Ocorrência de Cryptosporidium spp. em psitacídeos exóticos mantidos em cativeiro nas regiões sul e sudeste do Brasil: avaliação de métodos de diagnóstico e classificação molecular

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2017
Autor(a) principal: Ferrari, Elís Domingos [UNESP]
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/152078
Resumo: O objetivo deste estudo foi avaliar a ocorrência e os métodos de diagnóstico para Cryptosporidium spp. em psitacídeos exóticos de cativeiro provenientes das regiões sul e sudeste do Brasil. A purificação dos oocistos nas amostras fecais de 463 psitacídeos foi realizada por meio de centrifugo-flutuação em solução de Sheather. Para análise microscópica, nós utilizamos a coloração negativa de verde malaquita. A amplificação de um fragmento parcial do gene 18S rRNA de Cryptosporidium spp. foi feita usando-se nested PCR seguida de sequenciamento dos fragmentos amplificados (nPCR/S). As amostras também foram testadas por meio de PCR duplex em tempo real, visando-se amplificar um fragmento do gene 18S rRNA de Cryptosporidium galli e Cryptosporidium genótipo III de aves. A ocorrência de Cryptosporidium spp. pela microscopia e nested PCR (nPCR) foi de 3, 02% (14/463) e 4, 97% (23/463), respectivamente. A nPCR/S demonstrou positividade de 1, 73% (8/463) para Cryptosporidium genótipo III de aves, 0, 86% (4/463) para Cryptosporidium parvum e 0, 22% (1/463) para Cryptosporidium canis. A PCR duplex em tempo real demonstrou positividade de 9, 50% (44/463) para as criptosporidiose gástrica, sendo 1, 94% (9/463) para C. galli, 5, 83% (27/463) para Cryptosporidium genótipo III de aves e 1, 73% (8/463) para infecções mistas. Não houve diferença estatística significante entre a positividade pela nPCR e microscopia (p = 0. 1237) e houve concordância justa entre elas (Kappa = 0. 242). Diferença estatística significante (p <0. 0001) e concordância justa (Kappa = 0. 317) foram obtidas nas comparações entre nPCR e PCR duplex em tempo real. Nós concluímos que a PCR duplex em tempo real é a melhor opção para o diagnóstico de criptosporidiose gástrica e que Cryptosporidium genótipo III de aves é o mais comum dentre as espécies/ genótipos de Cryptosporidium que acometem psitacídeos.
id UNSP_a14adda60c839c4eced5a223a717ba2b
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/152078
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str
spelling Ocorrência de Cryptosporidium spp. em psitacídeos exóticos mantidos em cativeiro nas regiões sul e sudeste do Brasil: avaliação de métodos de diagnóstico e classificação molecularPrevalence of cryptosporidium spp. in caged exotic psittacines from southern and southeastern brazil: evaluation of diagnostic methods and molecular characterizationCriptosporidioseReação em cadeia da polimeraseMicroscopiaPsittaciformesCryptosporidiosisPolymerase chain reactionMicroscopyO objetivo deste estudo foi avaliar a ocorrência e os métodos de diagnóstico para Cryptosporidium spp. em psitacídeos exóticos de cativeiro provenientes das regiões sul e sudeste do Brasil. A purificação dos oocistos nas amostras fecais de 463 psitacídeos foi realizada por meio de centrifugo-flutuação em solução de Sheather. Para análise microscópica, nós utilizamos a coloração negativa de verde malaquita. A amplificação de um fragmento parcial do gene 18S rRNA de Cryptosporidium spp. foi feita usando-se nested PCR seguida de sequenciamento dos fragmentos amplificados (nPCR/S). As amostras também foram testadas por meio de PCR duplex em tempo real, visando-se amplificar um fragmento do gene 18S rRNA de Cryptosporidium galli e Cryptosporidium genótipo III de aves. A ocorrência de Cryptosporidium spp. pela microscopia e nested PCR (nPCR) foi de 3, 02% (14/463) e 4, 97% (23/463), respectivamente. A nPCR/S demonstrou positividade de 1, 73% (8/463) para Cryptosporidium genótipo III de aves, 0, 86% (4/463) para Cryptosporidium parvum e 0, 22% (1/463) para Cryptosporidium canis. A PCR duplex em tempo real demonstrou positividade de 9, 50% (44/463) para as criptosporidiose gástrica, sendo 1, 94% (9/463) para C. galli, 5, 83% (27/463) para Cryptosporidium genótipo III de aves e 1, 73% (8/463) para infecções mistas. Não houve diferença estatística significante entre a positividade pela nPCR e microscopia (p = 0. 