Mapeamento cromossomico dos retroelementos AviRTE e CR1 em aves do Sul do Brasil: enfase nos cromossomos Z e W

• Ano de defesa: 2023
• Autor(a) principal: Farias, Nairo Farias de
• Orientador(a): Gunski, Ricardo José
• Banca de defesa: Valente, Vera Lucia da Silva , Garnero, Analía del Valle
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal do Pampa
• Programa de Pós-Graduação: Mestrado Acadêmico em Ciências Biológicas
• Departamento: Campus São Gabriel
• País: Brasil
• Palavras-chave em Português: Retroelementos; AviRTE; CR1; Aves; Cromossomos sexuais; Retroelements; Birds; Sex chromosomes
• Área do conhecimento CNPq: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
• Link de acesso: https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/handle/riu/9253

Os elementos transponíveis (TEs) são sequências genéticas repetitivas móveis onipresente em quase todos os seres vivos, possuem a característica de se mover dentro e entre genomas. Os TEs são classificados em duas principais Classes, de acordo com o seu mecanismo de mobilização: I os retrotransposons, que utilizam um intermediário de RNA e, II os transoposons via DNA. Nesse trabalho foram estudados dois retrotransposons: AviRTE e CR1, ambos pertencentes a ordem LINE de TEs, a mais abundante no genoma das Aves. Dentre estes, os mais conhecidos e abundantes são os CR1. Os AviRTE foram descobertos mais recentemente no genoma aviário, são menos abundantes e, ainda, menos caracterizados. As Aves possuem cariótipo bimodal com alta variação no número diploide, algumas espécies apresentam cromossomos sexuais incomumente grandes, possivelmente pela presença de sequências repetitivas. Deste modo, o objetivo principal foi mapear os cromossomos sexuais de espécies que possuem tamanho maior do comumente encontrado, a fim de verificar o envolvimento e a contribuição desses elementos nesta diferenciação. No primeiro capítulo, utilizou-se sonda de AviRTE no cariótipo de três espécies: Progne chalybea (PCH), Chloroceryle americana (CAM) e Trogon surrucura (TSU). Adicionalmente, analisamos as relações filogenéticas do elemento no genoma de aves e em outros vertebrados. Nossos resultados mostraram que os padrões de distribuição de AviRTE foram diferentes entre as espécies, não estando restritos a regiões heterocromáticas, com acúmulo no cromossomo Z de CAM e no W de PCH e TSU. A análise filogenética das sequências desse elemento nas aves acompanhou a filogenia proposta para os grupos na maioria dos clados, e permitiu a detecção em maior número de espécies, ampliando a distribuição do elemento. No segundo capítulo, utilizando como sonda o retroelemento CR1, mapeamos a distribuição cromossômica no genoma de Chloroceryle americana (CAM) e de Gallinula melanops (GME). Nossos dados revelaram diferente distribuição entre as espécies, detectamos a presença de CR1-E nos cromossomos sexuais Z de CAM e no W de GME, o que sugere o provável envolvimento dessas sequências com o aumento do tamanho desses cromossomos.