Análise proteômica de Trypanosoma cruzi epimastigotas derivados de tripomastigotas de portadores de diferentes formas clínicas da doença de Chagas : Proteomic analysis of Trypanosoma cruzi epimastigotes derived from tripomastigotes from patients with different clinical forms of Chagas disease

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2022
Autor(a) principal: Limeira, Cleanne, 1996-
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: [s.n.]
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Doença de Chagas
Metabolismo
Ontologia genética
Proteoma
Trypanosoma cruzi
Chagas disease
Metabolism
Gene ontology
Proteome
Link de acesso: https://hdl.handle.net/20.500.12733/3633
Resumo: Orientadores: Fernanda Ramos Gadelha, Danilo Ciccone Miguel
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Em sua fase crônica é capaz de gerar uma grande incapacitação em seus portadores que podem ser assintomáticos, ou, evoluir para um comprometimento cardíaco, digestivo ou ambos. Até o momento, não existe um consenso a respeito da causa da diversidade das manifestações clínicas desta doença, havendo a necessidade da descoberta de marcadores moleculares de identificação da evolução da DC e de fármacos mais eficientes. Na tentativa de investigar a contribuição do parasita na patogênese da DC, realizamos a análise proteômica, utilizando espectrometria de massas nanoflow LC-MS / MS, de oito isolados de T. cruzi obtidos de pacientes com as diferentes formas clínicas da doença. Os isolados provenientes de portadores da mesma forma clínica foram agrupados. As proteínas foram identificadas através do software MaxQuant fazendo uso do banco de dados UniProt. Os resultados foram estatisticamente processados fazendo uso dos testes t-student e ANOVA. Em seguida, as proteínas identificadas foram submetidas ao banco de dados de tripanossomatídeos TriTrypDB para a realização de análises de ontologia genética e verificação do envolvimento das proteínas identificadas nos componentes celulares, processos biológicos e funções moleculares. Além disso, foram realizadas análises de enriquecimento de vias metabólicas para detectar as vias mais expressas. Embora sejam parasitas envolvidos em diferentes manifestações da doença foi identificada uma grande quantidade de proteínas caracterizadas e putativas compartilhadas entre os grupos analisados (1614 proteínas), o que configura um metabolismo central comum entre os parasitas. Por outro lado, identificamos diferenças pontuais, onde o grupo dos isolados indeterminados, cardíacos, digestivo e cardiodigestivo apresentaram respectivamente 46, 88, 37 e 46 proteínas exclusivas, além de níveis distintos de expressão de proteínas compartilhadas entre os grupos analisados. Nas análises de enriquecimento o grupo indeterminado apresentou-se sempre menos enriquecido que os demais grupos. Com os resultados obtidos neste trabalho ressalta-se a existência de um metabolismo central compartilhado por diferentes isolados de T. cruzi e diferenças pontuais nos diferentes grupos. Uma discussão das proteínas mais abundantes encontradas e a contribuição para o metabolismo do parasita é discutidaAbstract: Trypanosoma cruzi is a genetically diverse protozoan that causes Chagas disease (CD) and is considered a neglected disease of worldwide interest. In its chronic phase, it is capable of causing great incapacitation in its patients, who can be asymptomatic, progress to cardiac, digestive or both. So far, there is no consensus on the cause of the diversity of clinical manifestations of this disease, with the need to discover molecular markers to identify the evolution of CD and more effective drugs. In an attempt to investigate the contribution of the parasite in the pathogenesis of CD, we performed proteomic analysis, by means of LC-MS / MS nanoflow mass spectrometry, of eight T. cruzi isolates obtained from patients with different clinical forms of the disease. Isolates from carriers of the same clinical form were pooled. Proteins were identified using MaxQuant software using the UniProt database. The results were processed statistically using t-student and ANOVA tests. Then, the identified proteins were submitted to the TriTrypDB trypanosomatids database for analysis of genetic ontology and verification of the involvement of the identified proteins in cellular components, biological processes and molecular functions. Furthermore, enrichment analyzes of metabolic pathways were performed to detect the most expressive pathways. Although the parasites are involved in different manifestations of the disease, a large amount of characterized and putative proteins shared between the analyzed groups (1614 proteins) was identified, which configures a common central metabolism among the parasites. On the other hand, we identified specific differences, where the group of indeterminate isolates, cardiac, digestive and cardiodigestive presented respectively 46, 88, 37 and 46 exclusive proteins, in addition to distinct levels of expression of proteins shared between the analyzed groups. Furthermore, in enrichment analyses, the indeterminate group was always less enriched than the other groups. The results obtained in this work emphasize the existence of a central metabolism shared by different T. cruzi isolates and specific differences in different groups. A discussion of the most abundant proteins found and their contribution to parasite metabolism is discussedMestradoBioquímicaMestra em Biologia Funcional e MolecularCNPQ134289/2019FAPESP2015/24595-9[s.n.]Gadelha, Fernanda Ramos, 1964-Miguel, Danilo Ciccone, 1984-Cabral, Fernanda JankuCortez Veliz, Mauro JavierUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de BiologiaPrograma de Pós-Graduação em Biologia Funcional e MolecularUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASLimeira, Cleanne, 1996-20222022-02-21T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdf1 recurso online (145 p.) : il., digital, arquivo PDF.https://hdl.handle.net/20.500.12733/3633LIMEIRA, Cleanne. 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