1237) e houve concordância justa entre elas (Kappa = 0. 242). Diferença estatística significante (p <0. 0001) e concordância justa (Kappa = 0. 317) foram obtidas nas comparações entre nPCR e PCR duplex em tempo real. Nós concluímos que a PCR duplex em tempo real é a melhor opção para o diagnóstico de criptosporidiose gástrica e que Cryptosporidium genótipo III de aves é o mais comum dentre as espécies/ genótipos de Cryptosporidium que acometem psitacídeos.The aim of this study was to evaluate the prevalence and diagnostic methods for Cryptosporidium spp. in caged adult exotic parrots from Southern and Southeastern Brazil. The oocyst purification in fecal samples from 463 psittacines was performed by centrifugal-flotation in Sheather's sugar solution. For microscopic analysis, we used malachite green negative staining. Amplification of a partial fragment of the 18S rRNA gene of Cryptosporidium spp. was accomplished using nested PCR (nPCR) followed by sequencing of the amplified fragments (nPCR/S). Samples were also tested by duplex real-time PCR targeting the 18S rRNA gene of Cryptosporidium galli and Cryptosporidium avian genotype III. The prevalence rates of Cryptosporidium spp. by microscopy and nPCR was 3. 02% (14/463) and 4. 97% (23/463), respectively. The nPCR/S showed positivity of 1. 73% (8/463) for Cryptosporidium avian genotype III, 0. 86% (4/463) for Cryptosporidium parvum and 0. 22% (1/463) for Cryptosporidium canis. Duplex real-time PCR showed a positivity of 9. 50% (44/463) for gastric cryptosporidiosis, 1. 94% (9/463) for C. galli, 5. 83% (27/463) for Cryptosporidium avian genotype III and 1. 73% (8/463) for mixed infections. There was no statistically significant difference between positivity for nPCR and microscopy (p = 0. 1237) and fair agreement between them (Kappa = 0. 242). A significant statistical difference (p <0. 0001) and fair agreement (Kappa = 0. 317) were obtained between nPCR and duplex real-time PCR. We found out that duplex real-time PCR is the best option for the diagnosis of gastric cryptosporidiosis and that Cryptosporidium avian genotype III is the most common Cryptosporidium species /genotype in psittacines.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)FAPESP: 2015/26334-8Universidade Estadual Paulista (Unesp)Meireles, Marcelo Vasconcelos [UNESP]Bresciani, Katia Denise Saraiva [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Ferrari, Elís Domingos [UNESP]2017-11-10T18:35:51Z2017-11-10T18:35:51Z2017-10-27info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11449/15207800089405033004021075P859505943668296470903513897615274porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESP2025-06-07T05:15:48Zoai:repositorio.unesp.br:11449/152078Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462025-06-07T05:15:48Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Ocorrência de Cryptosporidium spp. em psitacídeos exóticos mantidos em cativeiro nas regiões sul e sudeste do Brasil: avaliação de métodos de diagnóstico e classificação molecular
Prevalence of cryptosporidium spp. in caged exotic psittacines from southern and southeastern brazil: evaluation of diagnostic methods and molecular characterization
title Ocorrência de Cryptosporidium spp. em psitacídeos exóticos mantidos em cativeiro nas regiões sul e sudeste do Brasil: avaliação de métodos de diagnóstico e classificação molecular
spellingShingle Ocorrência de Cryptosporidium spp. em psitacídeos exóticos mantidos em cativeiro nas regiões sul e sudeste do Brasil: avaliação de métodos de diagnóstico e classificação molecular
Ferrari, Elís Domingos [UNESP]
Criptosporidiose
Reação em cadeia da polimerase
Microscopia
