Identificação de SNPs e genética populacional de cardumes migradores e residentes de Prochilodus lineatus (Characiformes: Prochilodontidae)

• Ano de defesa: 2022
• Autor(a) principal: Garcia, Yasmin [UNESP]
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
• Palavras-chave em Português: Mogi-Guaçu; Curimbatá; SNPs; Migradores e residentes; Genética animal; Rio Mogi-Guaçu; Prochilodus lineatus
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/244077

O conhecimento acerca da dinâmica e biologia de espécies de peixes migradores é essencial para a manutenção da diversidade genética. Uma das espécies mais frequentes no ambiente neotropical é Prochilodus lineatus, popularmente conhecida como curimbatá. Considerado um peixe migrador de longas distâncias, P. lineatus compõe extensos cardumes que migram nos rios da bacia do Alto Paraná durante a piracema. Cardumes de curimbatás residentes vem sendo observados, sendo os peixes que deixam de migrar e se estabelecem em uma região, dando indícios de uma possível existência de estoques geneticamente distintos. Considerando a importância das espécies migradoras para o ecossistema, o objetivo desse trabalho foi desenvolver marcadores moleculares do tipo SNPs (Polimorfismo de nucleotídeo único) para P. lineatus e aplicá-los através de metodologias de genética populacional em cardumes migradores e residentes para identificar a possível existência de estruturação e analisar a variabilidade genética nestes grupos biológicos. Para tal, utilizou-se a tecnologia RAD de dupla digestão (ddRAD-seq) em 80 amostras de curimbatás coletados no Rio Mogi-Guaçu, na região da Cachoeira de Emas, SP, sendo analisados 10 indivíduos migradores e 10 residentes capturados a cada ano (2008, 2009, 2010 e 2021). Ao final da extração de DNA, elaboração das bibliotecas e sequenciamento, as filtragens resultaram em 4.085 SNPs que foram utilizados em análises populacionais. Para todos os anos, os valores de heterozigosidade observada (HO) e da heterozigosidade esperada (HE) foram semelhantes e os valores de HWE indicaram um excesso de homozigotos. Os valores de FIS, positivos e significativos, indicaram um tênue nível de endogamia nos grupos analisados. Os valores de FST indicaram a existência de agrupamentos entre os residentes de 2008 e 2021, enquanto os migradores demonstraram uma maior homogeneização de clusters. O AMOVA indicou a maior diferenciação entre indivíduos dentro das populações, mas uma significativa diferenciação entre grupos. Sendo assim, é possível concluir que os grupos de migradores permanecem com fluxo gênico, enquanto o de residentes podem estar apresentando um início de processo de estruturação, que poderá ser evidenciado ao longo dos próximos anos com a queda do número efetivo populacional, fazendo com que seja necessário o monitoramento dos curimbatás do rio Mogi-Guaçu para que não haja perca da variabilidade genética nos cardumes.