Estudos sobre o módulo toxina-antitoxina VapBC 1 de Leptospira interrogans sorovar Copenhageni

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2022
Autor(a) principal: Damiano, Deborah Kohn
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Lon
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-09052024-224145/
Resumo: A leptospirose é uma zoonose de distribuição mundial e a linhagem L. interrogans sorovar Copenhageni é a responsável pelo maior número de casos humanos de leptospirose no Brasil. Seu genoma foi sequenciado, contribuindo para o entendimento dos mecanismos moleculares da doença. Recentemente os sistemas Toxina-Antitoxina (TA) vêm se destacando por terem sido relacionados à fisiologia bacteriana durante a infecção. Os sistemas TA codificam uma antitoxina e uma toxina e em situações normais a toxina é bloqueada pela antitoxina. Havendo um desequilíbrio nas condições ambientais, há diminuição da concentração de antitoxina devido à degradação por proteases como a Lon, resultando em exposição da célula para os efeitos tóxicos, podendo levar à interrupção do crescimento, formação de células persistentes ou até morte celular. Os sistemas TA são divididos em famílias, sendo a VapBC a principal família TA de tipo II, classificada com base na presença de um domínio PIN (PilT N-terminal). Segundo a pesquisa no banco de dados TADB, existem quatro loci vapBC identificados na estirpe L. interrogans sorovar Copenhageni Fiocruz L1-130. Nosso grupo já realizou a caracterização bioquímica e funcional do módulo VapBC-3, e atualmente estuda os módulos VapBC-1, 2 e 4. Os objetivos deste projeto incluem a clonagem, expressão e caracterização bioquímica e funcional do módulo VapBC-1 e, secundariamente estudos da atividade da enzima Lon sobre a antitoxina VapB, para o desenvolvimento de uma metodologia de obtenção das toxinas ativas através da expressão do complexo VapB-VapC. Os genes de interesse vapB-1, vapC-1, lon e o complexo vapBC-1 foram clonados e expressos em E. coli BL21(DE3). A proteína VapB-1 foi purificada por IMAC a partir da fração solúvel, apresentando um rendimento final de 1,625 mg. A proteína VapC-1 foi sintetizada majoritariamente na fração insolúvel, mas se mostrou de difícil obtenção. A obtenção da VapC-1 a partir de uma fração precipitada extraída do gel de poliacrilamida apresentou rendimento final de 480 µg, e poderá ser utilizada para imunizações. A purificação do complexo VapBC-1 demonstrou a afinidade esperada entre a antitoxina VapB-1 e a toxina VapC-1 e a maior susceptibilidade da antitoxina VapB-1 à ação enzimática foi demonstrada através do ensaio de digestão por tripsina. Devido àsdificuldades de obtenção da protease Lon esta parte do trabalho foi interrompida. A atividade das proteínas VapB-1, VapC-1 e do complexo VapBC-1 sobre células de E. coli foi testada, porém não foi possível observar o efeito tóxico da toxina VapC-1 em meio líquido, indicando que este módulo não seja funcional ou não se comporte como grande parte dos sistemas TA descritos na literatura. No entanto, estudos preliminares de viabilidade celular em meio sólido demonstraram tendência da proteína VapC-1 reduzir a viabilidade celular em 2 horas após a indução. O avanço na compreensão dos sistemas TA é importante para a compreensão dos mecanismos envolvidos na infecção por Leptospira.
