Análises transcritômicas do ferrão de Potamotrygon falkneri e Potamotrygon motoro

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2014
Autor(a) principal: Oliveira Júnior, Nelson Gomes de
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Arraia (Peixe)
Anatomia veterinária
Venenos - proteínas - peptídeos
Link de acesso: http://repositorio.unb.br/handle/10482/16623
Resumo: Dissertação (mestrado)—Fundação Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2014.
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spelling Análises transcritômicas do ferrão de Potamotrygon falkneri e Potamotrygon motoroArraia (Peixe)Anatomia veterináriaVenenos - proteínas - peptídeosDissertação (mestrado)—Fundação Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2014.Potamotrygon falkneri e Potamotrygon motoro consistem em espécies de arraias da família Potamotrygonidae. Estas famílias são caracterizadas por terem um ferrão retro-serrilhado coberto por um epitélio glandular produtor de peçonha. A sintomatologia desses acidentes se dá por processos inflamatórios podendo progredir até a necrose e úlceras. O conhecimento acerca dos componentes proteicos desta peçonha ainda é muito limitado. No presente estudo, ferramentas transcritômicas foram utilizadas afim de melhor compreender o conteúdo proteico do ferrão das espécies P. falkneri e P. motoro. Primeiramente, uma extração de RNA com trizol foi realizada com subsequente análise por eletroforese em gel de agarose. Os RNAs obtidos foram sequenciados através da plataforma Illumina MiSeq. Para as análises do perfil transcritômico, as sequências foram montadas de novo através do programa Trinity. Após, para caracterização funcional, os dados foram submetidos à ferramenta BLAST contra base de dados UniProt seguida de subsequente análise na base de dados do KEGG Orthology. Posteriormente, um diagrama de Venn foi elaborado indicando o grau de semelhança entre as espécies. Após análise no KEGG, os transcritos foram divididos em grandes categorias, onde, a mais expressa das categorias correspondeu aos transcritos não relacionados a nenhuma via biológica aparente, representando 30% para P. falkneri e 31% para P. motoro, em seguida a categoria mais abundante e com grande importância foi a de metabolismo com 15% para P. falkneri e 14% para P. motoro. Vale ressaltar também a categoria de processos celulares com 10% para ambas as espécies. Após essa separação de classses, análises das vias relacionadas ao metabolismo e possíveis proteínas relacionadas aos sintomas observados nos acidentes ocasionados por arraias, foram discutidas, tais como, fosfolipases, metaloproteinases e desintegrinas. Em suma, as análises transcritoma ajudarão a elucidar como se dá o processo de envenenamento e quais as possíveis moléculas responsáveis pelos danos causados nesses acidentes, esse estudo permitirá ainda, entender como podemos minimizar os danos causados nesses acidentes, amenizando assim, os danos socioeconômicos causados a essas populações ribeirinhas. ______________________________________________________________________________ ABSTRACTPotamotrygon falkneri and Potamotrygon motoro are stingray species from Potamotrygonidae family. This family has a typical aliasing sting covered by glandular epithelium producer venom. The symptomatology of such accidents occurs by inflammatory processes and may lead to necrosis and ulceration. The knowledge about the protein venom components of this, are still very limited. In the present study, transcriptomic tools were used in order to better understand the protein content of P. falkneri and P. motoro sting. Firstly, a RNA extraction was performed using trizol with subsequent agarose gel electrophoresis analysis. The obtained RNAs were sequenced using the Illumina MiSeq platform. For the transcriptome profile analysis, the sequences were de novo assembled by Trinity program. Furthermore, functional characterization was performed, where, data were submitted to BLAST against UniProt database, followed by KEGG Orthology database analysis. Subsequently, a Venn diagram was prepared, indicating the similarity between species. After the KEGG analysis, the transcripts were divided into categories, where the most explicit category was the category with transcripts unrelated to any apparent biological pathways corresponding to 30% for P. falkneri and 31% for P. motoro, in sequence, the most abundant and very important category was metabolism with 15% for P. falkneri and 14% for P. motoro, it is also worth mentioning the category of cellular processes with 10% for both species. After this separation, subsequent analysis of pathways related to metabolism and possible proteins related to symptoms observed in accidents caused by stingrays were discussed, such as, phospholipases, metalloproteinases and disintegrins. In short, the transcriptome analyzes will help elucidate how is the process of poisoning, and what the possible molecules responsible for the damage caused in these accidents, in addition, this study also allow, to understand how we can minimize the damage caused in such accidents, thus mitigating the physical and socio-economic damage to these riverine populations.Instituto de Ciências Biológicas (IB)Programa de Pós-Graduação em Biologia AnimalMortari, Márcia RenataFranco, Octávio LuizOliveira Júnior, Nelson Gomes de2014-10-24T15:18:34Z2014-10-24T15:18:34Z2014-10-242014-02-27info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfOLIVEIRA JÚNIOR, Nelson Gomes de. Análises transcritômicas do ferrão de Potamotrygon falkneri e Potamotrygon motoro. 2014. 137 f., il. Dissertação (Mestrado em Biologia Animal)—Universidade de Brasília, Brasília, 2014.http://repositorio.unb.br/handle/10482/16623A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.bce.unb.br, www.ibict.br, http://hercules.vtls.com/cgi-bin/ndltd/chameleon?lng=pt&skin=ndltd sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data.info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UnBinstname:Universidade de Brasília (UnB)instacron:UNB2024-01-31T17:15:24Zoai:repositorio.unb.br:10482/16623Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.unb.br/oai/requestrepositorio@unb.bropendoar:2024-01-31T17:15:24Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)false
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