Psittaciformes
Cryptosporidiosis
Polymerase chain reaction
Microscopy
title_short Ocorrência de Cryptosporidium spp. em psitacídeos exóticos mantidos em cativeiro nas regiões sul e sudeste do Brasil: avaliação de métodos de diagnóstico e classificação molecular
title_full Ocorrência de Cryptosporidium spp. em psitacídeos exóticos mantidos em cativeiro nas regiões sul e sudeste do Brasil: avaliação de métodos de diagnóstico e classificação molecular
title_fullStr Ocorrência de Cryptosporidium spp. em psitacídeos exóticos mantidos em cativeiro nas regiões sul e sudeste do Brasil: avaliação de métodos de diagnóstico e classificação molecular
title_full_unstemmed Ocorrência de Cryptosporidium spp. em psitacídeos exóticos mantidos em cativeiro nas regiões sul e sudeste do Brasil: avaliação de métodos de diagnóstico e classificação molecular
title_sort Ocorrência de Cryptosporidium spp. em psitacídeos exóticos mantidos em cativeiro nas regiões sul e sudeste do Brasil: avaliação de métodos de diagnóstico e classificação molecular
author Ferrari, Elís Domingos [UNESP]
author_facet Ferrari, Elís Domingos [UNESP]
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Meireles, Marcelo Vasconcelos [UNESP]
Bresciani, Katia Denise Saraiva [UNESP]
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.author.fl_str_mv Ferrari, Elís Domingos [UNESP]
dc.subject.por.fl_str_mv Criptosporidiose
Reação em cadeia da polimerase
Microscopia
Psittaciformes
Cryptosporidiosis
Polymerase chain reaction
Microscopy
topic Criptosporidiose
Reação em cadeia da polimerase
Microscopia
Psittaciformes
Cryptosporidiosis
Polymerase chain reaction
Microscopy
description O objetivo deste estudo foi avaliar a ocorrência e os métodos de diagnóstico para Cryptosporidium spp. em psitacídeos exóticos de cativeiro provenientes das regiões sul e sudeste do Brasil. A purificação dos oocistos nas amostras fecais de 463 psitacídeos foi realizada por meio de centrifugo-flutuação em solução de Sheather. Para análise microscópica, nós utilizamos a coloração negativa de verde malaquita. A amplificação de um fragmento parcial do gene 18S rRNA de Cryptosporidium spp. foi feita usando-se nested PCR seguida de sequenciamento dos fragmentos amplificados (nPCR/S). As amostras também foram testadas por meio de PCR duplex em tempo real, visando-se amplificar um fragmento do gene 18S rRNA de Cryptosporidium galli e Cryptosporidium genótipo III de aves. A ocorrência de Cryptosporidium spp. pela microscopia e nested PCR (nPCR) foi de 3, 02% (14/463) e 4, 97% (23/463), respectivamente. A nPCR/S demonstrou positividade de 1, 73% (8/463) para Cryptosporidium genótipo III de aves, 0, 86% (4/463) para Cryptosporidium parvum e 0, 22% (1/463) para Cryptosporidium canis. A PCR duplex em tempo real demonstrou positividade de 9, 50% (44/463) para as criptosporidiose gástrica, sendo 1, 94% (9/463) para C. galli, 5, 83% (27/463) para Cryptosporidium genótipo III de aves e 1, 73% (8/463) para infecções mistas. Não houve diferença estatística significante entre a positividade pela nPCR e microscopia (p = 0. 1237) e houve concordância justa entre elas (Kappa = 0. 242). Diferença estatística significante (p <0. 0001) e concordância justa (Kappa = 0. 317) foram obtidas nas comparações entre nPCR e PCR duplex em tempo real. Nós concluímos que a PCR duplex em tempo real é a melhor opção para o diagnóstico de criptosporidiose gástrica e que Cryptosporidium genótipo III de aves é o mais comum dentre as espécies/ genótipos de Cryptosporidium que acometem psitacídeos.
publishDate 2017
dc.date.none.fl_str_mv 2017-11-10T18:35:51Z
2017-11-10T18:35:51Z
2017-10-27
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11449/152078
000894050
33004021075P8
5950594366829647
0903513897615274
url http://hdl.handle.net/11449/152078
identifier_str_mv 000894050
33004021075P8
5950594366829647
0903513897615274
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv repositoriounesp@unesp.br
_version_ 1854955041762312192