Variabilidade genética e estruturação populacional do Bicudinho-do-brejo-paulista, Formicivora paludicola (aves: Thamnophilidae): uma espécie criticamente ameaçada do estado de São Paulo

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2014
Autor(a) principal: Camargo, Crisley de [UNESP]
Orientador(a): Wasko, Adriane Pinto [UNESP], Francisco, Mercival Roberto [UNESP], Silveira, Luis Fábio [UNESP]
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/113947
Resumo: Populações pequenas são mais susceptíveis aos efeitos causados por deriva genética e endocruzamento o que, geralmente, está associado à perda de variabilidade genética. Baixos níveis de diversidade genética podem resultar em drásticas consequências nos indivíduos, como alterações nas taxas de fertilidade e capacidade de se adaptar a mudanças ambientais. Embora estes fatores possam elevar o risco de extinção, o fluxo gênico pode balancear estes efeitos, mantendo a variabilidade genética e diminuindo a divergência entre populações. Deste modo, conhecer as características genéticas intra e interpopulacionais é essencial quando se trata da conservação de espécies ameaçadas. Marcadores moleculares, como microssatélites e SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), são importantes ferramentas para acessar níveis de variabilidade genética e padrões de fluxo gênico em populações e vêm sendo amplamente utilizados em espécies alvo de programas de conservação. O bicudinho-do-brejo-paulista (Formicivora paludicola) é uma pequena ave restrita a brejos da Mata Atlântica que foi recentemente descrita na região metropolitana da cidade de São Paulo. Ocorre em 15 localidades isoladas situadas nas bacias do Alto Tietê e do rio Paraíba do Sul e, especialmente devido à destruição do seu hábitat, já está classificada como “Criticamente em Perigo” no estado de São Paulo. Ações prioritárias para a conservação da espécie incluem estudos genéticos para estabelecer o monitoramento e o manejo das populações naturais. Visto isso, o presente trabalho teve como objetivo avaliar os níveis de variabilidade genética e os padrões de fluxo gênico de duas populações de bicudinho-do-brejo-paulista, visando fornecer subsídios para futuras estratégias de conservação a serem desenvolvidas para a espécie. Para tanto, foram analisados 9 loci de microssatélites espécie-específicos e ...
id UNSP_da38e33e66ee665d8a797a6f79a09b91
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/113947
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str
spelling Camargo, Crisley de [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Miyaki, Cristina YumiBelmonte-Lopes, RicardoWasko, Adriane Pinto [UNESP]Francisco, Mercival Roberto [UNESP]Silveira, Luis Fábio [UNESP]2015-01-26T13:21:24Z2015-01-26T13:21:24Z2014-04-23CAMARGO, Crisley de. Variabilidade genética e estruturação populacional do Bicudinho-do-brejo-paulista, Formicivora paludicola (aves: Thamnophilidae): uma espécie criticamente ameaçada do estado de São Paulo. 2014. 106 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências de Botucatu, 2014.http://hdl.handle.net/11449/113947000797009000797009.pdf33004064026P919268639173789090000-0003-4600-0367Populações pequenas são mais susceptíveis aos efeitos causados por deriva genética e endocruzamento o que, geralmente, está associado à perda de variabilidade genética. Baixos níveis de diversidade genética podem resultar em drásticas consequências nos indivíduos, como alterações nas taxas de fertilidade e capacidade de se adaptar a mudanças ambientais. Embora estes fatores possam elevar o risco de extinção, o fluxo gênico pode balancear estes efeitos, mantendo a variabilidade genética e diminuindo a divergência entre populações. Deste modo, conhecer as características genéticas intra e interpopulacionais é essencial quando se trata da conservação de espécies ameaçadas. Marcadores moleculares, como microssatélites e SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), são importantes ferramentas para acessar níveis de variabilidade genética e padrões de fluxo gênico em populações e vêm sendo amplamente utilizados em espécies alvo de programas de conservação. O bicudinho-do-brejo-paulista (Formicivora paludicola) é uma pequena ave restrita a brejos da Mata Atlântica que foi recentemente descrita na região metropolitana da cidade de São Paulo. Ocorre em 15 localidades isoladas situadas nas bacias do Alto Tietê e do rio Paraíba do Sul e, especialmente devido à destruição do seu hábitat, já está classificada como “Criticamente em Perigo” no estado de São Paulo. Ações prioritárias para a conservação da espécie incluem estudos genéticos para estabelecer o monitoramento e o manejo das populações naturais. Visto isso, o presente trabalho teve como objetivo avaliar os níveis de variabilidade genética e os padrões de fluxo gênico de duas populações de bicudinho-do-brejo-paulista, visando fornecer subsídios para futuras estratégias de conservação a serem desenvolvidas para a espécie. Para tanto, foram analisados 9 loci de microssatélites espécie-específicos e ...Small populations are more