Efeito da suplementação na fase de cria sobre a expressão gênica, processos e vias relacionadas à adipogênese e lipogênese do músculo longissimus thoracis ao desmame em bovinos f1 angus-nelore

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2023
Autor(a) principal: Ganga, Maria Júllia Generoso [UNESP]
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/242590
Resumo: Diferentes estratégicas têm sido utilizadas para aumentar a deposição de gordura intramuscular na carne produzida no Brasil, a partir, principalmente do Nelore (Bos indicus) e de seus cruzamentos, visando melhorar a qualidade do produto final e, dessa forma, atender mercados mais exigentes. Uma dessas estratégias é a suplementação na fase de cria por meio de creep feeding. Entretanto, são poucas as pesquisas que avaliaram o efeito do creep feeding sobre a expressão gênica no tecido muscular à desmama de bovinos Nelore e em seus cruzamentos com raças taurinas (Bos taurus). Assim, este estudo teve como objetivo identificar, a partir de análise do transcriptoma, genes diferencialmente expressos, processos biológicos e vias metabólicas relacionadas à adipogêneses e lipogênese em biópsias musculares colhidas à desmama de bovinos cruzados submetidos à diferentes dietas entre o nascimento e os 210 dias de vida. Foram utilizados 48 bovinos cruzados F1 Angus-Nelore machos, não castrados, meio-irmãos, mantidos a partir dos 30 dias de idade até o desmame sob dois diferentes tratamentos (n = 24/tratamento): grupo 1 (G1) – sem suplementação em creep feeding; e G2 – com suplementação em creep feeding. Os animais foram desmamados aos 210 dias, e, em seguida, foram confinados por 180 dias em baias coletivas (três animais/baia) recebendo dieta contendo 12,6% de volumoso e 87,4% de concentrado a base de milho. À desmama foi realizada coleta de alíquotas do músculo Longissimus thoracis (LT) por meio de biópsia. Ao longo do abate foram coletadas amostras (bifes de contra-filé) do LT entre as 12ª e 13ª costelas da meia-carcaça esquerda, a partir das quais foram determinados: área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), índice de marmorização (IMF), lipídeos totais/porcentagem de gordura (%G) e força de cisalhamento aos sete e 14 dias de maturação (SF7 e SF14). A partir das alíquotas do LT das biópsias foram analisadas diferenças na expressão gênica global entre os tratamentos (G1 vs G2 – 12 indivíduos/grupo) no momento da desmama por meio da técnica de sequenciamento do RNA mensageiro (RNA-Seq). Em relação à %G e IMF, os animais de G2 apresentaram valores maiores (4,95±0,20 vs 5,80±0,23; 321,50±13,65 vs 366,11±12,39, respectivamente) quando comparados com G1 (p<0,05). Foram identificados 947 genes diferencialmente expressos (DEGs) entre G1 e G2 à desmama, dos quais 443 foram regulados negativamente e 504 foram regulados positivamente no G2. As análises de enriquecimento funcional realizadas com os DEGs identificaram importantes genes, vias metabólicas (KEGG_PATHWAY) e processos biológicos (GOTERM_BP) relacionados à adipogênese e lipogênese (p<0,05), como: biossíntese de colesterol, sinalização de PPAR, metabolismo de ácidos graxos e biossíntese de ácidos graxos insaturados
id UNSP_a5a4f39001f62b32846cfd5506ac87ba
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/242590
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str
