Microbiota da cavidade bucal associada à saúde e à cárie dentária : uma revisão sistemática da literatura e análise in silico de estudos clínicos

• Ano de defesa: 2024
• Autor(a) principal: Pagnussatti, Maria Eduarda Lisboa
• Orientador(a): Arthur, Rodrigo Alex
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Palavras-chave em Português: Microbiota; Saúde bucal; Cárie dentária; Biomarcadores
• Palavras-chave em Inglês: Oral microbiota; Oral health; Dental caries; Biomarkers
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/10183/275813

O objetivo geral dessa Tese de Doutorado é comparar o Microbiota da cavidade bucal de indivíduos livres de cárie com indivíduos com doença cárie, tanto em nível taxonômico, quanto em nível funcional, na tentativa de identificar possíveis biomarcadores associados à saúde e/ou à cárie dentária. Essa Tese está dividida em dois Capítulos. O Capítulo 1 descreve uma revisão sistemática realizada de acordo com o guideline PRISMA com busca em sete diferentes bases de dados (MEDLINE/PUBMED, Web of Science, EMBASE, LILACS, SciELO, Scopus e Google Scholar) no ano de 2023 que incluiu ao final 54 estudos observacionais (43 estudos transversais e 11 estudos de coorte). Esses estudos avaliaram a composição do Microbiota da cavidade bucal (saliva e/ou placa dentária) por meio de métodos de sequenciamento de segunda geração (de forma direcionada ou não-direcionada) correspondendo à um total de 3.486 participantes (1.666 livres de cárie e 1.820 com cárie). O bacterioma da cavidade bucal foi avaliado em 51 estudos e o micobioma da cavidade bucal foi avaliado em 3 estudos. Apesar dos estudos serem bem distintos no que diz respeito às suas características metodológicas, a abundância de 87 gêneros bacterianos e 44 gêneros fúngicos foi reportada como sendo estatisticamente diferente entre indivíduos livres de cárie e indivíduos com cárie. Atopobium spp., Bifidobacterium spp., Capnocytophaga spp., Fusobacterium spp., Lactobacillus spp., Olsenella spp., Prevotella spp., Pseudomonas spp., Scardovia spp., Selenomonas spp., Streptococcus spp. and Veillonella spp. parecem ser mais abundantes na cavidade bucal de indivíduos que possuem cárie dentária, enquanto que parece não haver um padrão específico de distribuição do componente fúngico entre esses indivíduos. Diferentes padrões funcionais parecem estar mais relacionados ou às condições de saúde ou às condições de doença cárie. A qualidade metodológica da maioria dos estudos foi considerada como satisfatória. O Capítulo 2 trata-se de uma análise in silico de 4 estudos clínicos que avaliaram a composição do bacterioma da cavidade bucal (usando sequenciamento de segunda geração de forma direcionada) em indivíduos livres de cárie e em indivíduos com cárie. Os dados brutos referentes às amostras clínicas (saliva e/ou placa dentária) de 193 indivíduos livres de IV. cárie e de 174 indivíduos com cárie foram obtidos de repositórios digitais de domínio público. Análises de alfa-diversidade, beta-diversidade e abundância diferencial relativa foram realizadas através do software online MicrobiomeAnalyst e também com scripts desenvolvidos para o software R Studio. Alfa e beta diversidades mostraram-se diferentes estatisticamente entre indivíduos com cárie e livres de cárie (p<0,05). A análise da abundância relativa diferencial demonstrou que Lautropia spp., Neisseria spp., e Leptotrichia spp., são mais abundantes na cavidade bucal de indivíduos livres de cárie, enquanto que Capnocytophaga spp., Corynebacterium spp., Megasphaera spp., Prevotella spp., Saccharibacteria_genera_incertae_sedis, Selenomonas spp., Streptococcus spp. e Veillonella spp. estão presentes em maior abundância na cavidade bucal de indivíduos com cárie. O bacterioma da cavidade bucal de indivíduos livres de cárie também parece desempenhar funções que são diferentes em comparação com as funções desempenhadas pelo bacteriome de indivíduos com cárie. De forma geral, os resultados dessa Tese indicam que grupos de microrganismos, bem como padrões funcionais específicos codificados pela microbiota avaliada, são diferentemente abundantes na cavidade bucal entre indivíduos livres de cárie e indivíduos com cárie. Alguns microrganismos e padrões funcionais podem ser considerados como futuros candidatos a biomarcadores das condições de saúde ou de doença cárie. A validade clínica desses achados precisa ser confirmada por futuros estudos clínicos longitudinais e também estudos experimentais.