Um passo à frente no conhecimento do genoma da mosca praga Drosophila suzukii: identificação de novo e citogenômica comparativa de DNAs satélites em Drosophila suzukii

• Ano de defesa: 2022
• Autor(a) principal: Silva, Rhavenna Thais Alves Gomes da [UNESP]
• Orientador(a): Cabral-de-Mello, Diogo Cavalcanti [UNESP]
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
• Palavras-chave em Português: DNA satélite; DNA repetitivo; Hibridização in situ fluorescente; Microssatélite
• Palavras-chave em Inglês: Satellite DNA; Repetitive DNA; Fluorescent in situ hybridization; Microsatellite
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/242643

A mosca Drosophila suzukii é uma espécie praga com grande importância econômica devido a sua distribuição mundial e ao seu hábito de oviposição que lhe permite atacar uma grande variedade de frutos. No contexto de DNA repetitivo e da contribuição e importância dessas repetições na evolução e compreensão da constituição genômica das espécies, os estudos voltados a essa fração de DNA em D. suzukii são escassos e restritos à descrição de alguns elementos transponíveis. Com o objetivo de aumentar as informações sobre a organização cromossômica e genômica de D. suzukii com foco na fração do DNA repetido em tandem, caracterizamos os cromossomos de D. suzukii através da análise convencional e bandeamentos cromossômicos. Identificamos DNAs satélites (DNAsat) através das ferramentas RepeatExplorer2 e TAREAN com dados de sequenciamento e utilizamos a Hibridização In Situ Fluorescente (FISH) para caracterizar a distribuição de sequências repetidas em tandem (microssatélites, DNAs satélites, DNA ribossomal 18S e histona H4). Nossos resultados demonstram uma amplificação de heterocromatina no cromossomo II de D. suzukii e revelam uma heterocromatina enriquecida em microssatélites e conteúdo A+T sugerindo que microssatélites podem estar desempenhando um papel na expansão de heterocromatina nessa espécie, exceto no cromossomo Y. Nossos dados utilizando microssatélites e DNAsat demonstram que o cromossomo Y em D. suzukii deve ser constituído majoritariamente por sequências derivadas de elementos transponíveis. No total, foram identificados 15 DNAs satélites que representam cerca de 7.27% do genoma da espécie. A análise desses DNAs satélites revelou que outros elementos de DNA repetitivos como as famílias multigênicas e elementos transponíveis estão envolvidos na origem de DNAs satélites em D. suzukii e reforçou a conservação de DNAs satélites dentro do gênero Drosophila, como o DNAsat 1.688. A distribuição cromossômica de DNAsat, evidenciada por FISH, foi bastante variável tanto na heterocromatina e eucromatina, assim como nas diferentes regiões cromossômicas e no número de cromossomos. Esses dados fornecem a primeira descrição mais detalhada do genoma de D. suzukii e demonstram uma evolução genômica bastante heterogênea para essa espécie envolvendo repetições em tandem.