spelling Efeito da suplementação na fase de cria sobre a expressão gênica, processos e vias relacionadas à adipogênese e lipogênese do músculo longissimus thoracis ao desmame em bovinos f1 angus-neloreEffect of calf supplementation on gene expression, processes and pathways related to adipogenesis and lipogenesis of the longissimus thoracis muscle at weaning in f1 angus-nelore cattleDesmamaExpressão diferencialAdipogêneseQualidade de carneBos indicusNutrigenômicaNutrição animalDiferentes estratégicas têm sido utilizadas para aumentar a deposição de gordura intramuscular na carne produzida no Brasil, a partir, principalmente do Nelore (Bos indicus) e de seus cruzamentos, visando melhorar a qualidade do produto final e, dessa forma, atender mercados mais exigentes. Uma dessas estratégias é a suplementação na fase de cria por meio de creep feeding. Entretanto, são poucas as pesquisas que avaliaram o efeito do creep feeding sobre a expressão gênica no tecido muscular à desmama de bovinos Nelore e em seus cruzamentos com raças taurinas (Bos taurus). Assim, este estudo teve como objetivo identificar, a partir de análise do transcriptoma, genes diferencialmente expressos, processos biológicos e vias metabólicas relacionadas à adipogêneses e lipogênese em biópsias musculares colhidas à desmama de bovinos cruzados submetidos à diferentes dietas entre o nascimento e os 210 dias de vida. Foram utilizados 48 bovinos cruzados F1 Angus-Nelore machos, não castrados, meio-irmãos, mantidos a partir dos 30 dias de idade até o desmame sob dois diferentes tratamentos (n = 24/tratamento): grupo 1 (G1) – sem suplementação em creep feeding; e G2 – com suplementação em creep feeding. Os animais foram desmamados aos 210 dias, e, em seguida, foram confinados por 180 dias em baias coletivas (três animais/baia) recebendo dieta contendo 12,6% de volumoso e 87,4% de concentrado a base de milho. À desmama foi realizada coleta de alíquotas do músculo Longissimus thoracis (LT) por meio de biópsia. Ao longo do abate foram coletadas amostras (bifes de contra-filé) do LT entre as 12ª e 13ª costelas da meia-carcaça esquerda, a partir das quais foram determinados: área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), índice de marmorização (IMF), lipídeos totais/porcentagem de gordura (%G) e força de cisalhamento aos sete e 14 dias de maturação (SF7 e SF14). A partir das alíquotas do LT das biópsias foram analisadas diferenças na expressão gênica global entre os tratamentos (G1 vs G2 – 12 indivíduos/grupo) no momento da desmama por meio da técnica de sequenciamento do RNA mensageiro (RNA-Seq). Em relação à %G e IMF, os animais de G2 apresentaram valores maiores (4,95±0,20 vs 5,80±0,23; 321,50±13,65 vs 366,11±12,39, respectivamente) quando comparados com G1 (p<0,05). Foram identificados 947 genes diferencialmente expressos (DEGs) entre G1 e G2 à desmama, dos quais 443 foram regulados negativamente e 504 foram regulados positivamente no G2. As análises de enriquecimento funcional realizadas com os DEGs identificaram importantes genes, vias metabólicas (KEGG_PATHWAY) e processos biológicos (GOTERM_BP) relacionados à adipogênese e lipogênese (p<0,05), como: biossíntese de colesterol, sinalização de PPAR, metabolismo de ácidos graxos e biossíntese de ácidos graxos insaturadosDifferent strategies have been used to increase the intramuscular fat in beef produced in Brazil, mainly from Nellore (Bos indicus) and its crossings, to improve the final product. There are few researches evaluating the effect of the creep feeding, a cow-calf supplementation system, on gene expression in muscle tissue at weaning of Nellore cattle and in their crosses with taurine breeds (Bos taurus). Thus, this study will aim to identify, from transcriptome analysis, differentially expressed genes, biological processes and metabolic pathways related to adipogenesis and lipogenesis in muscle biopsies collected at weaning from crossbred cattle submitted to different diets in the cow-calf phase. Forty-eight male Angus-Nellore crossbred steers, not castrated, half-sibs, kept from 30 days of age until weaning under two different treatments (n = 24/treatment): group 1 (G1) - no creep feeding; G2 - creep feeding, were used. The animals were weaned at 210 days, and then finished in feedlot for 180 days receiving a diet containing 12.6% roughage and 87.4% corn based