Papel dos regulons Alp e Prt na resposta a danos no DNA de Pseudomonas aeruginosa

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2023
Autor(a) principal: Freitas, Rúbia Ribas Loures de
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-27052025-173246/
Resumo: Pseudomonas aeruginosa é uma bactéria Gram-negativa oportunista frequentemente associada a infecções hospitalares incluindo queimaduras, infecções urinárias e feridas crônicas, bem como em indivíduos com Fibrose Cística. A resistência intrínseca de P. aeruginosa a múltiplos antimicrobianos é uma característica importante e pode estar relacionada à presença de bombas de efluxo de múltiplas drogas e transferência horizontal de genes. A resistência de P. aeruginosa a altas concentrações de antimicrobianos pode ser explicada pela seleção de variantes resistentes preexistentes. Além disso, concentrações subletais de antimicrobianos podem levar a mudanças na expressão de genes bacterianos, incluindo a ativação de sistemas de reparo de DNA, que contribuem para a adaptação e sobrevivência. A ciprofloxacina é um antimicrobiano da classe das fluoroquinolonas que leva a quebras duplas no DNA, sendo um agente indutor da resposta SOS. A exposição à radiação ultravioleta, por outro lado, não causa quebras diretas no DNA, mas induz a formação de dímeros de pirimidina. Esses dímeros podem também levar à ativação da resposta SOS e à indução da expressão de genes que facilitam a reparação do DNA em P. aeruginosa. A resposta SOS é uma das principais respostas fisiológicas aos agentes que causam danos no DNA e envolve a expressão controlada de genes cujos produtos proteicos facilitam a reparação do DNA. Em P. aeruginosa, quando ocorre dano no DNA com exposição de fita simples, a proteína RecA é ativada e a expressão dos genes SOS é iniciada. Além de mediar a resposta SOS, a proteína RecA também medeia a expressão de outros regulons, como Alp e Prt, cuja atividade leva à autólise e morte celular, no caso do último, para a liberação de bacteriocinas. Neste estudo, foi realizada uma comparação entre duas linhagens de laboratório de P. aeruginosa PAO1, investigando-se o papel dos regulons Alp e Prt na resposta a danos no DNA, dado que há considerável variação entre as linhagens PAO1 de diferentes laboratórios. As duas linhagens apresentam comportamento oposto no que se refere ao papel dos regulons Alp e Prt na morte induzida por luz UV. Analisamos também como estes regulons afetam a expressão das funções do SOS canônico, e observamos que mutantes incapazes de expressar tanto Alp como Prt não apresentam diferenças significativas na expressão de genes SOS após irradiação com UV nem apresentam alterações na mutagênese, que é uma das principais assinaturas da resposta SOS.
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Além disso, concentrações subletais de antimicrobianos podem levar a mudanças na expressão de genes bacterianos, incluindo a ativação de sistemas de reparo de DNA, que contribuem para a adaptação e sobrevivência. A ciprofloxacina é um antimicrobiano da classe das fluoroquinolonas que leva a quebras duplas no DNA, sendo um agente indutor da resposta SOS. A exposição à radiação ultravioleta, por outro lado, não causa quebras diretas no DNA, mas induz a formação de dímeros de pirimidina. Esses dímeros podem também levar à ativação da resposta SOS e à indução da expressão de genes que facilitam a reparação do DNA em P. aeruginosa. A resposta SOS é uma das principais respostas fisiológicas aos agentes que causam danos no DNA e envolve a expressão controlada de genes cujos produtos proteicos facilitam a reparação do DNA. Em P. aeruginosa, quando ocorre dano no DNA com exposição de fita simples, a proteína RecA é ativada e a expressão dos genes SOS é iniciada. Além de mediar a resposta SOS, a proteína RecA também medeia a expressão de outros regulons, como Alp e Prt, cuja atividade leva à autólise e morte celular, no caso do último, para a liberação de bacteriocinas. Neste estudo, foi realizada uma comparação entre duas linhagens de laboratório de P. aeruginosa PAO1, investigando-se o papel dos regulons Alp e Prt na resposta a danos no DNA, dado que há considerável variação entre as linhagens PAO1 de diferentes laboratórios. As duas linhagens apresentam comportamento oposto no que se refere ao papel dos regulons Alp e Prt na morte induzida por luz UV. Analisamos também como estes regulons afetam a expressão das funções do SOS canônico, e observamos que mutantes incapazes de expressar tanto Alp como Prt não apresentam diferenças significativas na expressão de genes SOS após irradiação com UV nem apresentam alterações na mutagênese, que é uma das principais assinaturas da resposta SOS.Pseudomonas aeruginosa is a Gram-negative opportunistic bacterium frequently associated with hospital infections, including burns, urinary tract infections, chronic wounds, as well as in individuals with Cystic Fibrosis. The intrinsic resistance of P. aeruginosa to multiple antimicrobials is an important characteristic and may be related to the presence of