susceptible to genetic drift and inbreeding effects which, generally, can be associated to loss of genetic variability. Low levels of genetic diversity can result in severe effects in the individuals, as fertility alterations and capability of adaption to environmental changes. Although these factors can, in turn, increase the risk of extinction, gene flow may balance these effects, maintaining the genetic variability and reducing genetic divergences among populations. Therefore, it is essential to understand intra and inter population genetic data, in order to conserve threatened species. Molecular markers, such as microsatellites and SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), are reliable tools for assessing levels of genetic variability and patterns of gene flow in populations and have been widely used to analyze target species on conservation programs. The São Paulo marsh antwren (Formicivora paludicola) is a small bird restricted to marshes of Atlantic Forest that was recently described in the metropolitan region of São Paulo city. It occurs in 15 isolated localities spread on High Tietê and Paraíba do Sul River basins and, especially due to its habitat destruction, it is already considered as Critically Endangered in São Paulo State. Priorities actions for this species' conservation include genetic studies to establish the monitoring and management of natural populations. Therefore, the present study aimed to evaluate the genetic variability levels and the gene flow patterns of two populations of F. paludicola in order to support future conservation strategies for the species. As so, we analyzed 9 species-specific microsatellite loci and 8 additional heterologous loci, and also 1.227 SNPs loci that were developed by a RAD-seq (Restriction-site Associated DNA sequencing) approach. A total of 44 animals were collected in two marsh areas near Mogi das Cruzes city (MC) (N = 26) and Salesópolis city (SL) ...Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)FAPESP: 12/09105-7106 f.porUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Alephreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPAve - PopulaçãoEcologiaGenetica animalConservação biológicaAnimal geneticsVariabilidade genética e estruturação populacional do Bicudinho-do-brejo-paulista, Formicivora paludicola (aves: Thamnophilidae): uma espécie criticamente ameaçada do estado de São Pauloinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessCiências Biológicas (Genética) - IBBGenéticaGenética animalUniversidade Estadual Paulista (UNESP), Instituto de Biociências, Botucatu1926863917378909[1]0000-0003-4600-0367[1]Publicationab63624f-c491-4ac7-bd2c-767f17ac838dvirtual::152750-1ab63624f-c491-4ac7-bd2c-767f17ac838dvirtual::152750-1fa517d17-486d-47e0-80a6-213dd0cc52favirtual::200984-1fa517d17-486d-47e0-80a6-213dd0cc52favirtual::200984-1ORIGINAL000797009.pdfapplication/pdf866532https://repositorio.unesp.br/bitstreams/be6f8d0e-1b74-47f6-91e5-6786a0b28e6b/downloadb5f097eddd5228ec546977ffbbc583aaMD51trueAnonymousREADTEXT000797009.pdf.txtWritten by FormatFilter org.dspace.app.mediafilter.TikaTextExtractionFilter on 2024-01-11T06:25:18Z (GMT).Extracted texttext/plain102561https://repositorio.unesp.br/bitstreams/1ad3bcb9-c3f3-408b-a963-04eb3c7100b0/download7cb1c309a034801cbae9ac180f78bbf9MD54falseAnonymousREADTHUMBNAIL000797009.pdf.jpgWritten by FormatFilter org.dspace.app.mediafilter.ImageMagickPdfThumbnailFilter on 2016-11-10T17:36:51Z (GMT).IM Thumbnailimage/jpeg4463https://repositorio.unesp.br/bitstreams/0bdc12ce-1e1d-4e6f-9f73-fd544857a798/download9f51eae3cd839c92d43b2cff68ced8ceMD53falseAnonymousREAD11449/1139472026-03-11T14:24:50.792130Zopen.accessoai:repositorio.unesp.br:11449/113947https://repositorio.unesp.brRepositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462026-03-11T14:24:50Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.pt.fl_str_mv Variabilidade genética e estruturação populacional do Bicudinho-do-brejo-paulista, Formicivora paludicola (aves: Thamnophilidae): uma espécie criticamente ameaçada do estado de São Paulo
title Variabilidade genética e estruturação populacional do Bicudinho-do-brejo-paulista, Formicivora paludicola (aves: Thamnophilidae): uma espécie criticamente ameaçada do estado de São Paulo
spellingShingle Variabilidade genética e estruturação populacional do Bicudinho-do-brejo-paulista, Formicivora paludicola (aves: Thamnophilidae): uma espécie criticamente ameaçada do estado de São Paulo
Camargo, Crisley de [UNESP]
Ave - População
Ecologia
Genetica animal
Conservação biológica
Animal genetics
title_short Variabilidade genética e estruturação populacional do Bicudinho-do-brejo-paulista, Formicivora paludicola (aves: Thamnophilidae): uma espécie criticamente ameaçada do estado de São Paulo
title_full Variabilidade genética e estruturação populacional do Bicudinho-do-brejo-paulista, Formicivora paludicola (aves: Thamnophilidae): uma espécie criticamente ameaçada do estado de São Paulo
title_fullStr Variabilidade genética e estruturação populacional do Bicudinho-do-brejo-paulista, Formicivora paludicola (aves: Thamnophilidae): uma espécie criticamente ameaçada do estado de São Paulo