concentrate. With the Longissimus thoracis (LT) muscle samples of the left side of the carcass, collected at slaughter, were determined the fat percentage/total lipids (%F), and the marbling index (MI) of all animals of the two groups. At weaning, aliquots of LT muscle were collected by biopsy and the differences in gene expression between treatments (G1 vs G2 - 12 individuals/group) were investigated by RNA-Seq. The animals of both groups showed significant differences (p < 0.05) for %F (4.95±0.20 vs 5.80±0.23) and MI (321.50±13.65 vs 366.11±12.39). The weights at the beginning of the experiment and at slaughter (390 days) did not differ. Nine hundred and forty-seven differentially expressed genes (DEGs) were identified (log2 foldChange 0.5; FDR 5%) among the groups at weaning, 504 of which were up-regulated and 443 down-regulated in the G2. Regarding %Fat and MI, G2 animals related higher values (4.95 ± 0.20 vs 5.80 ± 0.23; 321.50 ± 13.65 vs 366.11 ± 12.39, respectively) when compared to G1 (p<0.05). We identified 947 differentially expressed genes (DEGs) between G1 and G2, of which 443 were down-regulated and 504 were up-regulated in G2. Functional enrichment analyses performed with the DEGs identified important genes, metabolic pathways (KEGG_PATHWAY) and biological processes (GOTERM_BP) related to adipogenesis and lipogenesis (p<0.05), such as: cholesterol biosynthesis, PPAR signaling, fatty acid metabolism and unsaturated fatty acid biosynthesisCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Universidade Estadual Paulista (Unesp)Curi, Rogério Abdallah [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Ganga, Maria Júllia Generoso [UNESP]2023-03-21T16:34:33Z2023-03-21T16:34:33Z2023-02-28info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11449/24259033004102030P4porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESP2025-10-22T06:17:02Zoai:repositorio.unesp.br:11449/242590Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462025-10-22T06:17:02Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Efeito da suplementação na fase de cria sobre a expressão gênica, processos e vias relacionadas à adipogênese e lipogênese do músculo longissimus thoracis ao desmame em bovinos f1 angus-nelore
Effect of calf supplementation on gene expression, processes and pathways related to adipogenesis and lipogenesis of the longissimus thoracis muscle at weaning in f1 angus-nelore cattle
title Efeito da suplementação na fase de cria sobre a expressão gênica, processos e vias relacionadas à adipogênese e lipogênese do músculo longissimus thoracis ao desmame em bovinos f1 angus-nelore
spellingShingle Efeito da suplementação na fase de cria sobre a expressão gênica, processos e vias relacionadas à adipogênese e lipogênese do músculo longissimus thoracis ao desmame em bovinos f1 angus-nelore
Ganga, Maria Júllia Generoso [UNESP]
Desmama
Expressão diferencial
Adipogênese
Qualidade de carne
Bos indicus
Nutrigenômica
Nutrição animal
title_short Efeito da suplementação na fase de cria sobre a expressão gênica, processos e vias relacionadas à adipogênese e lipogênese do músculo longissimus thoracis ao desmame em bovinos f1 angus-nelore
title_full Efeito da suplementação na fase de cria sobre a expressão gênica, processos e vias relacionadas à adipogênese e lipogênese do músculo longissimus thoracis ao desmame em bovinos f1 angus-nelore
title_fullStr Efeito da suplementação na fase de cria sobre a expressão gênica, processos e vias relacionadas à adipogênese e lipogênese do músculo longissimus thoracis ao desmame em bovinos f1 angus-nelore
title_full_unstemmed Efeito da suplementação na fase de cria sobre a expressão gênica, processos e vias relacionadas à adipogênese e lipogênese do músculo longissimus thoracis ao desmame em bovinos f1 angus-nelore
