Plataformas nanobiotecnológicas para veiculação de DNA/RNA em diferentes tipos celulares

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2023
Autor(a) principal: Oliveira, Henrique da Costa
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-16052024-143235/
Resumo: A falta de ferramentas moleculares representa um desafio na área de modificação genética. Falta de protocolos para deleção, substituição ou expressão transiente, sequências genéticas específicas e a internalização de material genético são exemplos de desafios enfrentados, em especial, para organismos com parede celular. A nanotecnologia, associada à processos de modificação genética, emerge como uma solução de grande potencial para auxiliar na veiculação de material genético, independentemente do tipo de organismo, e que permite contribuir tanto para a pesquisa básica quanto a pesquisa aplicada. O objetivo deste projeto foi o desenvolvimento de um complexo DNA/nanoestrutura que melhore na internalização de material genético. Foi feito um levantamento das plataformas nanobiotecnológicas mais atuais para a veiculação de material genético em plantas e bactérias, ambos organismos com parede celular. Foram escolhidas 3 nanoestruturas baseadas em materiais de alta dureza (nanopartículas de ouro, nanopartículas de prata e hidróxidos duplos lamelares - HDL), que protegem o DNA de exo e endonucleases do meio celular, podendo auxiliar na internalização e passagem pela parede e membrana celular. Foram realizadas diversas sínteses de nanopartículas de ouro e de prata e testados diferentes protocolos para complexação de DNA plasmidial às nanoestruturas. Também foi utilizado HDL em diferentes métodos de veiculação nas bactérias de interesse. A formulação e processo do complexo DNA/nanoestrutura foram investigados abordando parâmetros relacionados à escala de produção, tipo e concentração de materiais, estabilidade físico-química e eficiência de transformação. Foi desenvolvido um protocolo de síntese das nanoestruturas e de complexação de simples execução, passível de reprodutibilidade em laboratórios de baixa complexidade, que fornece partículas estáveis. Foram utilizadas diversas partículas produzidas para testes de veiculação de DNA plasmidial nas bactérias gramnegativa (Escherichia coli) e gram-positiva (Corynebacterium glutamicum). Os resultados mostraram que a utilização nanopartículas de ouro e de prata sintetizadas na presença de DNA plasmidial, em água, assim como o complexo nanoestruturado HDL/DNA, apresentaram melhor eficiência de transformação quando comparados aos protocolos convencionais em E. coli. No caso de C. glutamicum, os melhores resultados de transformação foram obtidos na presença de nanoestruturas de ouro e HDL complexadas com plasmídeo replicativo. Finalmente, os protocolos aqui desenvolvidos para obtenção de plataformas nanobiotecnológicas permitiram a veiculação de DNA em diferentes tipos celulares, abrindo caminhos para aplicação com outros materiais genéticos, como RNA mensageiro.
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A nanotecnologia, associada à processos de modificação genética, emerge como uma solução de grande potencial para auxiliar na veiculação de material genético, independentemente do tipo de organismo, e que permite contribuir tanto para a pesquisa básica quanto a pesquisa aplicada. O objetivo deste projeto foi o desenvolvimento de um complexo DNA/nanoestrutura que melhore na internalização de material genético. Foi feito um levantamento das plataformas nanobiotecnológicas mais atuais para a veiculação de material genético em plantas e bactérias, ambos organismos com parede celular. Foram escolhidas 3 nanoestruturas baseadas em materiais de alta dureza (nanopartículas de ouro, nanopartículas de prata e hidróxidos duplos lamelares - HDL), que protegem o DNA de exo e endonucleases do meio celular, podendo auxiliar na internalização e passagem pela parede e membrana celular. Foram realizadas diversas sínteses de nanopartículas de ouro e de prata e testados diferentes protocolos para complexação de DNA plasmidial às nanoestruturas. Também foi utilizado HDL em diferentes métodos de veiculação nas bactérias de interesse. A formulação e processo do complexo DNA/nanoestrutura foram investigados abordando parâmetros relacionados à escala de produção, tipo e concentração de materiais, estabilidade físico-química e eficiência de transformação. Foi desenvolvido um protocolo de síntese das nanoestruturas e de complexação de simples execução, passível de reprodutibilidade em laboratórios de baixa complexidade, que fornece partículas estáveis. Foram utilizadas diversas partículas produzidas para testes de veiculação de DNA plasmidial nas bactérias gramnegativa (Escherichia coli) e gram-positiva (Corynebacterium glutamicum). Os resultados mostraram que a utilização nanopartículas de ouro e de prata sintetizadas na presença de DNA plasmidial, em água, assim como o complexo nanoestruturado HDL/DNA, apresentaram melhor eficiência de transformação quando comparados aos protocolos convencionais em E. coli. No caso de C. glutamicum, os melhores resultados de transformação foram obtidos na presença de nanoestruturas de ouro e HDL complexadas com plasmídeo replicativo. Finalmente, os protocolos aqui desenvolvidos para obtenção de plataformas nanobiotecnológicas permitiram a veiculação de DNA em diferentes tipos celulares, abrindo caminhos para aplicação com outros materiais genéticos, como RNA mensageiro.The lack of molecular tools represents a challenge in the field of genetic modification. Lack of protocols for deletion, substitution or transient expression, specific genetic sequences and the internalization of genetic material are examples of challenges faced, especially for organisms with cell walls. Nanotechnology, associated with genetic modification processes, emerges as a solution with great potential to assist the delivery of genetic material, contributing to both basic and applied research, regardless of the type of organism. The challenge of this project involved the development of a DNA/nanostructure complex that would assist in the internalization of genetic material. A survey was made of the most current nanobiotechnological platforms for delivering genetic material to plants and bacteria, both organisms with cell walls. Three nanostructures were chosen based on high hardness materials (gold nanoparticles, silver nanoparticles and layered double hydroxides - LDH), which protect DNA from exo and endonucleases in the cellular environment, and can assist in internalization and passage through the cell wall and membrane. Several syntheses of gold and silver nanoparticles were carried out and different protocols for complexing plasmid DNA and nanostructures were made. LDHs was also used in different methods of delivery to the bacteria of interest. The formulation and process of the DNA/nanostructure complex were investigated addressing parameters related to production scale, materials and their concentrations, physicochemical stability and transformation efficiency. A simple nanostructure synthesis and complexation protocol which provides stable particles was developed, capable of reproducibility in low-complexity laboratories. Many particles produced were used for plasmid delivery in the gram-negative (Escherichia coli) and gram-positive (Corynebacterium glutamicum) bacteria. The results showed that gold and silver nanoparticles synthesized in the presence of plasmid DNA, in water, as well as the nanostructured HDL/DNA complex, presented better transformation efficiency when compared to conventional protocols in E. coli. In C. glutamicum, the best transformation results were obtained in the presence of gold and HDL nanostructures complexed with a replicative plasmid. Finally, the protocols developed here to obtain nanobiotechnological platforms allowed the delivery of DNA to different cell types, paving the way for application with other genetic materials, such as messenger RNA.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPCerize, Natalia Neto PereiraGomez, José Gregorio CabreraOliveira, Henrique da Costa2023-12-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-16052024-143235/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-05-08T11:31:02Zoai:teses.usp.br:tde-16052024-143235Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-05-08T11:31:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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