Conservação do RNA leucocitário para detecção da expressão do gene MDR1 em equinos da Raça Crioulo

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2013
Autor(a) principal: Lamberts, Marianne
Orientador(a): Natalini, Claudio Correa
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
RNA
Palavras-chave em Inglês:
Link de acesso: http://hdl.handle.net/10183/83486
Resumo: O estudo da expressão gênica é de grande aplicabilidade nas áreas de pesquisa científica e clínica. Por ser um método pouco invasivo e permitir coletas seriadas, a utilização de amostras sanguíneas facilita a análise da transcrição gênica. O maior desafio para a precisão nos ensaios moleculares é manter uma amostra com qualidade desde a coleta, armazenamento e transporte até o momento de sua análise. Este estudo utilizou um sistema de conservação de RNA sanguíneo que manteve amostras de qualidade após a coleta, transporte e armazenamento, permitindo extração de RNA e identificação da expressão do gene MDR1 em cavalos da raça Crioulo. Foram coletadas amostras sanguíneas de 27 cavalos a campo em tubos PAXgene® Blood RNA, que após o transporte e armazenamento a -20°C por 90 dias foram processadas em laboratório. A extração do RNA sanguíneo foi realizada com o kit Nucleo Spin® RNA II, a conversão em cDNA foi com o kit High-Capacity cDNA Reverse Transcription, utilizando a fluorimetria para as avaliações. A identificação da expressão do gene MDR1 em sangue conservado utilizou primer específico para cDNA e PCR em tempo real. Houve extração de RNA em todas as amostras coletadas, sendo que as leituras das concentrações de RNA das amostras com DNA contaminante não tiveram diferença estatística das amostras sem DNA contaminante. Ocorreu amplificação do gene MDR1 a partir do RNA das amostras, independente de contaminação de DNA. A coleta de sangue venoso dos cavalos a campo com os tubos PAXgene foi realizada sem complicações. A amplificação do mRNA com primer específico para transcrito do gene MDR1, de amostras submetidas aos métodos de coleta, armazenamento e processamento executados neste trabalho, confirma que o mRNA extraído, com a metodologia descrita, é viável, sendo sua expressão identificada em leucócitos sanguíneos de equinos da raça Crioulo.
id URGS_c0191704924cccd1a9ec556c604df2a4
oai_identifier_str oai:www.lume.ufrgs.br:10183/83486
network_acronym_str URGS
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
repository_id_str
spelling Lamberts, MarianneNatalini, Claudio Correa2013-12-10T01:49:17Z2013http://hdl.handle.net/10183/83486000906514O estudo da expressão gênica é de grande aplicabilidade nas áreas de pesquisa científica e clínica. Por ser um método pouco invasivo e permitir coletas seriadas, a utilização de amostras sanguíneas facilita a análise da transcrição gênica. O maior desafio para a precisão nos ensaios moleculares é manter uma amostra com qualidade desde a coleta, armazenamento e transporte até o momento de sua análise. Este estudo utilizou um sistema de conservação de RNA sanguíneo que manteve amostras de qualidade após a coleta, transporte e armazenamento, permitindo extração de RNA e identificação da expressão do gene MDR1 em cavalos da raça Crioulo. Foram coletadas amostras sanguíneas de 27 cavalos a campo em tubos PAXgene® Blood RNA, que após o transporte e armazenamento a -20°C por 90 dias foram processadas em laboratório. A extração do RNA sanguíneo foi realizada com o kit Nucleo Spin® RNA II, a conversão em cDNA foi com o kit High-Capacity cDNA Reverse Transcription, utilizando a fluorimetria para as avaliações. A identificação da expressão do gene MDR1 em sangue conservado utilizou primer específico para cDNA e PCR em tempo real. Houve extração de RNA em todas as amostras coletadas, sendo que as leituras das concentrações de RNA das amostras com DNA contaminante não tiveram diferença estatística das amostras sem DNA contaminante. Ocorreu amplificação do gene MDR1 a partir do RNA das amostras, independente de contaminação de DNA. A coleta de sangue venoso dos cavalos a campo com os tubos PAXgene foi realizada sem complicações. A