title_full_unstemmed Variabilidade genética e estruturação populacional do Bicudinho-do-brejo-paulista, Formicivora paludicola (aves: Thamnophilidae): uma espécie criticamente ameaçada do estado de São Paulo
title_sort Variabilidade genética e estruturação populacional do Bicudinho-do-brejo-paulista, Formicivora paludicola (aves: Thamnophilidae): uma espécie criticamente ameaçada do estado de São Paulo
author Camargo, Crisley de [UNESP]
author_facet Camargo, Crisley de [UNESP]
author_role author
dc.contributor.institution.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.committeeMember.none.fl_str_mv Miyaki, Cristina Yumi
Belmonte-Lopes, Ricardo
dc.contributor.author.fl_str_mv Camargo, Crisley de [UNESP]
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Wasko, Adriane Pinto [UNESP]
Francisco, Mercival Roberto [UNESP]
Silveira, Luis Fábio [UNESP]
contributor_str_mv Wasko, Adriane Pinto [UNESP]
Francisco, Mercival Roberto [UNESP]
Silveira, Luis Fábio [UNESP]
dc.subject.por.fl_str_mv Ave - População
Ecologia
Genetica animal
Conservação biológica
Animal genetics
topic Ave - População
Ecologia
Genetica animal
Conservação biológica
Animal genetics
description Populações pequenas são mais susceptíveis aos efeitos causados por deriva genética e endocruzamento o que, geralmente, está associado à perda de variabilidade genética. Baixos níveis de diversidade genética podem resultar em drásticas consequências nos indivíduos, como alterações nas taxas de fertilidade e capacidade de se adaptar a mudanças ambientais. Embora estes fatores possam elevar o risco de extinção, o fluxo gênico pode balancear estes efeitos, mantendo a variabilidade genética e diminuindo a divergência entre populações. Deste modo, conhecer as características genéticas intra e interpopulacionais é essencial quando se trata da conservação de espécies ameaçadas. Marcadores moleculares, como microssatélites e SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), são importantes ferramentas para acessar níveis de variabilidade genética e padrões de fluxo gênico em populações e vêm sendo amplamente utilizados em espécies alvo de programas de conservação. O bicudinho-do-brejo-paulista (Formicivora paludicola) é uma pequena ave restrita a brejos da Mata Atlântica que foi recentemente descrita na região metropolitana da cidade de São Paulo. Ocorre em 15 localidades isoladas situadas nas bacias do Alto Tietê e do rio Paraíba do Sul e, especialmente devido à destruição do seu hábitat, já está classificada como “Criticamente em Perigo” no estado de São Paulo. Ações prioritárias para a conservação da espécie incluem estudos genéticos para estabelecer o monitoramento e o manejo das populações naturais. Visto isso, o presente trabalho teve como objetivo avaliar os níveis de variabilidade genética e os padrões de fluxo gênico de duas populações de bicudinho-do-brejo-paulista, visando fornecer subsídios para futuras estratégias de conservação a serem desenvolvidas para a espécie. Para tanto, foram analisados 9 loci de microssatélites espécie-específicos e ...
publishDate 2014
dc.date.issued.fl_str_mv 2014-04-23
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-01-26T13:21:24Z
dc.date.available.fl_str_mv 2015-01-26T13:21:24Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv CAMARGO, Crisley de. Variabilidade genética e estruturação populacional do Bicudinho-do-brejo-paulista, Formicivora paludicola (aves: Thamnophilidae): uma espécie criticamente ameaçada do estado de São Paulo. 2014. 106 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências de Botucatu, 2014.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11449/113947
dc.identifier.aleph.none.fl_str_mv 000797009
dc.identifier.file.none.fl_str_mv 000797009.pdf
dc.identifier.capes.none.fl_str_mv 33004064026P9
dc.identifier.lattes.none.fl_str_mv 1926863917378909
dc.identifier.orcid.none.fl_str_mv 0000-0003-4600-0367
identifier_str_mv CAMARGO, Crisley de. Variabilidade genética e estruturação populacional do Bicudinho-do-brejo-paulista, Formicivora paludicola (aves: Thamnophilidae): uma espécie criticamente ameaçada do estado de São Paulo. 2014. 106 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências de Botucatu, 2014.
000797009
000797009.pdf
33004064026P9
1926863917378909
0000-0003-4600-0367
url http://hdl.handle.net/11449/113947
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 106 f.
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.source.none.fl_str_mv Aleph
reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unesp.br/bitstreams/be6f8d0e-1b74-47f6-91e5-6786a0b28e6b/download
https://repositorio.unesp.br/bitstreams/1ad3bcb9-c3f3-408b-a963-04eb3c7100b0/download
https://repositorio.unesp.br/bitstreams/0bdc12ce-1e1d-4e6f-9f73-fd544857a798/download
bitstream.checksum.fl_str_mv b5f097eddd5228ec546977ffbbc583aa
7cb1c309a034801cbae9ac180f78bbf9
9f51eae3cd839c92d43b2cff68ced8ce
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv repositoriounesp@unesp.br
_version_ 1878344126654578688