Estudos bioquímicos e estruturais com o complexo proteassomo : busca de novos inibidores e mecanismos de resistência e inibição deste alvo contra o câncer

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2017
Autor(a) principal: Fernandes, Arthur Zanetti Nunes, 1991-
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: [s.n.]
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1634221
Resumo: Orientador: Daniela Barretto Barbosa Trivella
id UNICAMP-30_7919c59a33d04102c41a1426d1f4cbbb
oai_identifier_str oai::1045328
network_acronym_str UNICAMP-30
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository_id_str
spelling Estudos bioquímicos e estruturais com o complexo proteassomo : busca de novos inibidores e mecanismos de resistência e inibição deste alvo contra o câncerStructural and biochemistry studies with the proteasome complex : search of new inhibitors and mechanisms of resistance and inhibition of this target against cancerProteassomoCâncerProdutos biológicosCristalografia de proteínasDescoberta de drogasEnsaios de triagem em larga escalaProteasomeCancerNatural productsProtein crystallographyDrug discoveryHigh-throughput screening assaysOrientador: Daniela Barretto Barbosa TrivellaDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de BiologiaResumo: O proteassomo é um complexo enzimático responsável pela degradação proteica programada, sendo crítico para a regulação da homeostase celular estando associado a diversas patologias incluindo câncer. Em 2003, bortezomib (Velcade® - Takeda Inc.) foi o primeiro inibidor de proteassomo aprovado pelo FDA, atualmente sendo o fármaco de primeira escolha para tratamento de mieloma múltiplo. Porém, o uso clínico mostrou que inibidores de proteassomo enfrentam diversos problemas como toxicidade, baixa distribuição e desenvolvimento de resistência. Assim, a busca de novos inibidores do proteassomo, especialmente do proteassomo resistente, torna-se importante. Recentemente foi descrito na actinobactéria Salinispora tropica a presença de duas isoformas de proteassomo, sendo uma delas resistente a inibidores conhecidos do proteassomo humano e de levedura. Esta isoforma resistente carrega as mesmas mutações encontradas em células humanas resistentes a bortezomib. Estudos in vitro com o proteassomo humano são bastante limitados. Sendo assim, neste projeto de mestrado, propomos a realização de estudos bioquímicos e estruturais com os proteassomos humano (comercial), de levedura e de actinobactéria (selvagem e resistente), visando a busca de novas classes de inibidores do proteassomo. Durante este trabalho, estabelecemos os protocolos de expressão, purificação e cristalização do proteassmo de levedura e de bactéria (selvagem), e reportamos a primeira estrutura atômica deste último. Além disto, protocolos foram também implementados para a expressão e purificação do proteassomo de bactéria resistente. Em paralelo, estabelecemos um ensaio high-throughput screening (HTS) para análise de bibliotecas de produtos naturais com o proteassomo humano e de levedura. Utilizando este ensaio fomos capazes de triar cerca de 1200 amostras de produtos naturais (frações, extratos brutos e substâncias isoladas) identificando novos hits. Três hits foram priorizados em nossos estudos, sendo que um representa uma nova estrutura para inibição do proteassomo e outro foi cristalizado com o proteassomo utilizando uma nova abordagem. Assim, almejamos que os resultados obtidos contribuam para a descoberta de novos inibidores do proteassomo visando o desenvolvimento de uma nova geração de inibidores para esse alvo contra o câncerAbstract: The proteasome is an enzymatic complex responsible for the programmed degradation of proteins, being critical for the cellular homeostasis regulation and associated to several diseases including cancer. In 2003 Bortezomib (Velcade® - Takeda Inc.) was the first proteasome inhibitor to be approved by the FDA and has become the first choice for multiple myeloma treatment. However, the clinical usage of proteasome inhibitors showed that they face several problems such as toxicity, low distribution and development of resistance. Thereby the search for new proteasome inhibitors, especially for the resistant form, becomes an important matter. Recently, it was described the presence of two isoforms of the proteasome in the actinobacteria Salinispora tropica, being one of these resistant to human and yeast proteasome inhibitors. This isoform has the same mutations found in human cells resistant to bortezomib. In vitro studies with the human proteasome are limited. Therefore, we proposed the performance of biochemical and structural studies using the commercial human proteasome, yeast and actinobacteria (wild and resistant types) proteasomes, aiming the discovery of new classes of proteasome inhibitors. During this work we established the protocols for expression, purification and crystallization of the yeast and bacterial proteasomes (wild type), and will report the first crystal structure of the later. Furthermore, protocols were further implemented for the expression and purification of resistant bacterial proteasome. In parallel, we also established a high-throughput screening (HTS) assay to evaluate natural products libraries using the human and the yeast proteasomes. With those assays, we were able to screen about 1,200 samples of natural products (whole extracts, fractions and isolated substances) identifying new hits. Three out the hits were prioritized in our studies, being one a new proteasome inhibitor structure and other was crystallized using a new approach. Overall, we seek that the results herein