Simulação computacional da estrutura terciária de proteínas através de equações paramétricas

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2016
Autor(a) principal: Silva, Willian Eliseu da [UNESP]
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Nós
Proteínas
Gráfico de distâncias
Proteins
Distances graph
Knots
Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/144417
Resumo: Proteínas são polímeros heterogêneos lineares essenciais a todos os organismos vivos. As proteínas apresentam diversas funções nos organismos, tais como: estruturação, catálise, síntese, transferências, entre tantas outras. Neste trabalho foram estudadas as proteínas que apresentam em suas estruturas nós do tipo 3-1. Foram calculadas as distâncias entre os carbonos alfa dessas proteínas e com estes valores foram traçados os gráficos de distâncias que permitem uma visualização geral da estrutura da proteína. Foram realizadas alterações no nó 31 padrão para que este se ajustasse à estrutura real da proteína na região do nó. A partir do gráfico de distâncias foi possível determinar a estrutura secundária presente na proteína, sendo que a alfa hélice apresenta oscilações de aproximadamente 5,5 angstrons. Com os gráficos de distâncias das proteínas e dos nós matemáticos foi possível comprovar a presença do nó e sua proximidade com a equação proposta.
id UNSP_900ade4fc42f24f107a92bdacd83990f
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/144417
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str
spelling Simulação computacional da estrutura terciária de proteínas através de equações paramétricasComputer simulation of the tertiary structure of proteins by parametric equationNósProteínasGráfico de distânciasProteinsDistances graphKnotsProteínas são polímeros heterogêneos lineares essenciais a todos os organismos vivos. As proteínas apresentam diversas funções nos organismos, tais como: estruturação, catálise, síntese, transferências, entre tantas outras. Neste trabalho foram estudadas as proteínas que apresentam em suas estruturas nós do tipo 3-1. Foram calculadas as distâncias entre os carbonos alfa dessas proteínas e com estes valores foram traçados os gráficos de distâncias que permitem uma visualização geral da estrutura da proteína. Foram realizadas alterações no nó 31 padrão para que este se ajustasse à estrutura real da proteína na região do nó. A partir do gráfico de distâncias foi possível determinar a estrutura secundária presente na proteína, sendo que a alfa hélice apresenta oscilações de aproximadamente 5,5 angstrons. Com os gráficos de distâncias das proteínas e dos nós matemáticos foi possível comprovar a presença do nó e sua proximidade com a equação proposta.Proteins are linear heterogeneous polymer essential to all living organisms. The proteins have different functions in organisms, such as: structuring, catalysis, synthesis, transfers, among many others. In this work were studied the proteins that presenting in their structure, type 31 knots. The distances between the alpha carbons of those proteins were calculated and with these values were plotted distances graphs that allow general visualization of the protein structure. Changes were made in the standard knot 31 so that it would fit the actual structure of the protein in the node region. From the distances graph was possible to determine the secondary structure of the protein, wherein the alpha helix presents oscillations proximately 5.5 angstroms. With distances graph from proteins and from mathematical knots was possible to prove the presence of the node and its proximity to the proposed equation.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)CNPq: 131771/2014-0Universidade Estadual Paulista (Unesp)Souza, Aguinaldo Robinson de [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Silva, Willian Eliseu da [UNESP]2016-10-21T20:00:33Z2016-10-21T20:00:33Z2016-08-31info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11449/14441700087454233004056083P74167514050938821porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESP2025-06-24T05:49:24Zoai:repositorio.unesp.br:11449/144417Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462025-06-24T05:49:24Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Simulação computacional da estrutura terciária de proteínas através de equações paramétricas
Computer simulation of the tertiary structure of proteins by parametric equation
title Simulação computacional da estrutura terciária de proteínas através de equações paramétricas
spellingShingle Simulação computacional da estrutura terciária de proteínas através de equações paramétricas
Silva, Willian Eliseu da [UNESP]
Nós
Proteínas
Gráfico de distâncias
Proteins
Distances graph
Knots
title_short Simulação computacional da estrutura terciária de proteínas através de equações paramétricas
title_full Simulação computacional da estrutura terciária de proteínas através de equações paramétricas
title_fullStr Simulação computacional da estrutura terciária de proteínas através de equações paramétricas
title_full_unstemmed Simulação computacional da estrutura terciária de proteínas através de equações paramétricas
title_sort Simulação computacional da estrutura terciária de proteínas através de equações paramétricas
author Silva, Willian Eliseu da [UNESP]
author_facet Silva, Willian Eliseu da [UNESP]
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Souza, Aguinaldo Robinson de [UNESP]
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, Willian Eliseu da [UNESP]
dc.subject.por.fl_str_mv Nós
Proteínas
Gráfico de distâncias
Proteins
Distances graph
Knots
topic Nós
Proteínas
Gráfico de distâncias
Proteins
Distances graph
Knots
description Proteínas são polímeros heterogêneos lineares essenciais a todos os organismos vivos. As proteínas apresentam diversas funções nos organismos, tais como: estruturação, catálise, síntese, transferências, entre tantas outras. Neste trabalho foram estudadas as proteínas que apresentam em suas estruturas nós do tipo 3-1. Foram calculadas as distâncias entre os carbonos alfa dessas proteínas e com estes valores foram traçados os gráficos de distâncias que permitem uma visualização geral da estrutura da proteína. Foram realizadas alterações no nó 31 padrão para que este se ajustasse à estrutura real da proteína na região do nó. A partir do gráfico de distâncias foi possível determinar a estrutura secundária presente na proteína, sendo que a alfa hélice apresenta oscilações de aproximadamente 5,5 angstrons. Com os gráficos de distâncias das proteínas e dos nós matemáticos foi possível comprovar a presença do nó e sua proximidade com a equação proposta.
publishDate 2016
dc.date.none.fl_str_mv 2016-10-21T20:00:33Z
2016-10-21T20:00:33Z
2016-08-31
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11449/144417
000874542
33004056083P7
4167514050938821
url http://hdl.handle.net/11449/144417
identifier_str_mv 000874542
33004056083P7
4167514050938821
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv repositoriounesp@unesp.br
_version_ 1854954810114048000

Registros relacionados