Estrutura populacional genética e história demográfica de Paroaria dominicana (Linnaeus, 1758; Aves: Thraupidae)

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2025
Autor(a) principal: Laterza, Isabela Munhós
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Resumo: O comércio ilegal de animais silvestres representa uma grande ameaça para muitas espécies de aves no Brasil. Uma das espécies mais frequentemente apreendidas no tráfico ilegal é o cardeal do-nordeste (Paroaria dominicana, Linnaeus, 1758), uma ave Thraupidae comum na Caatinga semiárida. Apesar da ameaça, não há muitas informações sobre a diversidade genética e a dinâmica populacional dessa espécie. No presente estudo, usamos a genotipagem por sequenciamento (GBS), um marcador mitocondrial (ND2) e modelagem de nicho para avaliar a estrutura genética da população e a história demográfica de P. dominicana. Encontramos quatro populações e leve evidência de isolamento por distância, bem como evidências de uma redução populacional anterior seguida de expansão recente. Os modelos de nicho indicaram que a espécie parece ter sofrido uma forte contração da área de distribuição durante o Último Máximo Glacial (cerca de 21.000 anos atrás) e uma leve expansão durante o Holoceno médio a tardio (cerca de 6.000 anos atrás). Nossos resultados ajudam a entender melhor a distribuição da diversidade genética de uma espécie da Caatinga que ocorre em todas as suas fitofisionomias e podem ajudar a orientar a liberação de indivíduos apreendidos para manter a diversidade genética nas gerações futuras.
id USP_4ab1dd4ff2ea29d58856a4a31fcc1afa
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-30062025-172023
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Estrutura populacional genética e história demográfica de Paroaria dominicana (Linnaeus, 1758; Aves: Thraupidae)Genetic population structure and demographic history of Paroaria dominicana (Linnaeus, 1758; Aves: Thraupidae)CaatingaCaatingaCardeal-do-nordesteDiversidade genéticaEstrutura populacionalGenetic diversityModelagem de nichoNiche ModellingPopulation structureRed-cowled cardinalO comércio ilegal de animais silvestres representa uma grande ameaça para muitas espécies de aves no Brasil. Uma das espécies mais frequentemente apreendidas no tráfico ilegal é o cardeal do-nordeste (Paroaria dominicana, Linnaeus, 1758), uma ave Thraupidae comum na Caatinga semiárida. Apesar da ameaça, não há muitas informações sobre a diversidade genética e a dinâmica populacional dessa espécie. No presente estudo, usamos a genotipagem por sequenciamento (GBS), um marcador mitocondrial (ND2) e modelagem de nicho para avaliar a estrutura genética da população e a história demográfica de P. dominicana. Encontramos quatro populações e leve evidência de isolamento por distância, bem como evidências de uma redução populacional anterior seguida de expansão recente. Os modelos de nicho indicaram que a espécie parece ter sofrido uma forte contração da área de distribuição durante o Último Máximo Glacial (cerca de 21.000 anos atrás) e uma leve expansão durante o Holoceno médio a tardio (cerca de 6.000 anos atrás). Nossos resultados ajudam a entender melhor a distribuição da diversidade genética de uma espécie da Caatinga que ocorre em todas as suas fitofisionomias e podem ajudar a orientar a liberação de indivíduos apreendidos para manter a diversidade genética nas gerações futuras.Illegal wildlife trafficking is a major threat for many bird species in Brazil. Among the most apprehended species is the red-cowled cardinal (Paroaria dominicana, Linnaeus, 1758), a Thraupidae bird common in the semiarid Caatinga. Despite the threat, not much is known about the species genetic diversity and population dynamics. In this study we used genotyping-by sequence (GBS), a mitochondrial marker (ND2), and niche modelling to assess P. dominicanas genetic population structure and infer its demographic history. We found four populations and low signal of isolation-by-distance, as well as indication of a past population reduction followed by a recent expansion. Our niche models suggested that the species had a severe range reduction during the Last Glacial Maximum (ca. 21,000 y.a.) and slight expansion through the mid to the late Holocene (ca. 6,000 y.a.). Our findings help to better understand the distribution of the genetic diversity of a Caatinga species that occurs in all its phytophysiognomies, and can help to inform the release of apprehended individuals, ensuring the maintenance of the genetic diversity of future generations.