Estudos do sensoriamento de nutrientes via proteínas de membrana com domínio CFEM em Trichoderma reesei

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2025
Autor(a) principal: Jesus, Luiz Felipe de Morais Costa de
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-26052025-101934/
Resumo: Com o aumento da demanda por etanol, a utilização de biomassa lignocelulósica para sua produção tornou-se necessária. A degradação dos polissacarídeos da lignocelulose é um processo que requer enzimas, denominadas celulases, que atuam de forma cooperativa. O fungo filamentoso Trichoderma reesei apresenta uma capacidade surpreendente de produzir e secretar celulases. O potencial industrial das celulases levou à busca da diminuição dos custos de produção das mesmas. Desta forma, este estudo teve como objetivo contribuir para o entendimento do papel de proteínas de membrana com domínio CFEM na regulação da expressão de genes relacionados ao processo de desconstrução da biomassa lignocelulósica em T. reesei. Para isso, foram selecionadas três proteínas com domínio CFEM diferencialmente expressa quando a linhagem QM6a de T. reesei foi crescida em celulose, bagaço de cana-de-açúcar e glicose. Nós demostramos, através de análises in silico, que as estruturas dessas proteínas de membrana com domínio CFEM apresentam características estruturais distintas entre si. Além disso, realizamos a caracterização funcional da proteína Tr111205. Através da expressão condicionada do gene Tr111205, nós demostramos o knockdown desse gene na presença de baixas concentrações de Cu2+ exógeno. Ensaios de crescimento mostraram que a linhagem mutante com o gene silenciado afetou no crescimento de T. reesei em diferentes fontes de carbono, além disso, houve diferença na esporulação, uma vez que a linhagem mutante produziu maiores quantidades de conídios em relação à linhagem parental. Por outro lado, a proteína Tr111205, com domínio CFEM, regula de forma positiva a adaptação ao estresse osmótico, ao estresse oxidativo e à manutenção da integridade da parede celular de T. reesei. Além disso, a proteína Tr111205 atua regulando positivamente a expressão de enzimas holocelulolíticas durante o cultivo Ptcu1:111205 em celulose. Entretanto, em cultivo com manitol, nossos resultados indicaram uma regulação negativa desses genes. Por fim, neste trabalho, demostramos que, dependendo da fonte de carbono utilizada, a proteína Tr111205 pode desencadear mecanismos que reprimem a transcrição de xyr1, causando, assim, diferentes perfis de expressão gênica de holocelulases. Sendo assim, esses resultados mostram o envolvimento desta proteína com domínio CFEM na regulação da expressão de celulases em T. reesei, possibilitando maior entendimento na elucidação do sensoriamento de nutrientes e melhor compreensão do comportamento das enzimas celulolíticas produzidas por T. reesei.
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Desta forma, este estudo teve como objetivo contribuir para o entendimento do papel de proteínas de membrana com domínio CFEM na regulação da expressão de genes relacionados ao processo de desconstrução da biomassa lignocelulósica em T. reesei. Para isso, foram selecionadas três proteínas com domínio CFEM diferencialmente expressa quando a linhagem QM6a de T. reesei foi crescida em celulose, bagaço de cana-de-açúcar e glicose. Nós demostramos, através de análises in silico, que as estruturas dessas proteínas de membrana com domínio CFEM apresentam características estruturais distintas entre si. Além disso, realizamos a caracterização funcional da proteína Tr111205. Através da expressão condicionada do gene Tr111205, nós demostramos o knockdown desse gene na presença de baixas concentrações de Cu2+ exógeno. Ensaios de crescimento mostraram que a linhagem mutante com o gene silenciado afetou no crescimento de T. reesei em diferentes fontes de carbono, além disso, houve diferença na esporulação, uma vez que a linhagem mutante produziu maiores quantidades de conídios em relação à linhagem parental. Por outro lado, a proteína Tr111205, com domínio CFEM, regula de forma positiva a adaptação ao estresse osmótico, ao estresse oxidativo e à manutenção da integridade da parede celular de T. reesei. Além disso, a proteína Tr111205 atua regulando positivamente a expressão de enzimas holocelulolíticas durante o cultivo Ptcu1:111205 em celulose. Entretanto, em cultivo com manitol, nossos resultados indicaram uma regulação negativa desses genes. Por fim, neste trabalho, demostramos que, dependendo da fonte de carbono utilizada, a proteína Tr111205 pode desencadear mecanismos que reprimem a transcrição de xyr1, causando, assim, diferentes perfis de expressão gênica de holocelulases. Sendo assim, esses resultados mostram o envolvimento desta proteína com domínio CFEM na regulação da expressão de celulases em T. reesei, possibilitando maior entendimento na elucidação do sensoriamento de nutrientes e melhor compreensão do comportamento das enzimas celulolíticas produzidas por T. reesei.With the increasing demand for ethanol, the use of lignocellulosic biomass for its production has become necessary. The degradation of lignocellulose polysaccharides is a process that requires enzymes, known as cellulases, which act cooperatively. The filamentous fungus Trichoderma reesei exhibits a remarkable ability to produce and secrete cellulases. The industrial potential of cellulases has led to efforts to reduce their production costs. Therefore, this study aimed to contribute to the understanding of the role of membrane proteins with the CFEM domain in the regulation of gene expression related to the deconstruction process of lignocellulosic biomass in T. reesei. To achieve this, three proteins with the CFEM domain were selected, which were differentially expressed when the QM6a strain of T. reesei was grown on cellulose, sugarcane bagasse, and glucose. We demonstrated, through in silico analyses, that the structures of these membrane proteins with the CFEM domain have distinct structural characteristics. Furthermore, we conducted the functional characterization of the Tr111205 protein. Through conditional expression of the Tr111205 gene, we demonstrated the knockdown of this gene in the presence of low concentrations of exogenous Cu²+. Growth assays showed that the mutant strain with the silenced gene affected the growth of T. reesei on different carbon sources. Furthermore, there was a difference in sporulation, as the mutant strain produced higher amounts of conidia compared to the parental strain. On the other hand, the Tr111205 protein, with the CFEM domain, positively regulates adaptation to osmotic stress, oxidative stress, and the maintenance of the cell wall integrity of T. reesei. Additionally, the Tr111205 protein positively regulates the expression of holocellulolytic enzymes during the cultivation of Ptcu1:111205 on cellulose. However, in cultures with mannitol, our results indicated a negative regulation of these genes. Finally, in this study, we demonstrated that, depending on the carbon source used, the Tr111205 protein can trigger mechanisms that repress the transcription of xyr1, thus causing different gene expression profiles of holocellulases. Therefore, these results demonstrate the involvement of this CFEM domain protein in the regulation of cellulase expression in T. reesei, enabling a better understanding of nutrient sensing and a deeper comprehension of the behavior of cellulolytic enzymes produced by T. reesei.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPSilva, Roberto do NascimentoJesus, Luiz Felipe de Morais Costa de2025-02-21info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-26052025-101934/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-07-24T20:23:02Zoai:teses.usp.br:tde-26052025-101934Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-07-24T20:23:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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