O papel das DNA polimerases propensas a erro e da atividade das uracila DNA glicosilases na mutagênese espontânea em Caulobacter crescentus.

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2017
Autor(a) principal: Valencia, Alexy Orozco
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-25092018-172141/
Resumo: Neste trabalho desvendamos o papel das DNA polimerases dinB e dnaE2 em C. crescentus na mutagênese espontânea usando dois marcadores moleculares xylbla e CItet. Observamos que as taxas de mutação dos marcadores não variam significativamente entre dinB, dnaE2 e parental, coincidindo com os resultados prévios com o gene rpoB. As trocas de bases, tanto no gene cI, como em xylR, há um predomínio de mutações ATCG, como observado em rpoB, e diferente da região PxylX em xylbla. O gene xylR apresenta um hotspot que promove a inserção de uma citosina após a base 230. Neste marcador observamos que a presença de pequenas deleções (frameshifts-1) de uma base na cepa selvagem e dnaE2. Esse tipo de mutação não está presente na linhagem dinB. Esses resultados sugerem um papel importante de dinB na formação de deleções (frameshifts-1) in vivo em C. crescentus. Também observou-se que o agente 4-NQO não induz mutagênese em C. crescentus, ao contrário de E. coli. Também observamos pouca eficiência da atividade de uracila glicosilase em C. crescentus quando comparada com E. coli.
id USP_1c1489f592abe540d6877279dc641b4f
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-25092018-172141
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling O papel das DNA polimerases propensas a erro e da atividade das uracila DNA glicosilases na mutagênese espontânea em Caulobacter crescentus.The role of error-prone DNA polymerases and the activity of uracil DNA glycosylases on spontaneous mutagenesis in Caulobacter crescentus.C. crescentusC. crescentusDNA polimerasesDNA polymerasesMutagênese espontâneaSpontaneous mutagenesisNeste trabalho desvendamos o papel das DNA polimerases dinB e dnaE2 em C. crescentus na mutagênese espontânea usando dois marcadores moleculares xylbla e CItet. Observamos que as taxas de mutação dos marcadores não variam significativamente entre dinB, dnaE2 e parental, coincidindo com os resultados prévios com o gene rpoB. As trocas de bases, tanto no gene cI, como em xylR, há um predomínio de mutações ATCG, como observado em rpoB, e diferente da região PxylX em xylbla. O gene xylR apresenta um hotspot que promove a inserção de uma citosina após a base 230. Neste marcador observamos que a presença de pequenas deleções (frameshifts-1) de uma base na cepa selvagem e dnaE2. Esse tipo de mutação não está presente na linhagem dinB. Esses resultados sugerem um papel importante de dinB na formação de deleções (frameshifts-1) in vivo em C. crescentus. Também observou-se que o agente 4-NQO não induz mutagênese em C. crescentus, ao contrário de E. coli. Também observamos pouca eficiência da atividade de uracila glicosilase em C. crescentus quando comparada com E. coli.In this work we analyzed the role of DNA polymerases dinB and dnaE2 in spontaneous mutagenesis in C. crescentus, using two molecular markers: xylbla and Cltet. Our studies show that there is no significant difference in mutation rates in both markers between dinB, dnaE2 and wild type; this agrees with previous results using rpoB gene. Here, we report that there is a predominance of ATGC transitions in either cl gene or xylR, which was also shown in rpoB; however, this differs in PxylX region of xylbla. We also observed that xylR presents a mutation hotspot that promotes cytosine insertion after base 230.The presence of small one-base deletions (frameshifts-1) in wild typecbut ells, this type of mutation does not occur in the dinB strain. These results suggest an important role for dinB in the formation of deletions (frameshifts-1) in vivo in C. crescentus. We also saw that 4-NQO agent does not induce mutagenesis in C. crescentus, as it does in E. coli. Finally, the results demonstrate a poor efficiency in UDG activity in C. crescentus, when compared to E. coli.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPGalhardo, Rodrigo da SilvaValencia, Alexy Orozco2017-01-27info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-25092018-172141/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2020-09-24T16:00:09Zoai:teses.usp.br:tde-25092018-172141Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212020-09-24T16:00:09Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv O papel das DNA polimerases propensas a erro e da atividade das uracila DNA glicosilases na mutagênese espontânea em Caulobacter crescentus.
The role of error-prone DNA polymerases and the activity of uracil DNA glycosylases on spontaneous mutagenesis in Caulobacter crescentus.
title O papel das DNA polimerases propensas a erro e da atividade das uracila DNA glicosilases na mutagênese espontânea em Caulobacter crescentus.
spellingShingle O papel das DNA polimerases propensas a erro e da atividade das uracila DNA glicosilases na mutagênese espontânea em Caulobacter crescentus.
Valencia, Alexy Orozco
C. crescentus
C. crescentus
DNA polimerases
DNA polymerases
Mutagênese espontânea
Spontaneous mutagenesis
title_short O papel das DNA polimerases propensas a erro e da atividade das uracila DNA glicosilases na mutagênese espontânea em Caulobacter crescentus.
title_full O papel das DNA polimerases propensas a erro e da atividade das uracila DNA glicosilases na mutagênese espontânea em Caulobacter crescentus.
title_fullStr O papel das DNA polimerases propensas a erro e da atividade das uracila DNA glicosilases na mutagênese espontânea em Caulobacter crescentus.
title_full_unstemmed O papel das DNA polimerases propensas a erro e da atividade das uracila DNA glicosilases na mutagênese espontânea em Caulobacter crescentus.
title_sort O papel das DNA polimerases propensas a erro e da atividade das uracila DNA glicosilases na mutagênese espontânea em Caulobacter crescentus.
author Valencia, Alexy Orozco
author_facet Valencia, Alexy Orozco
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Galhardo, Rodrigo da Silva
dc.contributor.author.fl_str_mv Valencia, Alexy Orozco
dc.subject.por.fl_str_mv C. crescentus
C. crescentus
DNA polimerases
DNA polymerases
Mutagênese espontânea
Spontaneous mutagenesis
topic C. crescentus
C. crescentus
DNA polimerases
DNA polymerases
Mutagênese espontânea
Spontaneous mutagenesis
description Neste trabalho desvendamos o papel das DNA polimerases dinB e dnaE2 em C. crescentus na mutagênese espontânea usando dois marcadores moleculares xylbla e CItet. Observamos que as taxas de mutação dos marcadores não variam significativamente entre dinB, dnaE2 e parental, coincidindo com os resultados prévios com o gene rpoB. As trocas de bases, tanto no gene cI, como em xylR, há um predomínio de mutações ATCG, como observado em rpoB, e diferente da região PxylX em xylbla. O gene xylR apresenta um hotspot que promove a inserção de uma citosina após a base 230. Neste marcador observamos que a presença de pequenas deleções (frameshifts-1) de uma base na cepa selvagem e dnaE2. Esse tipo de mutação não está presente na linhagem dinB. Esses resultados sugerem um papel importante de dinB na formação de deleções (frameshifts-1) in vivo em C. crescentus. Também observou-se que o agente 4-NQO não induz mutagênese em C. crescentus, ao contrário de E. coli. Também observamos pouca eficiência da atividade de uracila glicosilase em C. crescentus quando comparada com E. coli.
publishDate 2017
dc.date.none.fl_str_mv 2017-01-27
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-25092018-172141/
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-25092018-172141/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815258449098833920