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPMiyaki, Cristina YumiLaterza, Isabela Munhós2025-04-24info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-30062025-172023/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-06-30T20:58:02Zoai:teses.usp.br:tde-30062025-172023Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.platendimento@abcd.usp.bropendoar:27212025-08-07T19:48:25.476247Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Estrutura populacional genética e história demográfica de Paroaria dominicana (Linnaeus, 1758; Aves: Thraupidae)
Genetic population structure and demographic history of Paroaria dominicana (Linnaeus, 1758; Aves: Thraupidae)
title Estrutura populacional genética e história demográfica de Paroaria dominicana (Linnaeus, 1758; Aves: Thraupidae)
spellingShingle Estrutura populacional genética e história demográfica de Paroaria dominicana (Linnaeus, 1758; Aves: Thraupidae)
Laterza, Isabela Munhós
Caatinga
Caatinga
Cardeal-do-nordeste
Diversidade genética
Estrutura populacional
Genetic diversity
Modelagem de nicho
Niche Modelling
Population structure
Red-cowled cardinal
title_short Estrutura populacional genética e história demográfica de Paroaria dominicana (Linnaeus, 1758; Aves: Thraupidae)
title_full Estrutura populacional genética e história demográfica de Paroaria dominicana (Linnaeus, 1758; Aves: Thraupidae)
title_fullStr Estrutura populacional genética e história demográfica de Paroaria dominicana (Linnaeus, 1758; Aves: Thraupidae)
title_full_unstemmed Estrutura populacional genética e história demográfica de Paroaria dominicana (Linnaeus, 1758; Aves: Thraupidae)
title_sort Estrutura populacional genética e história demográfica de Paroaria dominicana (Linnaeus, 1758; Aves: Thraupidae)
author Laterza, Isabela Munhós
author_facet Laterza, Isabela Munhós
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Miyaki, Cristina Yumi
dc.contributor.author.fl_str_mv Laterza, Isabela Munhós
dc.subject.por.fl_str_mv Caatinga
Caatinga
Cardeal-do-nordeste
Diversidade genética
Estrutura populacional
Genetic diversity
Modelagem de nicho
Niche Modelling
Population structure
Red-cowled cardinal
topic Caatinga
Caatinga
Cardeal-do-nordeste
Diversidade genética
Estrutura populacional
Genetic diversity
Modelagem de nicho
Niche Modelling
Population structure
Red-cowled cardinal
description O comércio ilegal de animais silvestres representa uma grande ameaça para muitas espécies de aves no Brasil. Uma das espécies mais frequentemente apreendidas no tráfico ilegal é o cardeal do-nordeste (Paroaria dominicana, Linnaeus, 1758), uma ave Thraupidae comum na Caatinga semiárida. Apesar da ameaça, não há muitas informações sobre a diversidade genética e a dinâmica populacional dessa espécie. No presente estudo, usamos a genotipagem por sequenciamento (GBS), um marcador mitocondrial (ND2) e modelagem de nicho para avaliar a estrutura genética da população e a história demográfica de P. dominicana. Encontramos quatro populações e leve evidência de isolamento por distância, bem como evidências de uma redução populacional anterior seguida de expansão recente. Os modelos de nicho indicaram que a espécie parece ter sofrido uma forte contração da área de distribuição durante o Último Máximo Glacial (cerca de 21.000 anos atrás) e uma leve expansão durante o Holoceno médio a tardio (cerca de 6.000 anos atrás). Nossos resultados ajudam a entender melhor a distribuição da diversidade genética de uma espécie da Caatinga que ocorre em todas as suas fitofisionomias e podem ajudar a orientar a liberação de indivíduos apreendidos para manter a diversidade genética nas gerações futuras.
publishDate 2025
dc.date.none.fl_str_mv 2025-04-24
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv atendimento@abcd.usp.br
_version_ 1872657979135754240