Caracterização fenotípica, mapeamento de QTL e análise de expressão de genes-candidatos de resistência de trigo a Magnaporthe oryzae

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2019
Autor(a) principal: Ferreira, Jéssica Rosset
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade de Passo Fundo
Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária – FAMV
Brasil
UPF
Programa de Pós-Graduação em Agronomia
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://repositorio.upf.br/handle/123456789/9272
Resumo: The infection of the head by Magnaporthe oryzae is the most dangerous form of wheat blast. The disease is found in Brazil, Bolivia Paraguay, Argentina, Bangladesh and India. The genetic resistance is the best control method of wheat blast. Many studies have been performed to identify wheat resistant genotypes and resistance genes to M. oryzae and to elucidate the mechanism involved in the M. oryzae-wheat interaction. The present work had as general aim to characterize the genetic resistance of wheat to M. oryzae. The specific aims were i) to identify the most efficient variables in the discrimination of genotypes; ii) to evaluate the presence of 2NS/2AS translocation in contrasting genotypes; iii) to identify resistance QTL to M. oryzae at the adult plant stage; and iv) to characterize resistance candidate genes in TILLING mutants and in RNAseq analyses. The severity of bleached spikletes, area under the disease progress curve and proportion of the average grain weight of the inoculated spike in relation to the controls were efficient in the classification of wheat genotypes. These variables should be considered for the characterization of the wheat in response to M. oryzae. Wheat blast resistant lacking the 2NS/2AS translocation were identified. This reinforces the need for studies aiming at the discovery of other genes and/or QTL involved in the resistance. Twelve QTL related to resistance and two with grain production were identified. As far as is known, this is the first QTL mapping of wheat conferring resistance to M. oryzae in the world. No change in the phenotype of wheat TILLING mutants was observed for HSP60 and WIR1b genes. The mutants for Caffeic Acid O-Methyltransferase presented alterations in the reaction to M. oryzae, in seedling and in adult plant stage. Sequencing of wheat head transcriptomes in response to inoculation revealed the molecular functions of heme binding, iron ion binding and oxidoreductase activity as the most representative in GO terms. Exclusively in the resistant genotype CBFusarium ENT014, 24 defense related genes were identified as differentially expressed. These studies allowed the identification of important variables for the characterization of the reaction of wheat genotypes to M. oryzae, resistance QTL and differentially expressed genes.
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The specific aims were i) to identify the most efficient variables in the discrimination of genotypes; ii) to evaluate the presence of 2NS/2AS translocation in contrasting genotypes; iii) to identify resistance QTL to M. oryzae at the adult plant stage; and iv) to characterize resistance candidate genes in TILLING mutants and in RNAseq analyses. The severity of bleached spikletes, area under the disease progress curve and proportion of the average grain weight of the inoculated spike in relation to the controls were efficient in the classification of wheat genotypes. These variables should be considered for the characterization of the wheat in response to M. oryzae. Wheat blast resistant lacking the 2NS/2AS translocation were identified. This reinforces the need for studies aiming at the discovery of other genes and/or QTL involved in the resistance. Twelve QTL related to resistance and two with grain production were identified. As far as is known, this is the first QTL mapping of wheat conferring resistance to M. oryzae in the world. No change in the phenotype of wheat TILLING mutants was observed for HSP60 and WIR1b genes. The mutants for Caffeic Acid O-Methyltransferase presented alterations in the reaction to M. oryzae, in seedling and in adult plant stage. Sequencing of wheat head transcriptomes in response to inoculation revealed the molecular functions of heme binding, iron ion binding and oxidoreductase activity as the most representative in GO terms. Exclusively in the resistant genotype CBFusarium ENT014, 24 defense related genes were identified as differentially expressed. These studies allowed the identification of important variables for the characterization of the reaction of wheat genotypes to M. oryzae, resistance QTL and differentially expressed genes.A infecção da espiga por Magnaporthe oryzae é a forma mais danosa da brusone do trigo. A doença é encontrada no Brasil, Bolívia, Paraguai, Argentina, Bangladesh e Índia. A resistência genética é o melhor método de controle da brusone do trigo, e muitos estudos vêm sendo realizados para identificar genótipos resistentes e genes de resistência de trigo a M. oryzae e elucidar os mecanismos envolvidos na interação M. oryzae-trigo. O presente trabalho teve como objetivo geral caracterizar a resistência genética de trigo a M. oryzae, e objetivos específicos i) identificar as variáveis mais eficientes na discriminação de genótipos; ii) avaliar a presença da translocação 2NS/2AS em genótipos contrastantes; iii) identificar QTL de resistência a M. oryzae no estádio de planta adulta; e, iv) caracterizar genes-candidatos de resistência em mutantes TILLING e em análises de RNA-seq. As variáveis severidade de espiguetas brancas, área abaixo da curva de progresso da doença e proporção do peso médio do grão de espigas inoculadas em relação às controle foram eficientes na classificação de genótipos de trigo e devem ser consideradas para a caracterização da resposta de trigo a M. oryzae. Genótipos de trigo resistentes a M. oryzae que não possuem a translocação 2NS/2AS foram identificados, reforçando a necessidade de estudos visando à descoberta de outros genes e/ou QTL envolvidos na resistência. Doze QTL relacionados com a resistência e dois com a produção de grãos foram identificados. Até onde se sabe, esse é o primeiro mapeamento de QTL de resistência de trigo a M. oryzae realizado no mundo. Não foi observada alteração do fenótipo dos mutantes TILLING de trigo para os genes HSP60 e WIR1b. Os mutantes para Caffeic Acid O-Methyltransferase apresentaram alteração na reação a M. oryzae, em planta jovem e em planta adulta. O sequenciamento dos transcriptomas de espigas de trigo em resposta à inoculação revelou as funções moleculares de ligação heme, ligação de íon ferro e atividade oxidorredutase como as mais representativas em termos GO. Exclusivamente no genótipo resistente CBFusarium ENT014, foram identificados como diferencialmente expressos 24 genes relacionados à defesa. Esses estudos permitiram a identificação de variáveis importantes para a caracterização da reação de genótipos de trigo a M. oryzae, de QTL de resistência e de genes diferencialmente expressos.Universidade de Passo FundoFaculdade de Agronomia e Medicina Veterinária – FAMVBrasilUPFPrograma de Pós-Graduação em AgronomiaDeuner, Carolina Cardosohttp://lattes.cnpq.br/3029556593136573Ferreira, Jéssica Rosset2025-06-20T16:41:55Z2019-04-02info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfapplication/pdfFERREIRA, Jéssica Rosset. Caracterização fenotípica, mapeamento de QTL e análise de expressão de genes-candidatos de resistência de trigo a Magnaporthe oryzae. 2019. 180 f. Tese (Doutorado em Agronomia) - Universidade de Passo Fundo, Passo Fundo, RS, 2019.https://repositorio.upf.br/handle/123456789/9272porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UPFinstname:Universidade de Passo Fundo (UPF)instacron:UPF2025-07-24T03:08:12Zoai:repositorio.upf.br:123456789/9272Repositório InstitucionalPRIhttp://repositorio.upf.br/oai/requestjucelei@upf.br||biblio@upf.bropendoar:16102025-07-24T03:08:12Repositório Institucional da UPF - Universidade de Passo Fundo (UPF)false
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