Estudos sobre o papel da Acetil Coenzima A Sintetase no ciclo intraeritrocítico de Plasmodium falciparum.
| Ano de defesa: | 2021 |
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| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
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| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
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| País: |
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-06092024-174928/ |
Resumo: | O protozoário do gênero Plasmodium é o agente causador da malária, uma doença que afeta principalmente países em desenvolvimento nas regiões dos trópicos. P. falciparum é a espécie responsável pelas formas mais graves da malária. Os sintomas clínicos da doença aparecem durante o ciclo intraeritrocítico do parasita no hospedeiro humano, onde este protozoário é capaz de sequestrar os eritrócitos em um processo altamente patogênico que é conhecido por ser o causador do agravamento da malária. A família de proteínas variantes PfEMP1, codificada pelos genes var, está diretamente envolvida no sequestro de eritrócitos. Diversos fatores estão envolvidos na regulação da expressão gênica dos genes var e dentre eles está o controle epigenético. Nesse trabalho, nós caracterizamos a enzima Acetil Coenzima A Sintetase (ACS) em P. falciparum, além de estudar seu papel na regulação da expressão gênica dos genes var. Nós geramos uma linhagem mutante que nos permite modular PfACS por meio do domínio desestabilizador DD24, e seu transcrito com a ribozima glmS. Realizamos microscopia de fluorescência para identificar GFP fusionada a PfACS na nossa linhagem mutante, onde observamos a correta expressão dessa proteína ao longo de todos os estágios sanguíneos assexuais do parasita. Western blotting de extratos celulares fracionados de parasitas indicaram que essa proteína é citoplasmática nas formas trofozoíta e esquizonte, mas é nuclear em anel. Nosso sistema de knockdown se mostrou efetivo, onde obtivemos uma diminuição de 70% nos níveis proteicos de PfACS. Após 24 horas de knockdown os parasitas aparentaram estar assincrônicos e debilitados. Nas 48 horas seguintes, a depleção desta proteína levou a morte dos parasitas, indicando que PfACS é uma proteína essencial para a sobrevivência dos estágios intraeritrocíticos de P. falciparum. Nós testamos um inibidor de ACS (iACS) em culturas de parasitas e observamos que eles morrem em uma relação dose-resposta com o composto, apresentando um fenótipo muito similar ao observado durante o knockdown. Nós também testamos os efeitos de iACS em modelo murino de P. berghei, onde obtivemos uma diminuição significativa no crescimento dos parasitas. PfACS knockdown ou inibição levou a uma diminuição significativa nas marcas de acetilação de histonas testadas, resultado também observado em P. berghei. O perfil de expressão dos genes var durante a depleção de PfACS e após o retorno da síntese normal desta proteína foi realizado e notamos que os genes var foram silenciados durante PfACS knockdown ou inibição e o mesmo conjunto de genes expressos anteriormente à depleção desta proteína voltou a ser transcrito quando a mesma teve sua síntese recuperada. Através de ensaios de citoaderência nós observamos que PfACS knockdown ou inibição tornou os parasitas incapazes de se aderir a receptores CD36 presentes em células CHO, revertendo assim o fenótipo de citoaderência. Finalmente, PfACS ChIP-seq análises demonstraram que essa proteína interage com cromatina e atua no controle da expressão gênica de diferentes genes ao longo do genoma do parasita, incluindo metabolismo central, processos celulares e de virulência e patogenicidade. Assim, nossos resultados indicam que PfACS é uma proteína essencial para o desenvolvimento do parasita no seu ciclo assexual, além de interagir com cromatina e atuar no controle da expressão gênica do parasita. Em conclusão, este trabalho propõe PfACS como um bom alvo para desenvolvimento de drogas antimaláricas. |
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Estudos sobre o papel da Acetil Coenzima A Sintetase no ciclo intraeritrocítico de Plasmodium falciparum.The role of Acetyl Coenzyme A Synthetase in Plasmodium falciparum intraerythrocytic cycle.PfACSPfACSPlasmodium falciparumPlasmodium falciparumAcetil Coenzima A SintetaseAcetyl Coenzyme A SynthetaseMalariaMaláriaO protozoário do gênero Plasmodium é o agente causador da malária, uma doença que afeta principalmente países em desenvolvimento nas regiões dos trópicos. P. falciparum é a espécie responsável pelas formas mais graves da malária. Os sintomas clínicos da doença aparecem durante o ciclo intraeritrocítico do parasita no hospedeiro humano, onde este protozoário é capaz de sequestrar os eritrócitos em um processo altamente patogênico que é conhecido por ser o causador do agravamento da malária. A família de proteínas variantes PfEMP1, codificada pelos genes var, está diretamente envolvida no sequestro de eritrócitos. Diversos fatores estão envolvidos na regulação da expressão gênica dos genes var e dentre eles está o controle