Importância da fotossíntese corticular para o desenvolvimento e formação da madeira (xilogênese) de Eucalyptus grandis

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Bononi, Daniele Cristine de Lima
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-02082024-151419/
Resumo: O gênero Eucalyptus é a principal espécie florestal plantada no Brasil, para fins comerciais, destacando sua relevância econômica e industrial. No entanto, apesar de sua predominância, há uma lacuna no conhecimento sobre a biologia da casca e sua influência na formação da madeira. O rápido crescimento do eucalipto levanta questões sobre sua fisiologia, bioquímica e controle gênico durante a xilogênese. Um estudo recente sugere que a fotossíntese corticular pode desempenhar um papel crucial no metabolismo respiratório das células xilemáticas, fornecendo oxigênio em condições de hipóxia na região cambial. O presente trabalho destaca a importância do entendimento do metabolismo da casca para a formação da madeira e o crescimento rápido do eucalipto, enfatizando a necessidade de avançar na compreensão desses processos metabólicos. Para abordar tais questões, o estudo utilizou-se das técnicas de proteômica e metabolômica, possibilitando a identificação das bases moleculares de características importantes para o melhoramento genético dessa espécie. O trabalho teve como principal objetivo comparar o perfil proteico e metabólico entre tecidos de casca e, paralelamente xilema de Eucalyptus grandis nas idades de 4 e 12 anos, além de analisar a dispersão e distribuição de cloroplastos nesses tecidos. A análise de cloroplastos foi realizada por corte histológico dos tecidos da casca ao xilema e, posteriormente, observado em microscopia de fluorescência, a quantificação e abundância dos mesmo foram feitas utilizando os Software ImageJ. O perfil proteico foi analisado por espectrometria de massas associada a cromatografia líquida (LC-MS/MS). Já o perfil metabólico foi analisado por espectrometria de massas associada a cromatografia gasosa (GC-MS/MS). O pré-processamento dos dados univariados e multivariados foram realizados utilizando a ferramenta de análise de dados MetaboAnalyst 3.0 (PANG et al., 2024). Para os cloroplastos foi possível observar diferença estatisticamente significativa entre as idades de 4 e 12 anos, havendo maior abundância de Cloroplastos em Casca de 4 anos. Quanto ao perfil proteíco foram identificadas um total 4109 proteínas em Casca, das quais 149 foram estatisticamente significativas; um total de 3721 proteínas em Xilema com 357 proteínas estatisticamente significativas. No perfil metabólico foram encontrados 61 e 64 metabólitos em casca e xilema, com 5 metabolitos e 2 metabólitos estatisticamente significativo nos respectivos tecidos, respestivamente. Quanto as vias estudadas, na via da Fotossíntese foram encontradas as duas subunidades da RuBisCO (RBsS e RBsL) em Casca mais jovem, indicando um tecido mais fotossinteticamente ativo. Houve uma maior tendência na formação do Piruvato na via glicolítica, com maior abundância de proteínas relacionada a essa via em Casca de 4 anos. Quanto ao Xilema, houve um desvio para síntese de carboidratos com metabólitos mais abundantes na idade de 12 anos. A combinação de análise de metabólitos e proteínas pode fornecer uma visão holística de metabolismo e fisiologia do E.grandis permitindo identificar genes e proteínas que podem ser modificados para desenvolvimento de variedades com características desejáveis. Como pro exemplo, maior produtividade de madeira e celulose. Esse estudo é um campo de pesquisa promissor com grande potencial.
