Identificação de genes diferencialmente expressos em tomateiro induzidos por ácido salicílico e por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2007
Autor(a) principal: AMARAL, Daniel Oliveira Jordão do lattes
Orientador(a): RESENDE, Luciane Vilela
Banca de defesa: CARVALHO, Reginaldo de, NASCIMENTO, Ana Verônica Silva do, MARTINS, Luiza Suely Semen
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
dARK ID: ark:/57462/001300000778h
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal Rural de Pernambuco
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas
Departamento: Departamento de Agronomia
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6224
Resumo: To identify tomato plant (Lycopersicon esculentum Mill), cv. BRH, genes which answer to plant pathogen Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici and salicylic acid, the carrier molecule for activation of responses of plant defense, it was used the suppression subtractive hybridization (SSH) technique, from leaf cDNAs, 24h after salicylic acid, library denominated AS, and root cDNA, 72h after inoculation with F. oxysporum f. sp. lycopersici, incompatible interaction, library denominated FO. This work represents the first report of global gene expression of tomato plant induced by salicylic acid and F. oxysporum f. sp. lycopersici, using SSH technique; it was identified a total of 307 clones in the two subtractive libraries, being 143 obtained in the AS library and 164 in the FO library. Probable functions for genes were obtained by sequencing of clones and subsequent homology research at datas. These isolated genes are involved in several processes related to resistance against plant pathogen such as: hypersensitive response, programmed cell death, synthesis and transport of antimicrobial metabolites, signal perception and transduction, synthesis of pathogenesis-related proteins, lipid metabolism and selective degradation of proteins. It was identified in FO library a higher number of defense-related genes (26%) than in AS library (24%). In relation to the number of genes encoding antimicrobial proteins, they were only found in FO library (7%). However, genes involved in secondary compound metabolism were higher in AS library (13%) in relation to FO library (4%). These genes related to controlled degradation of proteins were also higher in AS library (3%) than in FO library (1%). The results suggest that the resistance of tomato plant induced by salicylic acid and by plant pathogen occur by distinct mechanisms.
id URPE_4629adf943e6f5a265f16a47dd4dc4eb
oai_identifier_str oai:tede2:tede2/6224
network_acronym_str URPE
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE
repository_id_str
spelling RESENDE, Luciane VilelaSILVA, Márcia Vanusa daCARVALHO, Reginaldo deNASCIMENTO, Ana Verônica Silva doMARTINS, Luiza Suely Semenhttp://lattes.cnpq.br/8143385880070542AMARAL, Daniel Oliveira Jordão do2017-02-07T16:48:16Z2007-06-14AMARAL, Daniel Oliveira Jordão do. Identificação de genes diferencialmente expressos em tomateiro induzidos por ácido salicílico e por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici. 2007. 88 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas) - Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife.http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6224ark:/57462/001300000778hTo identify tomato plant (Lycopersicon esculentum Mill), cv. BRH, genes which answer to plant pathogen Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici and salicylic acid, the carrier molecule for activation of responses of plant defense, it was used the suppression subtractive hybridization (SSH) technique, from leaf cDNAs, 24h after salicylic acid, library denominated AS, and root cDNA, 72h after inoculation with F. oxysporum f. sp. lycopersici, incompatible interaction, library