epigenético. Nesse trabalho, nós caracterizamos a enzima Acetil Coenzima A Sintetase (ACS) em P. falciparum, além de estudar seu papel na regulação da expressão gênica dos genes var. Nós geramos uma linhagem mutante que nos permite modular PfACS por meio do domínio desestabilizador DD24, e seu transcrito com a ribozima glmS. Realizamos microscopia de fluorescência para identificar GFP fusionada a PfACS na nossa linhagem mutante, onde observamos a correta expressão dessa proteína ao longo de todos os estágios sanguíneos assexuais do parasita. Western blotting de extratos celulares fracionados de parasitas indicaram que essa proteína é citoplasmática nas formas trofozoíta e esquizonte, mas é nuclear em anel. Nosso sistema de knockdown se mostrou efetivo, onde obtivemos uma diminuição de 70% nos níveis proteicos de PfACS. Após 24 horas de knockdown os parasitas aparentaram estar assincrônicos e debilitados. Nas 48 horas seguintes, a depleção desta proteína levou a morte dos parasitas, indicando que PfACS é uma proteína essencial para a sobrevivência dos estágios intraeritrocíticos de P. falciparum. Nós testamos um inibidor de ACS (iACS) em culturas de parasitas e observamos que eles morrem em uma relação dose-resposta com o composto, apresentando um fenótipo muito similar ao observado durante o knockdown. Nós também testamos os efeitos de iACS em modelo murino de P. berghei, onde obtivemos uma diminuição significativa no crescimento dos parasitas. PfACS knockdown ou inibição levou a uma diminuição significativa nas marcas de acetilação de histonas testadas, resultado também observado em P. berghei. O perfil de expressão dos genes var durante a depleção de PfACS e após o retorno da síntese normal desta proteína foi realizado e notamos que os genes var foram silenciados durante PfACS knockdown ou inibição e o mesmo conjunto de genes expressos anteriormente à depleção desta proteína voltou a ser transcrito quando a mesma teve sua síntese recuperada. Através de ensaios de citoaderência nós observamos que PfACS knockdown ou inibição tornou os parasitas incapazes de se aderir a receptores CD36 presentes em células CHO, revertendo assim o fenótipo de citoaderência. Finalmente, PfACS ChIP-seq análises demonstraram que essa proteína interage com cromatina e atua no controle da expressão gênica de diferentes genes ao longo do genoma do parasita, incluindo metabolismo central, processos celulares e de virulência e patogenicidade. Assim, nossos resultados indicam que PfACS é uma proteína essencial para o desenvolvimento do parasita no seu ciclo assexual, além de interagir com cromatina e atuar no controle da expressão gênica do parasita. Em conclusão, este trabalho propõe PfACS como um bom alvo para desenvolvimento de drogas antimaláricas.The protozoan genus Plasmodium is the causative agent of malaria, which affects the population living in developing countries in the tropics. P. falciparum is responsible for the most severe form of malaria in humans. The clinical symptoms of malaria appear during the intraerythrocytic cycle in the human host, and parasite-mediated sequestration of erythrocytes is believed to be a key factor for onset of severe malaria. The variant PfEMP1 proteins, encoded by the var gene family, are involved in erythrocyte sequestration. Many processes are involved in var gene expression control, which is mainly regulated by epigenetic factors. Here we characterized the conserved enzyme Acetyl-CoA Synthetase (ACS) in P. falciparum and also studied its role in var gene expression control. We generated mutant lines to modulate PfACS protein by means of the DD24 stabilizing domain and its transcript through the ribozyme glmS. GFP analysis in fluorescence microscopy showed that PfACS was correctly fused to GFP, indicating that this protein is present in all asexual blood stages of the parasite. Western blotting indicated that this protein is cytoplasmatic in ring, trophozoites and schizonts, and in the nucleus in ring stages. Our knockdown system showed to be effective, since western blotting exhibited that PfACS protein levels were significantly affected by the inducible knockdown. After 24 hours of PfACS knockdown parasites started to appear unhealthy and asynchronous. After 48 hours, PfACS depletion led to parasite death, indicating that PfACS is an essential protein for blood stage P. falciparum survival. Further, we tested a specific ACS inhibitor (iACS) in parasite cultures and observed that parasites were dying in an inhibitor dose-dependent manner, presenting the same phenotype observed in our mutant lines after PfACS knockdown. We also tested the effects of iACS in the murine model P. berghei, were we observed a significant decrease in parasite survival. Furthermore, PfACS knockdown or inhibition led to a huge decrease in parasite histone acetyl marks, the same result was observed for iACS treated P. berghei. Considering the loss of epigenetic marks, we performed var gene screening during depletion of this protein for one re-invasion cycle, and of recovered parasites, where PfACS synthesis was re-established. Our