amplificação do mRNA com primer específico para transcrito do gene MDR1, de amostras submetidas aos métodos de coleta, armazenamento e processamento executados neste trabalho, confirma que o mRNA extraído, com a metodologia descrita, é viável, sendo sua expressão identificada em leucócitos sanguíneos de equinos da raça Crioulo.Efficient nucleic acid extraction methods are paramount for gene expression studies and applications in the scientific and clinical research. Whole blood samples provide material for gene transcription analysis allowing serial trials with a not much invasive procedure. Still, a major challenge for molecular assays accuracy and reliability is to maintain RNA stability during sample collection and storage. A whole blood collection system for RNA preservation was used during collection, transport and storage of samples intended for RNA extraction and identification of the MDR1 gene in Crioulo horses. The blood samples were obtained from 27 horses in the field using the PAXgene® Blood RNA tubes. After 2h transport at room temperature, the samples were stored at -20oC for 90 days before processing. RNA extraction was performed with the Nucleo Spin® RNA II kit and cDNA conversion carried out with the High-Capacity cDNA Reverse Transcription kit. RNA concentration was determined by fluorometry. MDR1 gene expression was assessed using real time polymerase chain reaction (PCR) with a specific primer for cDNA. RNA was successfully extracted from all samples. Total RNA yield from DNA contaminated samples was not statistically different from those without DNA contamination. MDR1 gene amplification occurred regardless of DNA contamination. There were no complications during horse handling and blood sampling direct into PAXgene tubes in the field. Successful amplification of MDR1 gene transcript with a specific primer showed that blood samples collected, stored and processed under the described methodology provided viable mRNA for down-stream applications of molecular analyses. This study allowed the identification of the gene MDR1 in blood leucocytes of Crioulo horses.application/pdfporEquinosRNAEqüinos : Raça crioulaSangue : AnaliseReproducao animal : EquinosPAXgenemRNAMDR1HorsePreserved bloodConservação do RNA leucocitário para detecção da expressão do gene MDR1 em equinos da Raça CriouloPreservation of leucocyte RNA for detection of MDR1 gene expression in crioulo horses info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulFaculdade de VeterináriaPrograma de Pós-Graduação em Medicina Animal: EquinosPorto Alegre, BR-RS2013mestradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSTEXT000906514.pdf.txt000906514.pdf.txtExtracted Texttext/plain60579http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/83486/2/000906514.pdf.txt30067c98d142af85534ab8541089f054MD52ORIGINAL000906514.pdf000906514.pdfTexto completoapplication/pdf480661http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/83486/1/000906514.pdf7e1793534c04f99be1fcbb6f10346f0fMD51THUMBNAIL000906514.pdf.jpg000906514.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg986http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/83486/3/000906514.pdf.jpgaca317fa4b5428abcf5b2f823a8b3e34MD5310183/834862018-10-09 08:28:58.306oai:www.lume.ufrgs.br:10183/83486Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://lume.ufrgs.br/handle/10183/2PUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestlume@ufrgs.br||lume@ufrgs.bropendoar:18532018-10-09T11:28:58Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Conservação do RNA leucocitário para detecção da expressão do gene MDR1 em equinos da Raça Crioulo
dc.title.alternative.en.fl_str_mv Preservation of leucocyte RNA for detection of MDR1 gene expression in crioulo horses
title Conservação do RNA leucocitário para detecção da expressão do gene MDR1 em equinos da Raça Crioulo
spellingShingle Conservação do RNA leucocitário para detecção da expressão do gene MDR1 em equinos da Raça Crioulo
Lamberts, Marianne
Equinos
RNA
Eqüinos : Raça crioula
Sangue : Analise
Reproducao animal : Equinos
PAXgene
mRNA
MDR1
Horse