denominated FO. This work represents the first report of global gene expression of tomato plant induced by salicylic acid and F. oxysporum f. sp. lycopersici, using SSH technique; it was identified a total of 307 clones in the two subtractive libraries, being 143 obtained in the AS library and 164 in the FO library. Probable functions for genes were obtained by sequencing of clones and subsequent homology research at datas. These isolated genes are involved in several processes related to resistance against plant pathogen such as: hypersensitive response, programmed cell death, synthesis and transport of antimicrobial metabolites, signal perception and transduction, synthesis of pathogenesis-related proteins, lipid metabolism and selective degradation of proteins. It was identified in FO library a higher number of defense-related genes (26%) than in AS library (24%). In relation to the number of genes encoding antimicrobial proteins, they were only found in FO library (7%). However, genes involved in secondary compound metabolism were higher in AS library (13%) in relation to FO library (4%). These genes related to controlled degradation of proteins were also higher in AS library (3%) than in FO library (1%). The results suggest that the resistance of tomato plant induced by salicylic acid and by plant pathogen occur by distinct mechanisms.Com o propósito de identificar genes no tomateiro (Lycopersicon esculentum Mill), cv. BRH, que respondem ao fitopatógeno Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici e ao ácido salicílico, molécula mensageira na ativação de resposta de defesa em plantas, foi utilizada a técnica de hibridização subtrativa por supressão (HSS), a partir de cDNAs de folhas, 24h após o tratamento com ácido salicílico, biblioteca denominada (AS), e cDNAs de raízes, 72h após a inoculação com Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, interação incompatível, biblioteca denominada (FO). Esse trabalho representa o primeiro relato da expressão gênica global no tomateiro induzido pelo ácido salicílico e pelo F. oxysporum f. sp. lycopersici, utilizando a técnica HSS. Foram identificados um total de 307 clones nas duas bibliotecas subtraídas, sendo 143 clones obtidos na biblioteca (AS) e 164 clones na biblioteca FO. As prováveis funções dos genes foram obtidas pelo sequenciamento dos clones e subseqüente pesquisa de homologia em bancos de dados. Os genes encontrados estão envolvidos em diversos processos relacionados à resistência contra fitopatógenos como: resposta de hipersensibilidade, morte celular programada, síntese e transporte de metabólicos antimicrobianos, percepção e transdução de sinal, síntese de proteínas relacionadas à patogênese, metabolismo de lipídeos e degradação controlada de proteínas. Foram identificados na biblioteca FO um número maior de genes implicados em mecanismos de defesa (26%), do que na biblioteca AS (24%). Em relação ao número de genes codificadores de proteínas antimicrobianas foram encontrados apenas na biblioteca FO (7%). Entretanto, os genes envolvidos no metabolismo de compostos secundários foi maior na biblioteca AS (13%) em relação a biblioteca FO (4%). Os genes relacionados a degradação controlada de proteínas também foi maior na biblioteca AS (3%) do que na biblioteca FO (1%). Os resultados obtidos sugerem que a resistência no tomateiro induzido pelo ácido salicílico e pelo patógeno ocorre por mecanismos distintos.Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-07T16:48:16Z No. of bitstreams: 1 Daniel Oliveira Jordao do Amaral.pdf: 1158857 bytes, checksum: e7a95fb82b8780bf1c190ef328318925 (MD5)Made available in DSpace on 2017-02-07T16:48:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Daniel Oliveira Jordao do Amaral.pdf: 1158857 bytes, checksum: e7a95fb82b8780bf1c190ef328318925 (MD5) Previous issue date: 2007-06-14application/pdfporUniversidade Federal Rural de PernambucoPrograma de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de PlantasUFRPEBrasilDepartamento de AgronomiaLycopersicum esculentumFusarium oxysporum f. sp. lycopersiciTomateGenética vegetalÁcido salicílicoHibridaçãoSalicylic acidSuppression subtractive hybridizationFITOTECNIA::MELHORAMENTO VEGETALIdentificação de genes diferencialmente expressos em tomateiro induzidos por ácido salicílico e por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersiciinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis-6234655866848882505600600600-68005538799722292052615607299470131967info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPEinstname:Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE)instacron:UFRPELICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82165http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/bitstream/tede2/6224/1/license.txtbd3efa91386c1718a7f26a329fdcb468MD51ORIGINALDaniel Oliveira Jordao do Amaral.pdfDaniel Oliveira Jordao do Amaral.pdfapplication/pdf1158857http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/bitstream/tede2/6224/2/Daniel+Oliveira+Jordao+do+Amaral.pdfe7a95fb82b8780bf1c190ef328318925MD52tede2/62242024-02-26 12:46:58.51oai:tede2:tede2/6224Tk9UQTogQ09MT1FVRSBBUVVJIEEgU1VBIFBSw5NQUklBIExJQ0VOw4dBCkVzdGEgbGljZW7Dp2EgZGUgZXhlbXBsbyDDqSBmb3JuZWNpZGEgYXBlbmFzIHBhcmEgZmlucyBpbmZvcm1hdGl2b3MuCgpMSUNFTsOHQSBERSBESVNUUklCVUnDh8ODTyBOw4NPLUVYQ0xVU0lWQQoKQ29tIGEgYXByZXNlbnRhw6fDo28gZGVzdGEgbGljZW7Dp2EsIHZvY8OqIChvIGF1dG9yIChlcykgb3UgbyB0aXR1bGFyIGRvcyBkaXJlaXRvcyBkZSBhdXRvcikgY29uY2VkZSDDoCBVbml2ZXJzaWRhZGUgClhYWCAoU2lnbGEgZGEgVW5pdmVyc2lkYWRlKSBvIGRpcmVpdG8gbsOjby1leGNsdXNpdm8gZGUgcmVwcm9kdXppciwgIHRyYWR1emlyIChjb25mb3JtZSBkZWZpbmlkbyBhYmFpeG8pLCBlL291IApkaXN0cmlidWlyIGEgc3VhIHRlc2Ugb3UgZGlzc2VydGHDp8OjbyAoaW5jbHVpbmRvIG8gcmVzdW1vKSBwb3IgdG9kbyBvIG11bmRvIG5vIGZvcm1hdG8gaW1wcmVzc28gZSBlbGV0csO0bmljbyBlIAplbSBxdWFscXVlciBtZWlvLCBpbmNsdWluZG8gb3MgZm9ybWF0b3Mgw6F1ZGlvIG91IHbDrWRlby4KClZvY8OqIGNvbmNvcmRhIHF1ZSBhIFNpZ2xhIGRlIFVuaXZlcnNpZGFkZSBwb2RlLCBzZW0gYWx0ZXJhciBvIGNvbnRlw7pkbywgdHJhbnNwb3IgYSBzdWEgdGVzZSBvdSBkaXNzZXJ0YcOnw6NvIApwYXJhIHF1YWxxdWVyIG1laW8gb3UgZm9ybWF0byBwYXJhIGZpbnMgZGUgcHJlc2VydmHDp8Ojby4KClZvY8OqIHRhbWLDqW0gY29uY29yZGEgcXVlIGEgU2lnbGEgZGUgVW5pdmVyc2lkYWRlIHBvZGUgbWFudGVyIG1haXMgZGUgdW1hIGPDs3BpYSBhIHN1YSB0ZXNlIG91IApkaXNzZXJ0YcOnw6NvIHBhcmEgZmlucyBkZSBzZWd1cmFuw6dhLCBiYWNrLXVwIGUgcHJlc2VydmHDp8Ojby4KClZvY8OqIGRlY2xhcmEgcXVlIGEgc3VhIHRlc2Ugb3UgZGlzc2VydGHDp8OjbyDDqSBvcmlnaW5hbCBlIHF1ZSB2b2PDqiB0ZW0gbyBwb2RlciBkZSBjb25jZWRlciBvcyBkaXJlaXRvcyBjb250aWRvcyAKbmVzdGEgbGljZW7Dp2EuIFZvY8OqIHRhbWLDqW0gZGVjbGFyYSBxdWUgbyBkZXDDs3NpdG8gZGEgc3VhIHRlc2Ugb3UgZGlzc2VydGHDp8OjbyBuw6NvLCBxdWUgc2VqYSBkZSBzZXUgCmNvbmhlY2ltZW50bywgaW5mcmluZ2UgZGlyZWl0b3MgYXV0b3JhaXMgZGUgbmluZ3XDqW0uCgpDYXNvIGEgc3VhIHRlc2Ugb3UgZGlzc2VydGHDp8OjbyBjb250ZW5oYSBtYXRlcmlhbCBxdWUgdm9jw6ogbsOjbyBwb3NzdWkgYSB0aXR1bGFyaWRhZGUgZG9zIGRpcmVpdG9zIGF1dG9yYWlzLCB2b2PDqiAKZGVjbGFyYSBxdWUgb2J0ZXZlIGEgcGVybWlzc8OjbyBpcnJlc3RyaXRhIGRvIGRldGVudG9yIGRvcyBkaXJlaXRvcyBhdXRvcmFpcyBwYXJhIGNvbmNlZGVyIMOgIFNpZ2xhIGRlIFVuaXZlcnNpZGFkZSAKb3MgZGlyZWl0b3MgYXByZXNlbnRhZG9zIG5lc3RhIGxpY2Vuw6dhLCBlIHF1ZSBlc3NlIG1hdGVyaWFsIGRlIHByb3ByaWVkYWRlIGRlIHRlcmNlaXJvcyBlc3TDoSBjbGFyYW1lbnRlIAppZGVudGlmaWNhZG8gZSByZWNvbmhlY2lkbyBubyB0ZXh0byBvdSBubyBjb250ZcO6ZG8gZGEgdGVzZSBvdSBkaXNzZXJ0YcOnw6NvIG9yYSBkZXBvc2l0YWRhLgoKQ0FTTyBBIFRFU0UgT1UgRElTU0VSVEHDh8ODTyBPUkEgREVQT1NJVEFEQSBURU5IQSBTSURPIFJFU1VMVEFETyBERSBVTSBQQVRST0PDjU5JTyBPVSAKQVBPSU8gREUgVU1BIEFHw4pOQ0lBIERFIEZPTUVOVE8gT1UgT1VUUk8gT1JHQU5JU01PIFFVRSBOw4NPIFNFSkEgQSBTSUdMQSBERSAKVU5JVkVSU0lEQURFLCBWT0PDiiBERUNMQVJBIFFVRSBSRVNQRUlUT1UgVE9ET1MgRSBRVUFJU1FVRVIgRElSRUlUT1MgREUgUkVWSVPDg08gQ09NTyAKVEFNQsOJTSBBUyBERU1BSVMgT0JSSUdBw4fDlUVTIEVYSUdJREFTIFBPUiBDT05UUkFUTyBPVSBBQ09SRE8uCgpBIFNpZ2xhIGRlIFVuaXZlcnNpZGFkZSBzZSBjb21wcm9tZXRlIGEgaWRlbnRpZmljYXIgY2xhcmFtZW50ZSBvIHNldSBub21lIChzKSBvdSBvKHMpIG5vbWUocykgZG8ocykgCmRldGVudG9yKGVzKSBkb3MgZGlyZWl0b3MgYXV0b3JhaXMgZGEgdGVzZSBvdSBkaXNzZXJ0YcOnw6NvLCBlIG7Do28gZmFyw6EgcXVhbHF1ZXIgYWx0ZXJhw6fDo28sIGFsw6ltIGRhcXVlbGFzIApjb25jZWRpZGFzIHBvciBlc3RhIGxpY2Vuw6dhLgo=Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede/PUBhttp://www.tede2.ufrpe.br:8080/oai/requestbdtd@ufrpe.br ||bdtd@ufrpe.bropendoar:2024-02-26T15:46:58Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE - Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE)false
dc.title.por.fl_str_mv Identificação de genes diferencialmente expressos em tomateiro induzidos por ácido salicílico e por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
title Identificação de genes diferencialmente expressos em tomateiro induzidos por ácido salicílico e por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
spellingShingle Identificação de genes diferencialmente expressos em tomateiro induzidos por ácido salicílico e por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
AMARAL, Daniel Oliveira Jordão do
Lycopersicum esculentum
Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
Tomate
Genética vegetal
Ácido salicílico
Hibridação
Salicylic acid
Suppression subtractive hybridization
FITOTECNIA::MELHORAMENTO VEGETAL
title_short Identificação de genes diferencialmente expressos em tomateiro induzidos por ácido salicílico e por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
title_full Identificação de genes diferencialmente expressos em tomateiro induzidos por ácido salicílico e por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
title_fullStr Identificação de genes diferencialmente expressos em tomateiro induzidos por ácido salicílico e por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
title_full_unstemmed Identificação de genes diferencialmente expressos em tomateiro induzidos por ácido salicílico e por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
title_sort Identificação de genes diferencialmente expressos em tomateiro induzidos por ácido salicílico e por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
author AMARAL, Daniel Oliveira Jordão do
author_facet AMARAL, Daniel Oliveira Jordão do
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv RESENDE, Luciane Vilela
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv SILVA, Márcia Vanusa da
dc.contributor.referee1.fl_str_mv CARVALHO, Reginaldo de
dc.contributor.referee2.fl_str_mv NASCIMENTO, Ana Verônica Silva do
dc.contributor.referee3.fl_str_mv MARTINS, Luiza Suely Semen
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/8143385880070542
dc.contributor.author.fl_str_mv AMARAL, Daniel Oliveira Jordão do
contributor_str_mv RESENDE, Luciane Vilela
SILVA, Márcia Vanusa da
CARVALHO, Reginaldo de
NASCIMENTO, Ana Verônica Silva do
MARTINS, Luiza Suely Semen
dc.subject.por.fl_str_mv Lycopersicum esculentum
Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
Tomate
Genética vegetal
Ácido salicílico
Hibridação
topic Lycopersicum esculentum
Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
Tomate
Genética vegetal
Ácido salicílico
Hibridação
Salicylic acid
Suppression subtractive hybridization
FITOTECNIA::MELHORAMENTO VEGETAL
dc.subject.eng.fl_str_mv Salicylic acid
Suppression subtractive hybridization
dc.subject.cnpq.fl_str_mv FITOTECNIA::MELHORAMENTO VEGETAL