title_sort Efeito da suplementação na fase de cria sobre a expressão gênica, processos e vias relacionadas à adipogênese e lipogênese do músculo longissimus thoracis ao desmame em bovinos f1 angus-nelore
author Ganga, Maria Júllia Generoso [UNESP]
author_facet Ganga, Maria Júllia Generoso [UNESP]
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Curi, Rogério Abdallah [UNESP]
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.author.fl_str_mv Ganga, Maria Júllia Generoso [UNESP]
dc.subject.por.fl_str_mv Desmama
Expressão diferencial
Adipogênese
Qualidade de carne
Bos indicus
Nutrigenômica
Nutrição animal
topic Desmama
Expressão diferencial
Adipogênese
Qualidade de carne
Bos indicus
Nutrigenômica
Nutrição animal
description Diferentes estratégicas têm sido utilizadas para aumentar a deposição de gordura intramuscular na carne produzida no Brasil, a partir, principalmente do Nelore (Bos indicus) e de seus cruzamentos, visando melhorar a qualidade do produto final e, dessa forma, atender mercados mais exigentes. Uma dessas estratégias é a suplementação na fase de cria por meio de creep feeding. Entretanto, são poucas as pesquisas que avaliaram o efeito do creep feeding sobre a expressão gênica no tecido muscular à desmama de bovinos Nelore e em seus cruzamentos com raças taurinas (Bos taurus). Assim, este estudo teve como objetivo identificar, a partir de análise do transcriptoma, genes diferencialmente expressos, processos biológicos e vias metabólicas relacionadas à adipogêneses e lipogênese em biópsias musculares colhidas à desmama de bovinos cruzados submetidos à diferentes dietas entre o nascimento e os 210 dias de vida. Foram utilizados 48 bovinos cruzados F1 Angus-Nelore machos, não castrados, meio-irmãos, mantidos a partir dos 30 dias de idade até o desmame sob dois diferentes tratamentos (n = 24/tratamento): grupo 1 (G1) – sem suplementação em creep feeding; e G2 – com suplementação em creep feeding. Os animais foram desmamados aos 210 dias, e, em seguida, foram confinados por 180 dias em baias coletivas (três animais/baia) recebendo dieta contendo 12,6% de volumoso e 87,4% de concentrado a base de milho. À desmama foi realizada coleta de alíquotas do músculo Longissimus thoracis (LT) por meio de biópsia. Ao longo do abate foram coletadas amostras (bifes de contra-filé) do LT entre as 12ª e 13ª costelas da meia-carcaça esquerda, a partir das quais foram determinados: área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), índice de marmorização (IMF), lipídeos totais/porcentagem de gordura (%G) e força de cisalhamento aos sete e 14 dias de maturação (SF7 e SF14). A partir das alíquotas do LT das biópsias foram analisadas diferenças na expressão gênica global entre os tratamentos (G1 vs G2 – 12 indivíduos/grupo) no momento da desmama por meio da técnica de sequenciamento do RNA mensageiro (RNA-Seq). Em relação à %G e IMF, os animais de G2 apresentaram valores maiores (4,95±0,20 vs 5,80±0,23; 321,50±13,65 vs 366,11±12,39, respectivamente) quando comparados com G1 (p<0,05). Foram identificados 947 genes diferencialmente expressos (DEGs) entre G1 e G2 à desmama, dos quais 443 foram regulados negativamente e 504 foram regulados positivamente no G2. As análises de enriquecimento funcional realizadas com os DEGs identificaram importantes genes, vias metabólicas (KEGG_PATHWAY) e processos biológicos (GOTERM_BP) relacionados à adipogênese e lipogênese (p<0,05), como: biossíntese de colesterol, sinalização de PPAR, metabolismo de ácidos graxos e biossíntese de ácidos graxos insaturados
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-03-21T16:34:33Z
2023-03-21T16:34:33Z
2023-02-28
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11449/242590
33004102030P4
url http://hdl.handle.net/11449/242590
identifier_str_mv 33004102030P4
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv repositoriounesp@unesp.br
_version_ 1854954452819116032