Preserved blood
title_short Conservação do RNA leucocitário para detecção da expressão do gene MDR1 em equinos da Raça Crioulo
title_full Conservação do RNA leucocitário para detecção da expressão do gene MDR1 em equinos da Raça Crioulo
title_fullStr Conservação do RNA leucocitário para detecção da expressão do gene MDR1 em equinos da Raça Crioulo
title_full_unstemmed Conservação do RNA leucocitário para detecção da expressão do gene MDR1 em equinos da Raça Crioulo
title_sort Conservação do RNA leucocitário para detecção da expressão do gene MDR1 em equinos da Raça Crioulo
author Lamberts, Marianne
author_facet Lamberts, Marianne
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Lamberts, Marianne
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Natalini, Claudio Correa
contributor_str_mv Natalini, Claudio Correa
dc.subject.por.fl_str_mv Equinos
RNA
Eqüinos : Raça crioula
Sangue : Analise
Reproducao animal : Equinos
topic Equinos
RNA
Eqüinos : Raça crioula
Sangue : Analise
Reproducao animal : Equinos
PAXgene
mRNA
MDR1
Horse
Preserved blood
dc.subject.eng.fl_str_mv PAXgene
mRNA
MDR1
Horse
Preserved blood
description O estudo da expressão gênica é de grande aplicabilidade nas áreas de pesquisa científica e clínica. Por ser um método pouco invasivo e permitir coletas seriadas, a utilização de amostras sanguíneas facilita a análise da transcrição gênica. O maior desafio para a precisão nos ensaios moleculares é manter uma amostra com qualidade desde a coleta, armazenamento e transporte até o momento de sua análise. Este estudo utilizou um sistema de conservação de RNA sanguíneo que manteve amostras de qualidade após a coleta, transporte e armazenamento, permitindo extração de RNA e identificação da expressão do gene MDR1 em cavalos da raça Crioulo. Foram coletadas amostras sanguíneas de 27 cavalos a campo em tubos PAXgene® Blood RNA, que após o transporte e armazenamento a -20°C por 90 dias foram processadas em laboratório. A extração do RNA sanguíneo foi realizada com o kit Nucleo Spin® RNA II, a conversão em cDNA foi com o kit High-Capacity cDNA Reverse Transcription, utilizando a fluorimetria para as avaliações. A identificação da expressão do gene MDR1 em sangue conservado utilizou primer específico para cDNA e PCR em tempo real. Houve extração de RNA em todas as amostras coletadas, sendo que as leituras das concentrações de RNA das amostras com DNA contaminante não tiveram diferença estatística das amostras sem DNA contaminante. Ocorreu amplificação do gene MDR1 a partir do RNA das amostras, independente de contaminação de DNA. A coleta de sangue venoso dos cavalos a campo com os tubos PAXgene foi realizada sem complicações. A amplificação do mRNA com primer específico para transcrito do gene MDR1, de amostras submetidas aos métodos de coleta, armazenamento e processamento executados neste trabalho, confirma que o mRNA extraído, com a metodologia descrita, é viável, sendo sua expressão identificada em leucócitos sanguíneos de equinos da raça Crioulo.
publishDate 2013
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2013-12-10T01:49:17Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2013
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10183/83486
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv 000906514
url http://hdl.handle.net/10183/83486
identifier_str_mv 000906514
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron:UFRGS
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron_str UFRGS
institution UFRGS
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
bitstream.url.fl_str_mv http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/83486/2/000906514.pdf.txt
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/83486/1/000906514.pdf
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/83486/3/000906514.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 30067c98d142af85534ab8541089f054
7e1793534c04f99be1fcbb6f10346f0f
aca317fa4b5428abcf5b2f823a8b3e34
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
repository.mail.fl_str_mv lume@ufrgs.br||lume@ufrgs.br
_version_ 1831315938391097344