Avaliação de riboswitch theo/metE para silenciamento gênico em Xanthomonas citri

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2018
Autor(a) principal: Bueno, Danilo [UNESP]
Orientador(a): Ferreira, Henrique [UNESP], Pedrolli, Daniele Biscaro [UNESP]
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Xac
Palavras-chave em Inglês:
Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/155005
Resumo: Estudos genéticos em qualquer organismo requerem ferramentas eficazes para se alterar a expressão gênica. Dentre estas, os riboswitches oferecem uma alternativa bastante atrativa para modulação da expressão de genes de interesse, onde é possível ligar e desligar tais genes sem a remoção dos mesmos dos genomas. Esta alternativa permite o estudo direto de um gene e a avaliação da sua falta (quando desligado ou “OFF”), bem como permite o reestabelecimento do selvagem sem a necessidade da complementação padrão (estado “ON”). Na busca por melhores condições de caracterização genética e do desenvolvimento de ferramentas dedicadas para estudos de genes essenciais ou de difícil caracterização em Xanthomonas citri, avaliamos o uso de um sistema de riboswitch theo/metE para o controle de expressão gênica nesta bactéria. A caracterização propriamente dita foi realizada alterando-se a expressão dos genes parB e α- amilase. O sucesso destas estratégias permitiu o silenciamento dos genes parB e e α-amilase, e ainda, foi possível observar que a inibição da transcrição do gene α-amilase refletiu em um decaimento da enzima α-amilase estando o riboswitch theo/metE na presença de seu metabólito alvo, a teofilina. Os resultados indicam que o riboswitch theo/metE utilizado neste estudo é uma ferramenta genética em potencial para silenciamento gênico em Xac.
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spelling Bueno, Danilo [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Moraes, Karen Cristiane Martinez deMartins, Paula Maria MoreiraFerreira, Henrique [UNESP]Pedrolli, Daniele Biscaro [UNESP]2018-08-30T16:56:35Z2018-08-30T16:56:35Z2018-07-27http://hdl.handle.net/11449/15500500090735133004137041P2Estudos genéticos em qualquer organismo requerem ferramentas eficazes para se alterar a expressão gênica. Dentre estas, os riboswitches oferecem uma alternativa bastante atrativa para modulação da expressão de genes de interesse, onde é possível ligar e desligar tais genes sem a remoção dos mesmos dos genomas. Esta alternativa permite o estudo direto de um gene e a avaliação da sua falta (quando desligado ou “OFF”), bem como permite o reestabelecimento do selvagem sem a necessidade da complementação padrão (estado “ON”). Na busca por melhores condições de caracterização genética e do desenvolvimento de ferramentas dedicadas para estudos de genes essenciais ou de difícil caracterização em Xanthomonas citri, avaliamos o uso de um sistema de riboswitch theo/metE para o controle de expressão gênica nesta bactéria. A caracterização propriamente dita foi realizada alterando-se a expressão dos genes parB e α- amilase. O sucesso destas estratégias permitiu o silenciamento dos genes parB e e α-amilase, e ainda, foi possível observar que a inibição da transcrição do gene α-amilase refletiu em um decaimento da enzima α-amilase estando o riboswitch theo/metE na presença de seu metabólito alvo, a teofilina. Os resultados indicam que o riboswitch theo/metE utilizado neste estudo é uma ferramenta genética em potencial para silenciamento gênico em Xac.Genetic studies in any organism requires effective tools to change gene expression. Among these, the riboswitches offer a very attractive alternative to modulation of the expression of genes of interest, where it is possible to turn on and turn off such genes without removing them from the genomes. This alternative allows the direct study of a gene and the evaluation of its lack (when disconnected or "off"), as well as it allows the reestablishment without the necessity of the standard complementation (state "ON"). In the search for better conditions of genetic characterization and the development of tools dedicated to studies of essential genes or of difficult characterization in Xanthomonas citri, we evaluate the use of a system of riboswitch theo/metE for the control of gene expression in this bacteria. The characterization itself was performed by altering the expression of the parB and α-amylase genes. The success of these strategies allowed the silencing of parB and α-amylase genes, and it was also possible to observe that the inhibition of the transcription of the α-amylase gene reflected in a decay of the α-amylase enzyme while the riboswitch theo/metE in the presence of his target metabolite, theophylline. The results indicate that the riboswitch theo/metE used in this study is a potential genetic tool for gene silencing in XAC.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)FAPESP: 2016/18519-0porUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Ferramenta genéticaExpressão gênicaXacCancro cítricoGenetic toolGene expressionCitrus cankerAvaliação de riboswitch theo/metE para silenciamento gênico em Xanthomonas citriEvaluation of riboswitch theo/metE for gene silencing in Xanthomonas citriinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPCiências Biológicas (Microbiologia Aplicada) - IBRCMicrobiologia aplicadaGenética molecular e de microrganismosUniversidade Estadual Paulista (UNESP), Instituto de Biociências, Rio ClaroOnlinePublicationeecebc66-0524-4365-8462-6103e1c979devirtual::246431-1eecebc66-0524-4365-8462-6103e1c979devirtual::246431-1ORIGINALbueno_d_me_rcla.pdfbueno_d_me_rcla.pdfapplication/pdf2640560https://repositorio.unesp.br/bitstreams/d2e6d28a-bbcb-4888-b690-5eef22c82310/downloadcfc66bb697d017d7732a7480dcc983e4MD55trueAnonymousREADLICENSElicense.txtWritten by org.dspace.content.LicenseUtilstext/plain; charset=utf-83038https://repositorio.unesp.br/bitstreams/941e572e-785d-48c3-8393-f3d06f6c3da3/download463a9b0ce2be71a7c728d82087c1f0d7MD54falseAnonymousREADTEXTbueno_d_me_rcla.pdf.txtWritten by FormatFilter org.dspace.app.mediafilter.TikaTextExtractionFilter on 2024-01-10T06:29:37Z (GMT).Extracted texttext/plain82190https://repositorio.unesp.br/bitstreams/3451d008-dc43-4916-8736-e729c522a9ed/downloadedfaad6523f0843744999b41d2d6c9e5MD58falseAnonymousREADTHUMBNAILbueno_d_me_rcla.pdf.jpgWritten by FormatFilter org.dspace.app.mediafilter.ImageMagickPdfThumbnailFilter on 2018-08-31T06:06:53Z (GMT).IM Thumbnailimage/jpeg6243https://repositorio.unesp.br/bitstreams/27c45a01-7422-4533-b7f9-8de8a8869716/downloadf1678b46d7500496df79652c9002a47fMD57falseAnonymousREAD11449/1550052026-04-16T09:26:27.876403Zopen.accessoai:repositorio.unesp.br:11449/155005https://repositorio.unesp.brRepositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462026-04-16T09:26:27Repositório Institucional da UNESP - 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