An integrated taxonomic analysis into the identity of Hoplisoma julii (Siluriformes: Callichthyidae), with comparisons with allied forms

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2025
Autor(a) principal: Lam, Shu Him
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: eng
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/38/38131/tde-15092025-092256/
Resumo: Corydoradinae is the most species-rich group of the Neotropical catfish family Callichthyidae. However, the remarkably diverse and complex colour patterns characteristic of the group have been both a boon and bane to its taxonomy. Here, we investigated the taxonomic identity of Hoplisoma julii, a classic example of that issue. The species was described more than a century ago based primarily on colouration and very limited morphological data. To fully explore its species boundary and accurately delimit the species, we employed an integrative approach combining morphological data and COI divergence, based on samples from seven river drainages. Our results indicate that H. julii is a polymorphic species widely distributed in Rio Parnaíba and Eastern Amazonian drainages, but apparently similar morphotypes from Rio Curuá-Una actually represent a new species. A formal taxonomic description of this new spotted Hoplisoma species, commonly known in aquarium trade as CW037, is herein provided. These two species share very close genetic relationships in our Bayesian-inferred phylogeny, corroborating morphological data. Molecular delimitations also reveal the presence of a putative new species from Rio Purus, but its taxonomic identity is not assigned herein due to the paucity of morphological data. The delimitation results raise doubts about the identity of H. julii voucher specimens available in online genetic sequence repositories, highlighting the need for improved data curation.
id USP_5fa13f2672e5a3ec151bf183d96b8a49
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-15092025-092256
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling An integrated taxonomic analysis into the identity of Hoplisoma julii (Siluriformes: Callichthyidae), with comparisons with allied formsUma análise taxonômica integrada sobre a identidade de Hoplisoma julii (Siluriformes: Callichthyidae), com comparações a formas relacionadasAmazônia OrientalCOI divergenceCorydoradinaeCorydoradinaeDivergência COIEastern AmazonIntegrative taxonomyRevisão taxonômica, Taxonomia integrativaTaxonomic revisionCorydoradinae is the most species-rich group of the Neotropical catfish family Callichthyidae. However, the remarkably diverse and complex colour patterns characteristic of the group have been both a boon and bane to its taxonomy. Here, we investigated the taxonomic identity of Hoplisoma julii, a classic example of that issue. The species was described more than a century ago based primarily on colouration and very limited morphological data. To fully explore its species boundary and accurately delimit the species, we employed an integrative approach combining morphological data and COI divergence, based on samples from seven river drainages. Our results indicate that H. julii is a polymorphic species widely distributed in Rio Parnaíba and Eastern Amazonian drainages, but apparently similar morphotypes from Rio Curuá-Una actually represent a new species. A formal taxonomic description of this new spotted Hoplisoma species, commonly known in aquarium trade as CW037, is herein provided. These two species share very close genetic relationships in our Bayesian-inferred phylogeny, corroborating morphological data. Molecular delimitations also reveal the presence of a putative new species from Rio Purus, but its taxonomic identity is not assigned herein due to the paucity of morphological data. The delimitation results raise doubts about the identity of H. julii voucher specimens available in online genetic sequence repositories, highlighting the need for improved data curation.Corydoradinae é o grupo mais rico em espécies dentro da família de bagres neotropicais Callichthyidae. No entanto, os padrões de coloração notavelmente diversos e complexos característicos do grupo têm sido ao mesmo tempo uma benção e um desafio para sua taxonomia. Neste estudo, investigamos a identidade taxonômica de Hoplisoma julii, um exemplo clássico dessa problemática. Trata-se de uma espécie descrita há mais de um século, com base principalmente na coloração e em dados morfológicos bastante limitados. Para explorar completamente os limites da espécie de delimitá-la com precisão, empregamos uma abordagem integrativa que combina dados morfológicos e divergência do gene COI, com base em amostras provenientes de sete bacias hidrográficas. Nossos resultados indicam que H. julii é uma espécie polimórfica amplamente distribuída no rio Parnaíba e nas drenagens do leste da Amazônia. No entanto, os morfotipos do rio Curuá-Una representam, na verdade, uma nova espécie. Uma descrição taxonômica formal dessa nova espécie pintada de Hoplisoma, comumente conhecida no comércio aquarístico como CW037, é aqui fornecida. Essas duas espécies compartilham relações genéticas muito próximas em nossa filogenia inferida por métodos bayesianos, o que corrobora os dados morfológicos. As delimitações moleculares também revelam a presença de uma possível nova espécie no rio Purus, cuja identidade taxonômica permanece indefinida devido à escassez de dados morfológicos. Os resultados das delimitações levantam dúvidas quanto à identidade dos espécimes-voucher de H. julii disponíveis em repositórios online de sequências genéticas, ressaltando a necessidade de uma curadoria de dados mais rigorosa.