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O presente trabalho destaca a importância do entendimento do metabolismo da casca para a formação da madeira e o crescimento rápido do eucalipto, enfatizando a necessidade de avançar na compreensão desses processos metabólicos. Para abordar tais questões, o estudo utilizou-se das técnicas de proteômica e metabolômica, possibilitando a identificação das bases moleculares de características importantes para o melhoramento genético dessa espécie. O trabalho teve como principal objetivo comparar o perfil proteico e metabólico entre tecidos de casca e, paralelamente xilema de Eucalyptus grandis nas idades de 4 e 12 anos, além de analisar a dispersão e distribuição de cloroplastos nesses tecidos. A análise de cloroplastos foi realizada por corte histológico dos tecidos da casca ao xilema e, posteriormente, observado em microscopia de fluorescência, a quantificação e abundância dos mesmo foram feitas utilizando os Software ImageJ. O perfil proteico foi analisado por espectrometria de massas associada a cromatografia líquida (LC-MS/MS). Já o perfil metabólico foi analisado por espectrometria de massas associada a cromatografia gasosa (GC-MS/MS). O pré-processamento dos dados univariados e multivariados foram realizados utilizando a ferramenta de análise de dados MetaboAnalyst 3.0 (PANG et al., 2024). Para os cloroplastos foi possível observar diferença estatisticamente significativa entre as idades de 4 e 12 anos, havendo maior abundância de Cloroplastos em Casca de 4 anos. Quanto ao perfil proteíco foram identificadas um total 4109 proteínas em Casca, das quais 149 foram estatisticamente significativas; um total de 3721 proteínas em Xilema com 357 proteínas estatisticamente significativas. No perfil metabólico foram encontrados 61 e 64 metabólitos em casca e xilema, com 5 metabolitos e 2 metabólitos estatisticamente significativo nos respectivos tecidos, respestivamente. Quanto as vias estudadas, na via da Fotossíntese foram encontradas as duas subunidades da RuBisCO (RBsS e RBsL) em Casca mais jovem, indicando um tecido mais fotossinteticamente ativo. Houve uma maior tendência na formação do Piruvato na via glicolítica, com maior abundância de proteínas relacionada a essa via em Casca de 4 anos. Quanto ao Xilema, houve um desvio para síntese de carboidratos com metabólitos mais abundantes na idade de 12 anos. A combinação de análise de metabólitos e proteínas pode fornecer uma visão holística de metabolismo e fisiologia do E.grandis permitindo identificar genes e proteínas que podem ser modificados para desenvolvimento de variedades com características desejáveis. Como pro exemplo, maior produtividade de madeira e celulose. Esse estudo é um campo de pesquisa promissor com grande potencial.Eucalyptus is the most widely planted forest species in Brazil for commercial purposes, highlighting its economic and industrial relevance. However, despite its predominance, there is a gap in knowledge about bark biology and its influence on wood formation. The rapid growth of eucalyptus raises questions about its physiology, biochemistry, and genetic control during xylem development. A recent study suggests that cortical photosynthesis may play a crucial role in the respiratory metabolism of xylem cells, providing oxygen under hypoxic conditions in the cambial region. This work highlights the importance of understanding bark metabolism for wood formation and rapid eucalyptus growth, emphasizing the need to advance our understanding of these metabolic processes. To address these issues, the study used proteomic and metabolomic techniques to identify the molecular bases of important traits for genetic improvement of this species. The main objective of the work was to compare the protein and metabolic profiles between bark and xylem tissues of Eucalyptus grandis at ages 4 and 12 years, as well as to analyze the dispersion and distribution of chloroplasts in these tissues. Chloroplast analysis was performed by histological sectioning of bark to xylem tissues and subsequent observation under fluorescence microscopy. Their quantification and abundance were determined using ImageJ software. The protein profile was analyzed by mass spectrometry coupled with liquid chromatography (LCMS/MS). The metabolic profile was analyzed by gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS/MS). Data preprocessing, both univariate and multivariate, was performed using the MetaboAnalyst 3.0 (PANG et al., 2024) data analysis tool. For chloroplasts, a statistically significant difference between 4 and 12 years of age was observed, with a higher abundance of chloroplasts in 4-year-old bark. In the protein profile, a total of 4109 proteins were identified in bark, of which 149 were statistically significant; a total of 3721 proteins in xylem with 357 statistically significant proteins. In the metabolic profile, 61 and 64 metabolites were found in bark and xylem, respectively, with 5 and 2 metabolites statistically significant in their respective tissues. In the studied pathways, in the Photossynthesis pathway, both subunits of RuBisCO (RBsS and RBsL) were found in younger bark, indicating a more photosynthetically active tissue. There was a higher tendency for Pyruvate formation in the glycolytic pathway, with a greater abundance of proteins related to this pathway in 4-year-old bark. Regarding the Xylem, there was a shift towards carbohydrate synthesis with more abundant metabolites at 12 years of age. The combination of metabolite and protein analysis can provide a holistic view of the metabolism and physiology of E.grandis, allowing the identification of genes and proteins that can be modified for the development of varieties with desirable characteristics. For example, higher wood and cellulose productivity. This study is a promising research field with great potential.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPLabate, Carlos AlbertoBononi, Daniele Cristine de Lima2024-06-20info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-02082024-151419/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2024-11-28T18:58:37Zoai:teses.usp.br:tde-02082024-151419Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212024-11-28T18:58:37Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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