Estudo do coeficiente de difusão no enovelamento de proteínas na rede
| Ano de defesa: | 2007 |
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| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
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| Instituição de defesa: |
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: | |
| Palavras-chave em Inglês: | |
| Link de acesso: | http://hdl.handle.net/11449/87499 |
Resumo: | O enovelamento de proteinas é um problema fundamental em Biofísica Molecular. O processo de enovelamento é, em geral, mapeado através de uma equação de difusão aplicada ao longo da coordenada de reação Q, a qual descreve o grau de similaridade de uma determinada configuração com o estado nativo da proteína. Os tempos de enovelamento podem ser calculados a partir dos potenciais efetivos e do coeficiente de difusão D. Na literatura, D é assumido constante. Usando modelos de rede, mostramos neste trabalho variações desse coeficiente de difusão em função de Q e calculamos os novos tempos de enovelamento. |
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Oliveira, Ronaldo Junio de [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Araújo, Antonio Francisco Pereira deCaliri, AntonioLeite, Vitor Barbanti Pereira [UNESP]Chahine, Jorge [UNESP]2014-06-11T19:22:54Z2014-06-11T19:22:54Z2007-03-30OLIVEIRA, Ronaldo Junio de. Estudo do coeficiente de difusão no enovelamento de proteínas na rede. 2007. 78 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual Paulista, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, 2007.http://hdl.handle.net/11449/87499000490499oliveira_rj_me_sjrp.pdf33004153068P905000341747857961518826294347383O enovelamento de proteinas é um problema fundamental em Biofísica Molecular. O processo de enovelamento é, em geral, mapeado através de uma equação de difusão aplicada ao longo da coordenada de reação Q, a qual descreve o grau de similaridade de uma determinada configuração com o estado nativo da proteína. Os tempos de enovelamento podem ser calculados a partir dos potenciais efetivos e do coeficiente de difusão D. Na literatura, D é assumido constante. Usando modelos de rede, mostramos neste trabalho variações desse coeficiente de difusão em função de Q e calculamos os novos tempos de enovelamento.The protein folding is a fundamental problem in Molecular Biophysics. The folding process is, in general, mapped in a diffusion equation through the reaction coordinate Q, that is the similarity degree of a state with the native state. The folding times can be calculated with effective potencials and the diffusion coef- ficient D. In the literature, D is assumed constant. Using lattice models, we show in this work its variations in function of Q and we calculate the new folding times.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)78 f. : il.porUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Alephreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPProteínas - EstruturaMetodo de Monte CarloCoeficiente de difusãoEnovelamento de proteínasDiffusion coefficientFolding timeLattice modelProtein foldingEstudo do coeficiente de difusão no enovelamento de proteínas na redeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessBiofísica Molecular - IBILCEBiofísica molecularUniversidade Estadual Paulista (UNESP), Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas, São José do Rio Preto05000341747857961518826294347383Publication43c38943-bd6f-4fb6-a9a5-8482a1f632c0virtual::295950-143c38943-bd6f-4fb6-a9a5-8482a1f632c0virtual::295950-15fd779aa-d3ec-4c8d-8834-8c88dba98a9fvirtual::306281-15fd779aa-d3ec-4c8d-8834-8c88dba98a9fvirtual::306281-1ORIGINALoliveira_rj_me_sjrp.pdfapplication/pdf1282528https://repositorio.unesp.br/bitstreams/22f44674-25b3-4a11-9dea-e998cf09483e/downloadf1be25a39f095b823d25acad1b0e4ae8MD51trueAnonymousREADTEXToliveira_rj_me_sjrp.pdf.txtWritten by FormatFilter org.dspace.app.mediafilter.TikaTextExtractionFilter on 2024-01-01T06:17:29Z (GMT).Extracted texttext/plain103731https://repositorio.unesp.br/bitstreams/8d9146ad-13aa-45ae-bf90-70fcba460b3d/downloadefe15ec4d051ebb2ca6f45bb4535847eMD54falseAnonymousREADTHUMBNAILoliveira_rj_me_sjrp.pdf.jpgWritten by FormatFilter org.dspace.app.mediafilter.ImageMagickPdfThumbnailFilter on 2016-11-12T09:11:28Z (GMT).IM Thumbnailimage/jpeg4683https://repositorio.unesp.br/bitstreams/ae039d87-6575-45b3-b68f-d9bcd39b4241/download7d18e4ae8925b70d7a559dac5adcf463MD53falseAnonymousREAD11449/874992026-08-04T05:01:23.221152Zopen.accessoai:repositorio.unesp.br:11449/87499https://repositorio.unesp.brRepositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462026-08-04T05:01:23Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false |
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O enovelamento de proteinas é um problema fundamental em Biofísica Molecular. O processo de enovelamento é, em geral, mapeado através de uma equação de difusão aplicada ao longo da coordenada de reação Q, a qual descreve o grau de similaridade de uma determinada configuração com o estado nativo da proteína. Os tempos de enovelamento podem ser calculados a partir dos potenciais efetivos e do coeficiente de difusão D. Na literatura, D é assumido constante. Usando modelos de rede, mostramos neste trabalho variações desse coeficiente de difusão em função de Q e calculamos os novos tempos de enovelamento. |
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