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPPinna, Mario Cesar Cardoso deLam, Shu Him2025-08-26info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/38/38131/tde-15092025-092256/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPReter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.info:eu-repo/semantics/openAccesseng2025-10-08T13:09:02Zoai:teses.usp.br:tde-15092025-092256Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-10-08T13:09:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv An integrated taxonomic analysis into the identity of Hoplisoma julii (Siluriformes: Callichthyidae), with comparisons with allied forms
Uma análise taxonômica integrada sobre a identidade de Hoplisoma julii (Siluriformes: Callichthyidae), com comparações a formas relacionadas
title An integrated taxonomic analysis into the identity of Hoplisoma julii (Siluriformes: Callichthyidae), with comparisons with allied forms
spellingShingle An integrated taxonomic analysis into the identity of Hoplisoma julii (Siluriformes: Callichthyidae), with comparisons with allied forms
Lam, Shu Him
Amazônia Oriental
COI divergence
Corydoradinae
Corydoradinae
Divergência COI
Eastern Amazon
Integrative taxonomy
Revisão taxonômica, Taxonomia integrativa
Taxonomic revision
title_short An integrated taxonomic analysis into the identity of Hoplisoma julii (Siluriformes: Callichthyidae), with comparisons with allied forms
title_full An integrated taxonomic analysis into the identity of Hoplisoma julii (Siluriformes: Callichthyidae), with comparisons with allied forms
title_fullStr An integrated taxonomic analysis into the identity of Hoplisoma julii (Siluriformes: Callichthyidae), with comparisons with allied forms
title_full_unstemmed An integrated taxonomic analysis into the identity of Hoplisoma julii (Siluriformes: Callichthyidae), with comparisons with allied forms
title_sort An integrated taxonomic analysis into the identity of Hoplisoma julii (Siluriformes: Callichthyidae), with comparisons with allied forms
author Lam, Shu Him
author_facet Lam, Shu Him
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Pinna, Mario Cesar Cardoso de
dc.contributor.author.fl_str_mv Lam, Shu Him
dc.subject.por.fl_str_mv Amazônia Oriental
COI divergence
Corydoradinae
Corydoradinae
Divergência COI
Eastern Amazon
Integrative taxonomy
Revisão taxonômica, Taxonomia integrativa
Taxonomic revision
topic Amazônia Oriental
COI divergence
Corydoradinae
Corydoradinae
Divergência COI
Eastern Amazon
Integrative taxonomy
Revisão taxonômica, Taxonomia integrativa
Taxonomic revision
description Corydoradinae is the most species-rich group of the Neotropical catfish family Callichthyidae. However, the remarkably diverse and complex colour patterns characteristic of the group have been both a boon and bane to its taxonomy. Here, we investigated the taxonomic identity of Hoplisoma julii, a classic example of that issue. The species was described more than a century ago based primarily on colouration and very limited morphological data. To fully explore its species boundary and accurately delimit the species, we employed an integrative approach combining morphological data and COI divergence, based on samples from seven river drainages. Our results indicate that H. julii is a polymorphic species widely distributed in Rio Parnaíba and Eastern Amazonian drainages, but apparently similar morphotypes from Rio Curuá-Una actually represent a new species. A formal taxonomic description of this new spotted Hoplisoma species, commonly known in aquarium trade as CW037, is herein provided. These two species share very close genetic relationships in our Bayesian-inferred phylogeny, corroborating morphological data. Molecular delimitations also reveal the presence of a putative new species from Rio Purus, but its taxonomic identity is not assigned herein due to the paucity of morphological data. The delimitation results raise doubts about the identity of H. julii voucher specimens available in online genetic sequence repositories, highlighting the need for improved data curation.
publishDate 2025
dc.date.none.fl_str_mv 2025-08-26
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/38/38131/tde-15092025-092256/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/38/38131/tde-15092025-092256/
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Reter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Reter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1848370474303619072