Investigação dos mecanismos patofisiológicos da síndrome de Treacher Collins

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Hsia, Gabriella Shih Ping
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-14022025-160205/
Resumo: Cerca de um terço de todos os defeitos congênitos envolvem malformações craniofaciais, representando um ônus para o sistema de saúde e enfatizando a importância de investigar os mecanismos causativos de síndromes craniofaciais. A síndrome de Treacher Collins (TCS) é uma disostose mandibulofacial que afeta um a cada 50.000 nascidos vivos. Ela é caracterizada por malformações craniofaciais como hipoplasia da mandíbula, dos arcos zigomáticos, fenda palatina e malformações no ouvido interno e médio. Essas estruturas são derivadas de células de crista neural (NCCs) que ocupam o primeiro e segundo arcos faríngeos. Grande variabilidade clínica inter- e intrafamiliar é observada em TCS, mas as causas ainda são desconhecidas. A maioria dos casos (~80-93%) é causada por haploinsuficiência de TCOF1 e uma menor porcentagem (~9%) por variantes patogênicas em POLR1B/C/D. TCOF1 codifica Treacle que, dentre diversas funções, atua na biogênese ribossomal e na resposta a dano de rDNA no nucléolo. POLR1B/C/D codificam subunidades das RNA Polimerases I e III, atuando na biogênese ribossomal também. Estudos em modelos animais para TCS demonstraram que a haploinsuficiência destes genes compromete funções celulares que, aliado ao aumento na produção de espécies reativas de oxigênio (ROS), levam à apoptose de células do neuroepitélio, as progenitoras das NCCs, comprometendo assim a formação de ossos e cartilagem craniofaciais. As mitocôndrias são uma das principais produtoras de ROS e mediam diversas funções celulares como a apoptose. Processos estes já vinculados à TCS, mas o papel mitocondrial na patogenicidade de TCS permanece inexplorado. Há também uma escassez de modelos in vitro para TCS com células de pacientes que permitem uma maior reprodutibilidade do tecido afetado e de mecanismos específicos da espécie. De forma a responder estas perguntas, nós desenvolvemos um estudo para investigar os mecanismos patofisiológicos da TCS utilizando células derivadas de pacientes. Nós estabelecemos e caracterizamos células pluripotentes induzidas (hiPSCs) de pacientes e geramos linhagens CRISPR TCOF1-knockout. Essas hiPSCs foram diferenciadas em células de borda de placa neural (NPB-like cells) e para osteoblastos. Adicionalmente, identificamos alterações no metabolismo mitocondrial, no DNAmit em células TCS, e que TCOF1 colocaliza com mitocôndrias em células em divisão e após exposição a um indutor de dano de DNA, sugerindo uma possível nova função de TCOF1 na dinâmica mitocondrial e/ou no reparo de DNAmit. Também providenciamos novas perspectivas acerca do fenótipo tecido-específico associado a TCS, uma vez que observamos alterações em vias de especificação de NC em células TCS NPB-like, e exploramos como esses mecanismos podem estar associados à osteogênese prematura também observada nessas células. Esses resultados suportam a hipótese de que a variabilidade clínica em TCS é decorrente da haploinsuficiência de TCOF1 ou POLR1B/C/D aliada a alterações mitocondriais e aumento na produção de ROS. Também providenciamos evidências da aplicabilidade de células derivadas de pacientes para estudar síndromes craniofaciais, e damos subsídios para futuros estudos que tenham por objetivo compreender as causas da variabilidade clínica em TCS.