results indicated that var genes were de-activated during PfACS depletion and the same set of active var genes was re-established after PfACS was recovered. To test the parasite cytoadherence phenotype, we performed assays where PfACS knockdown or inhibition induced the loss of the parasites ability to attach to CD36 receptors present on CHO cells. Finally, PfACS ChIP-seq analysis indicated that this protein interacts with chromatin and controls different genes across the parasite genome, including genes involved in central metabolism, cellular processes and virulence and pathogenesis associated genes. Hence, our results indicate that PfACS is an essential enzyme for intraerythrocytic development, being directly involved in var gene expression control, but not epigenetic memory, and cytoadherence. Also, this protein interacts with chromatin and probably plays a role in the expression control of many genes, such as central metabolism, cellular homeostasis and parasite virulence and pathogenicity. We propose that PfACS is a good target for drug development.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPWunderlich, GerhardPrata, Isadora Oliveira2021-05-05info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-06092024-174928/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2024-09-10T15:58:03Zoai:teses.usp.br:tde-06092024-174928Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212024-09-10T15:58:03Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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O protozoário do gênero Plasmodium é o agente causador da malária, uma doença que afeta principalmente países em desenvolvimento nas regiões dos trópicos. P. falciparum é a espécie responsável pelas formas mais graves da malária. Os sintomas clínicos da doença aparecem durante o ciclo intraeritrocítico do parasita no hospedeiro humano, onde este protozoário é capaz de sequestrar os eritrócitos em um processo altamente patogênico que é conhecido por ser o causador do agravamento da malária. A família de proteínas variantes PfEMP1, codificada pelos genes var, está diretamente envolvida no sequestro de eritrócitos. Diversos fatores estão envolvidos na regulação da expressão gênica dos genes var e dentre eles está o controle epigenético. Nesse trabalho, nós caracterizamos a enzima Acetil Coenzima A Sintetase (ACS) em P. falciparum, além de estudar seu papel na regulação da expressão gênica dos genes var. Nós geramos uma linhagem mutante que nos permite modular PfACS por meio do domínio desestabilizador DD24, e seu transcrito com a ribozima glmS. Realizamos microscopia de fluorescência para identificar GFP fusionada a PfACS na nossa linhagem mutante, onde observamos a correta expressão dessa proteína ao longo de todos os estágios sanguíneos assexuais do parasita. Western blotting de extratos celulares fracionados de parasitas indicaram que essa proteína é citoplasmática nas formas trofozoíta e esquizonte, mas é nuclear em anel. Nosso sistema de knockdown se mostrou efetivo, onde obtivemos uma diminuição de 70% nos níveis proteicos de PfACS. Após 24 horas de knockdown os parasitas aparentaram estar assincrônicos e debilitados. Nas 48 horas seguintes, a depleção desta proteína levou a morte dos parasitas, indicando que PfACS é uma proteína essencial para a sobrevivência dos estágios intraeritrocíticos de P. falciparum. Nós testamos um inibidor de ACS (iACS) em culturas de parasitas e observamos que eles morrem em uma relação dose-resposta com o composto, apresentando um fenótipo muito similar ao observado durante o knockdown. Nós também testamos os efeitos de iACS em modelo murino de P. berghei, onde obtivemos uma diminuição significativa no crescimento dos parasitas. PfACS knockdown ou inibição levou a uma diminuição significativa nas marcas de acetilação de histonas testadas, resultado também observado em P. berghei. O perfil de expressão dos genes var durante a depleção de PfACS e após o retorno da síntese normal desta proteína foi realizado e notamos que os genes var foram silenciados durante PfACS knockdown ou inibição e o mesmo conjunto de genes expressos anteriormente à depleção desta proteína voltou a ser transcrito quando a mesma teve sua síntese recuperada. Através de ensaios de citoaderência nós observamos que PfACS knockdown ou inibição tornou os parasitas incapazes de se aderir a receptores CD36 presentes em células CHO, revertendo assim o fenótipo de citoaderência. Finalmente, PfACS ChIP-seq análises demonstraram que essa proteína interage com cromatina e atua no controle da expressão gênica de diferentes genes ao longo do genoma do parasita, incluindo metabolismo central, processos celulares e de virulência e patogenicidade. Assim, nossos resultados indicam que PfACS é uma proteína essencial para o desenvolvimento do parasita no seu ciclo assexual, além de interagir com cromatina e atuar no controle da expressão gênica do parasita. Em conclusão, este trabalho propõe PfACS como um bom alvo para desenvolvimento de drogas antimaláricas. |
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