multidrug efflux pumps and horizontal gene transfer. P. aeruginosa resistance to high concentrations of antimicrobials can be explained by the selection of preexisting resistant variants. In addition, sublethal concentrations of antimicrobials can lead to changes in bacterial gene expression, including the activation of DNA repair systems, which contribute to adaptation and survival. Ciprofloxacin is an antimicrobial in the fluoroquinolone class that leads to double-stranded DNA breaks, being an inducer of the SOS response. UV radiation exposure, on the other hand, does not cause direct DNA breaks, but induces the formation of pyrimidine dimers. These dimers can also lead to the activation of the SOS response and the induction of gene expression that facilitates DNA repair in P. aeruginosa. The SOS response is one of the main physiological responses to DNA-damaging agents and involves the controlled expression of genes whose protein products facilitate DNA repair. In P. aeruginosa, when single-stranded DNA damage occurs, RecA protein is activated and SOS gene expression is initiated. In addition to mediating the SOS response, RecA protein also mediates the expression of other regulons, such as Alp and Prt, whose activity leads to autolysis and cell death, in the case of the latter, for bacteriocin release. In this study, a comparison was made between two sublines of P. aeruginosa PAO1, investigating the role of Alp and Prt regulons in the response to DNA damage, given that there is considerable variation among PAO1 strains from different laboratories. The two strains exhibit opposite behavior regarding the role of Alp and Prt regulons in UV-induced death. We also analyzed how these regulons affect the expression of canonical SOS functions and observed that mutants unable to express both Alp and Prt do not show significant differences in SOS gene expression after UV irradiation or alterations in mutagenesis, which is one of the main signatures of the SOS response.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPGalhardo, Rodrigo da SilvaFreitas, Rúbia Ribas Loures de2023-05-30info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-27052025-173246/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPReter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-05-28T14:07:02Zoai:teses.usp.br:tde-27052025-173246Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-05-28T14:07:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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description Pseudomonas aeruginosa é uma bactéria Gram-negativa oportunista frequentemente associada a infecções hospitalares incluindo queimaduras, infecções urinárias e feridas crônicas, bem como em indivíduos com Fibrose Cística. A resistência intrínseca de P. aeruginosa a múltiplos antimicrobianos é uma característica importante e pode estar relacionada à presença de bombas de efluxo de múltiplas drogas e transferência horizontal de genes. A resistência de P. aeruginosa a altas concentrações de antimicrobianos pode ser explicada pela seleção de variantes resistentes preexistentes. Além disso, concentrações subletais de antimicrobianos podem levar a mudanças na expressão de genes bacterianos, incluindo a ativação de sistemas de reparo de DNA, que contribuem para a adaptação e sobrevivência. A ciprofloxacina é um antimicrobiano da classe das fluoroquinolonas que leva a quebras duplas no DNA, sendo um agente indutor da resposta SOS. A exposição à radiação ultravioleta, por outro lado, não causa quebras diretas no DNA, mas induz a formação de dímeros de pirimidina. Esses dímeros podem também levar à ativação da resposta SOS e à indução da expressão de genes que facilitam a reparação do DNA em P. aeruginosa. A resposta SOS é uma das principais respostas fisiológicas aos agentes que causam danos no DNA e envolve a expressão controlada de genes cujos produtos proteicos facilitam a reparação do DNA. Em P. aeruginosa, quando ocorre dano no DNA com exposição de fita simples, a proteína RecA é ativada e a expressão dos genes SOS é iniciada. Além de mediar a resposta SOS, a proteína RecA também medeia a expressão de outros regulons, como Alp e Prt, cuja atividade leva à autólise e morte celular, no caso do último, para a liberação de bacteriocinas. Neste estudo, foi realizada uma comparação entre duas linhagens de laboratório de P. aeruginosa PAO1, investigando-se o papel dos regulons Alp e Prt na resposta a danos no DNA, dado que há considerável variação entre as linhagens PAO1 de diferentes laboratórios. As duas linhagens apresentam comportamento oposto no que se refere ao papel dos regulons Alp e Prt na morte induzida por luz UV. Analisamos também como estes regulons afetam a expressão das funções do SOS canônico, e observamos que mutantes incapazes de expressar tanto Alp como Prt não apresentam diferenças significativas na expressão de genes SOS após irradiação com UV nem apresentam alterações na mutagênese, que é uma das principais assinaturas da resposta SOS.
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