Meta-aprendizagem aplicada à classificação de dados de expressão gênica

• Ano de defesa: 2010
• Autor(a) principal: Souza, Bruno Feres de
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
• Palavras-chave em Português: Aprendizagem de máquina; Classificação de dados de expressão gênica; Gene expression data classification; Machine learning; Meta-aprendizagem; Metalearning
• Link de acesso: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-04012011-142551/

Dentre as aplicações mais comuns envolvendo microarrays, pode-se destacar a classificação de amostras de tecido, essencial para a identificação correta da ocorrência de câncer. Essa classificação é realizada com a ajuda de algoritmos de Aprendizagem de Máquina. A escolha do algoritmo mais adequado para um dado problema não é trivial. Nesta tese de doutorado, estudou-se a utilização de meta-aprendizagem como uma solução viável. Os resultados experimentais atestaram o sucesso da aplicação utilizando um arcabouço padrão para caracterização dos dados e para a construção da recomendação. A partir de então, buscou-se realizar melhorias nesses dois aspectos. Inicialmente, foi proposto um novo conjunto de meta-atributos baseado em índices de validação de agrupamentos. Em seguida, estendeu-se o método de construção de rankings kNN para ponderar a influência dos vizinhos mais próximos. No contexto de meta-regressão, introduziu-se o uso de SVMs para estimar o desempenho de algoritmos de classificação. Árvores de decisão também foram empregadas para a construção da recomendação de algoritmos. Ante seu desempenho inferior, empregou-se um esquema de comitês de árvores, que melhorou sobremaneira a qualidade dos resultados