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Grande variabilidade clínica inter- e intrafamiliar é observada em TCS, mas as causas ainda são desconhecidas. A maioria dos casos (~80-93%) é causada por haploinsuficiência de TCOF1 e uma menor porcentagem (~9%) por variantes patogênicas em POLR1B/C/D. TCOF1 codifica Treacle que, dentre diversas funções, atua na biogênese ribossomal e na resposta a dano de rDNA no nucléolo. POLR1B/C/D codificam subunidades das RNA Polimerases I e III, atuando na biogênese ribossomal também. Estudos em modelos animais para TCS demonstraram que a haploinsuficiência destes genes compromete funções celulares que, aliado ao aumento na produção de espécies reativas de oxigênio (ROS), levam à apoptose de células do neuroepitélio, as progenitoras das NCCs, comprometendo assim a formação de ossos e cartilagem craniofaciais. As mitocôndrias são uma das principais produtoras de ROS e mediam diversas funções celulares como a apoptose. Processos estes já vinculados à TCS, mas o papel mitocondrial na patogenicidade de TCS permanece inexplorado. Há também uma escassez de modelos in vitro para TCS com células de pacientes que permitem uma maior reprodutibilidade do tecido afetado e de mecanismos específicos da espécie. De forma a responder estas perguntas, nós desenvolvemos um estudo para investigar os mecanismos patofisiológicos da TCS utilizando células derivadas de pacientes. Nós estabelecemos e caracterizamos células pluripotentes induzidas (hiPSCs) de pacientes e geramos linhagens CRISPR TCOF1-knockout. Essas hiPSCs foram diferenciadas em células de borda de placa neural (NPB-like cells) e para osteoblastos. Adicionalmente, identificamos alterações no metabolismo mitocondrial, no DNAmit em células TCS, e que TCOF1 colocaliza com mitocôndrias em células em divisão e após exposição a um indutor de dano de DNA, sugerindo uma possível nova função de TCOF1 na dinâmica mitocondrial e/ou no reparo de DNAmit. Também providenciamos novas perspectivas acerca do fenótipo tecido-específico associado a TCS, uma vez que observamos alterações em vias de especificação de NC em células TCS NPB-like, e exploramos como esses mecanismos podem estar associados à osteogênese prematura também observada nessas células. Esses resultados suportam a hipótese de que a variabilidade clínica em TCS é decorrente da haploinsuficiência de TCOF1 ou POLR1B/C/D aliada a alterações mitocondriais e aumento na produção de ROS. Também providenciamos evidências da aplicabilidade de células derivadas de pacientes para estudar síndromes craniofaciais, e damos subsídios para futuros estudos que tenham por objetivo compreender as causas da variabilidade clínica em TCS.Craniofacial malformations comprise nearly one-third of all congenital birth defects representing a burden for the health care system and emphasizing the importance of investigating the causative mechanisms for craniofacial disorders. Treacher Collins syndrome (TCS) is a mandibulofacial dysostosis that affects one in 50,000 live births. It is characterized by craniofacial malformations such as hypoplasia of the mandible, of zygomatic arches, cleft palate and malformations in the internal and middle ear. These affected structures are derived from Neural Crest Cells (NCCs) that occupy the first and second pharyngeal arches. Large intra- and interfamilial clinical variability is observed in TCS, but the causes remain unknown. Most of the cases (~80-93%) are caused by haploinsufficiency of TCOF1 and a small percentage (~9%) in POLR1B/C/D. TCOF1 encodes Treacle that, among other cellular functions, acts in ribosome biogenesis and in rDNA damage response within nucleolus. POLR1B/C/D encodes subunits of RNA Polymerases I and III, thus, also having an important role in ribosome biogenesis. Studies in animal models for TCS demonstrated that haploinsufficiency of these genes impair cellular functions that allied with increased reactive oxygen species (ROS) result in apoptosis of neuroepithelium cells (progenitors of NCCs), compromising formation of craniofacial bones and cartilage. Mitochondria are one of the main sources of ROS and mediate several cellular functions, such as apoptosis. These processes have already been correlated with TCS, however, the mitochondrial role in TCS remains unaddressed. There has also been a lack of in vitro models for TCS with patient-derived cells, which allows a better reproducibility of the affected tissue and species-specific mechanisms. To address these gaps in literature we developed a study to investigate the pathophysiological mechanisms responsible for TCS using patient-derived cells. We established and characterized human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) from TCS patients, and generated CRISPR TCOF1-knockout (CRISPR TCOF1-KO) hiPSCs. These hiPSCs were also differentiated into neural plate border-like cells (NPB) and underwent osteogenic differentiation. Additionally, we identified alterations in mitochondrial metabolism, in mtDNA of TCS cells, and observed that TCOF1 colocalizes with mitochondria in diving cells and after exposure to a DNA damage inducer. Thus, suggesting a possible new role of TCOF1 in mitochondrial dynamics and/or mtDNA repair. We also provide novel insights into the tissue-specific phenotype associated with TCS, as we observed alterations in NCC fate specification in TCS NPB-like cells. Furthermore, we explore how these alterations could be correlated with premature osteogenesis also observed in TCS cells. Taken together, our results support the hypothesis that TCS clinical variability results from pathogenic variants in TCOF1 and POLR1 genes, combined with mitochondrial alterations and increased ROS production. We also provide evidence supporting the applicability of using patient-derived cells to study craniofacial syndromes and provide foundations for further studies that aim to understand the causes of clinical variability in TCS.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPBueno, Maria Rita dos Santos e PassosHsia, Gabriella Shih Ping2024-12-10info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-14022025-160205/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPReter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-02-17T20:49:01Zoai:teses.usp.br:tde-14022025-160205Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-02-17T20:49:01Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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