description To identify tomato plant (Lycopersicon esculentum Mill), cv. BRH, genes which answer to plant pathogen Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici and salicylic acid, the carrier molecule for activation of responses of plant defense, it was used the suppression subtractive hybridization (SSH) technique, from leaf cDNAs, 24h after salicylic acid, library denominated AS, and root cDNA, 72h after inoculation with F. oxysporum f. sp. lycopersici, incompatible interaction, library denominated FO. This work represents the first report of global gene expression of tomato plant induced by salicylic acid and F. oxysporum f. sp. lycopersici, using SSH technique; it was identified a total of 307 clones in the two subtractive libraries, being 143 obtained in the AS library and 164 in the FO library. Probable functions for genes were obtained by sequencing of clones and subsequent homology research at datas. These isolated genes are involved in several processes related to resistance against plant pathogen such as: hypersensitive response, programmed cell death, synthesis and transport of antimicrobial metabolites, signal perception and transduction, synthesis of pathogenesis-related proteins, lipid metabolism and selective degradation of proteins. It was identified in FO library a higher number of defense-related genes (26%) than in AS library (24%). In relation to the number of genes encoding antimicrobial proteins, they were only found in FO library (7%). However, genes involved in secondary compound metabolism were higher in AS library (13%) in relation to FO library (4%). These genes related to controlled degradation of proteins were also higher in AS library (3%) than in FO library (1%). The results suggest that the resistance of tomato plant induced by salicylic acid and by plant pathogen occur by distinct mechanisms.
publishDate 2007
dc.date.issued.fl_str_mv 2007-06-14
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2017-02-07T16:48:16Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv AMARAL, Daniel Oliveira Jordão do. Identificação de genes diferencialmente expressos em tomateiro induzidos por ácido salicílico e por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici. 2007. 88 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas) - Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6224
dc.identifier.dark.fl_str_mv ark:/57462/001300000778h
identifier_str_mv AMARAL, Daniel Oliveira Jordão do. Identificação de genes diferencialmente expressos em tomateiro induzidos por ácido salicílico e por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici. 2007. 88 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas) - Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife.
ark:/57462/001300000778h
url http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6224
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.program.fl_str_mv -6234655866848882505
dc.relation.confidence.fl_str_mv 600
600
600
dc.relation.department.fl_str_mv -6800553879972229205
dc.relation.cnpq.fl_str_mv 2615607299470131967
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal Rural de Pernambuco
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFRPE
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
dc.publisher.department.fl_str_mv Departamento de Agronomia
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal Rural de Pernambuco
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE
instname:Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE)
instacron:UFRPE
instname_str Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE)
instacron_str UFRPE
institution UFRPE
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE
bitstream.url.fl_str_mv http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/bitstream/tede2/6224/1/license.txt
http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/bitstream/tede2/6224/2/Daniel+Oliveira+Jordao+do+Amaral.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv bd3efa91386c1718a7f26a329fdcb468
e7a95fb82b8780bf1c190ef328318925
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE - Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE)
repository.mail.fl_str_mv bdtd@ufrpe.br ||bdtd@ufrpe.br
_version_ 1865912907213045760