obtained will contribute to the discovery of new proteasome inhibitors aiming the development of next generation inhibitors for this target against cancerMestradoFármacos, Medicamentos e Insumos para SaúdeMestre em CiênciasCAPES1419094FAPESP2014/10753-9[s.n.]Trivella, Daniela Barretto Barbosa, 1980-Trindade, Daniel MaragnoOliveira, Juliana Ferreira deUniversidade Estadual de Campinas. Instituto de BiologiaPrograma de Pós-Graduação em Biociências e Tecnologia de Produtos BioativosUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASFernandes, Arthur Zanetti Nunes, 1991-20172017-02-24T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdf1 recurso online (87 p.) : il., digital, arquivo PDF.https://hdl.handle.net/20.500.12733/1634221FERNANDES, Arthur Zanetti Nunes. Estudos bioquímicos e estruturais com o complexo proteassomo: busca de novos inibidores e mecanismos de resistência e inibição deste alvo contra o câncer. 2017. 1 recurso online (87 p.) Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1634221. Acesso em: 15 mai. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/1045328Requisitos do sistema: Software para leitura de arquivo em PDFporreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2021-03-03T20:19:22Zoai::1045328Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2021-03-03T20:19:22Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false
dc.title.none.fl_str_mv Estudos bioquímicos e estruturais com o complexo proteassomo : busca de novos inibidores e mecanismos de resistência e inibição deste alvo contra o câncer
Structural and biochemistry studies with the proteasome complex : search of new inhibitors and mechanisms of resistance and inhibition of this target against cancer
title Estudos bioquímicos e estruturais com o complexo proteassomo : busca de novos inibidores e mecanismos de resistência e inibição deste alvo contra o câncer
spellingShingle Estudos bioquímicos e estruturais com o complexo proteassomo : busca de novos inibidores e mecanismos de resistência e inibição deste alvo contra o câncer
Fernandes, Arthur Zanetti Nunes, 1991-
Proteassomo
Câncer
Produtos biológicos
Cristalografia de proteínas
Descoberta de drogas
Ensaios de triagem em larga escala
Proteasome
Cancer
Natural products
Protein crystallography
Drug discovery
High-throughput screening assays
title_short Estudos bioquímicos e estruturais com o complexo proteassomo : busca de novos inibidores e mecanismos de resistência e inibição deste alvo contra o câncer
title_full Estudos bioquímicos e estruturais com o complexo proteassomo : busca de novos inibidores e mecanismos de resistência e inibição deste alvo contra o câncer
title_fullStr Estudos bioquímicos e estruturais com o complexo proteassomo : busca de novos inibidores e mecanismos de resistência e inibição deste alvo contra o câncer
title_full_unstemmed Estudos bioquímicos e estruturais com o complexo proteassomo : busca de novos inibidores e mecanismos de resistência e inibição deste alvo contra o câncer
title_sort Estudos bioquímicos e estruturais com o complexo proteassomo : busca de novos inibidores e mecanismos de resistência e inibição deste alvo contra o câncer
author Fernandes, Arthur Zanetti Nunes, 1991-
author_facet Fernandes, Arthur Zanetti Nunes, 1991-
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Trivella, Daniela Barretto Barbosa, 1980-
Trindade, Daniel Maragno
Oliveira, Juliana Ferreira de
Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologia
Programa de Pós-Graduação em Biociências e Tecnologia de Produtos Bioativos
UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS
dc.contributor.author.fl_str_mv Fernandes, Arthur Zanetti Nunes, 1991-
dc.subject.por.fl_str_mv Proteassomo
Câncer
Produtos biológicos
Cristalografia de proteínas
Descoberta de drogas
Ensaios de triagem em larga escala
Proteasome
Cancer
Natural products
Protein crystallography
Drug discovery
High-throughput screening assays
topic Proteassomo
Câncer
Produtos biológicos
Cristalografia de proteínas
Descoberta de drogas
Ensaios de triagem em larga escala
Proteasome
Cancer
Natural products
Protein crystallography
Drug discovery
High-throughput screening assays
description Orientador: Daniela Barretto Barbosa Trivella
publishDate 2017
dc.date.none.fl_str_mv 2017
2017-02-24T00:00:00Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://hdl.handle.net/20.500.12733/1634221
FERNANDES, Arthur Zanetti Nunes. Estudos bioquímicos e estruturais com o complexo proteassomo: busca de novos inibidores e mecanismos de resistência e inibição deste alvo contra o câncer. 2017. 1 recurso online (87 p.) Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1634221. Acesso em: 15 mai. 2024.
url https://hdl.handle.net/20.500.12733/1634221
identifier_str_mv FERNANDES, Arthur Zanetti Nunes. Estudos bioquímicos e estruturais com o complexo proteassomo: busca de novos inibidores e mecanismos de resistência e inibição deste alvo contra o câncer. 2017. 1 recurso online (87 p.) Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1634221. Acesso em: 15 mai. 2024.
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/1045328
Requisitos do sistema: Software para leitura de arquivo em PDF
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
1 recurso online (87 p.) : il., digital, arquivo PDF.
dc.publisher.none.fl_str_mv [s.n.]
publisher.none.fl_str_mv [s.n.]
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instacron:UNICAMP
instname_str Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instacron_str UNICAMP
institution UNICAMP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository.mail.fl_str_mv sbubd@unicamp.br
_version_ 1799139963446493184