução das lesões no matadouro e a utilização de vacinas autógenas contra P. multocida (p=0,048). Agentes patogénicos como Pseudomonas aeruginosa, Actinobacillus suis e Salmonella sp. foram as espécies consideradas mais resistentes, mas não patogênicos, como Staphylococcus coagulase-negativo, também exibiram resistência. O segundo estudo foi realizado no centro de pesquisa em saúde animal IRTA-CReSA. O método quantitativo de suscetibilidade antimicrobiana utilizado foi a microdiluição em caldo pela técnica de concentração inibitória mínima (CIM). Foi realizada a avaliação 56 estirpes obtidas a partir de isolados já disponíveis no laboratório. Os valores de CIM foram determinados para 24 antimicrobianos. Entre os antimicrobianos testados, a resistência fenotípica à clindamicina foi a mais frequente. Tendo em conta a elevada prevalência de resistência antimicrobiana em agentes não patogênicos da microbiota nasal de suínos tanto no Distrito Federal, Brasil quanto em Barcelona, Espanha, sugere-se que agentes comensais também sejam testados e abordados no plano de resistência a antibióticos (PAN BR AGRO, Brasil; PRAN, Espanha). Por fim, a inclusão de estudos de caracterização de agentes bacterianos obtidos a partir de swab nasal de suínos, ampliando o escopo em curso, pode fortalecer o programa brasileiro para o monitoramento de suscetibilidade microbiana na abordagem Saúde Única.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES).This study was divided into two parts, both with the aim of evaluating the phenotype of the inhabitants of the pig nasal microbiota. The first study at the University of Brasilia consisted in isolating bacterial agents collected from nasal swabs of 50 sows housed in 10 commercial farms with different sanitary management, located in the Federal District, Brazil. A total of 132 cultured strains were characterized. Microbial susceptibility was evaluated using the qualitative Kirby-Bauer method with up to 23 antibiotic discs, with an overall antimicrobial resistance estimated at 55% (1573/2840 tests). Interestingly, bacitracin, an antimicrobial no longer used in pig production, was found to be the most resistant (92%), followed by florfenicol (76.5%). Molecular diagnosis was performed to confirm the presence of the most common PRDC pathogens. M. hyopneumoniae was not detected. Glaesserella parasuis and Actinobacillus pleuropneumoniae were not cultured but were detected by multiplex polymerase chain reaction (PCR) in 40% and 10% of the farms, respectively. Pasteurella multocida was cultured in half of the farms and detected by PCR in 60% of the farms. A positive association was found between the reduction of lesions in the abattoir and the use of autogenous vaccines against P. multocida (Fisher's exact probability test, P=0.048). Pathogens such as Pseudomonas aeruginosa, Actinobacillus suis and Salmonella ser. Typhimurium were the most resistant species, but agents of the commensal nasal microbiota, such as Staphylococcus coagulase-negative, also exhibited antimicrobial resistance. The second study at IRTA-CrESA evaluate antimicrobial susceptibility by broth microdilution on 56 strains obtained from isolates already available in the laboratory, obtained from sow vaginal swab (n=11), colostrum (n=9) and nasal swab samples from dams (n=15) and their litters (n=21). MIC (minimum inhibitory concentration - MIC) values were obtained for 24 antimicrobials. Among the antimicrobials tested, phenotypic resistance to clindamycin was the most common among the strains evaluated. Given the high prevalence of antimicrobial resistance in pigs in the DF, it would be desirable to implement a national antimicrobial resistance surveillance program similar to the Spanish model. On the other hand, considering the presence of antimicrobial resistance in commensals in pig samples in Brazil and Spain, it is desirable that the inhabitants of the commensal flora are also included in the ongoing microbial susceptibility monitoring.Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária (FAV)Programa de Pós-Graduação em Saúde AnimalPerecmanis, SimoneAragón Fernández, VirginiaRigueira, Luciana Lana2025-05-09T13:25:31Z2025-05-09T13:25:31Z2025-05-092025-01-21info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfRIGUEIRA, Luciana Lana. Concerns about antimicrobial use and phenotypic resistance pattern in pig nasal microbiome. 2025. 97 f., il. Tese (Doutorado em Saúde Animal) — Universidade de Brasília, Brasília, 2025.http://repositorio.unb.br/handle/10482/52211engA concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.bce.unb.br, www.ibict.br, http://hercules.vtls.com/cgi-bin/ndltd/chameleon?lng=pt&skin=ndltd sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data.info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UnBinstname:Universidade de Brasília (UnB)instacron:UNB2025-05-09T13:27:17Zoai:repositorio.unb.br:10482/52211Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.unb.br/oai/requestrepositorio@unb.bropendoar:2025-05-09T13:27:17Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)false
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