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Havendo um desequilíbrio nas condições ambientais, há diminuição da concentração de antitoxina devido à degradação por proteases como a Lon, resultando em exposição da célula para os efeitos tóxicos, podendo levar à interrupção do crescimento, formação de células persistentes ou até morte celular. Os sistemas TA são divididos em famílias, sendo a VapBC a principal família TA de tipo II, classificada com base na presença de um domínio PIN (PilT N-terminal). Segundo a pesquisa no banco de dados TADB, existem quatro loci vapBC identificados na estirpe L. interrogans sorovar Copenhageni Fiocruz L1-130. Nosso grupo já realizou a caracterização bioquímica e funcional do módulo VapBC-3, e atualmente estuda os módulos VapBC-1, 2 e 4. Os objetivos deste projeto incluem a clonagem, expressão e caracterização bioquímica e funcional do módulo VapBC-1 e, secundariamente estudos da atividade da enzima Lon sobre a antitoxina VapB, para o desenvolvimento de uma metodologia de obtenção das toxinas ativas através da expressão do complexo VapB-VapC. Os genes de interesse vapB-1, vapC-1, lon e o complexo vapBC-1 foram clonados e expressos em E. coli BL21(DE3). A proteína VapB-1 foi purificada por IMAC a partir da fração solúvel, apresentando um rendimento final de 1,625 mg. A proteína VapC-1 foi sintetizada majoritariamente na fração insolúvel, mas se mostrou de difícil obtenção. A obtenção da VapC-1 a partir de uma fração precipitada extraída do gel de poliacrilamida apresentou rendimento final de 480 µg, e poderá ser utilizada para imunizações. A purificação do complexo VapBC-1 demonstrou a afinidade esperada entre a antitoxina VapB-1 e a toxina VapC-1 e a maior susceptibilidade da antitoxina VapB-1 à ação enzimática foi demonstrada através do ensaio de digestão por tripsina. Devido àsdificuldades de obtenção da protease Lon esta parte do trabalho foi interrompida. A atividade das proteínas VapB-1, VapC-1 e do complexo VapBC-1 sobre células de E. coli foi testada, porém não foi possível observar o efeito tóxico da toxina VapC-1 em meio líquido, indicando que este módulo não seja funcional ou não se comporte como grande parte dos sistemas TA descritos na literatura. No entanto, estudos preliminares de viabilidade celular em meio sólido demonstraram tendência da proteína VapC-1 reduzir a viabilidade celular em 2 horas após a indução. O avanço na compreensão dos sistemas TA é importante para a compreensão dos mecanismos envolvidos na infecção por Leptospira.Leptospirosis is a zoonosis of global distribution and L. interrogans serovar Copenhageni is responsible for the largest number of human cases of leptospirosis in Brazil. Its genome has been sequenced, contributing to the understanding of the molecular mechanisms of the disease. Recently, Toxin-Antitoxin (TA) systems have been highlighted for having been related to bacterial physiology during infection. TA systems encode an antitoxin and a toxin and in normal conditions the toxin is blocked by the antitoxin. When there is an imbalance in environmental conditions, there is a decrease in the concentration of antitoxin due to degradation by proteases such as Lon, resulting in exposure of the cell to the toxic effects of the toxin, which can lead to growth interruption, formation of persistent cells or cell death. TA systems are organized into families, with VapBC being the main type II TA family, this classification is based on the presence of a PIN domain (N-terminal PilT). According to a search in the TADB database, there are four vapBC loci identified in the strain L. interrogans serovar Copenhageni Fiocruz L1-130. Our research group has already worked on the biochemical and functional characterization of the VapBC-3 module, and is currently studying the VapBC-1, 2 and 4 modules. The aims of this project include cloning, expression and biochemical and functional characterization of the VapBC-1 module and, secondarily studies of the activity of the Lon enzyme on VapB antitoxin, for the development of a methodology to obtain the active toxin through the production of the VapB-VapC complex. The genes of interest vapB-1, vapC-1, lon and the vapBC-1 complex were cloned and expressed in E. coli BL21(DE3). The antitoxin VapB-1 was purified by IMAC from the soluble fraction, with a final yield of 1.625 mg. The toxin VapC-1 was mostly synthesized in the insoluble fraction, however, it has proven to be difficult to obtain. VapC-1 was obtained from a precipitated fraction extracted from a polyacrylamide gel, with a final yield of 480 µg, and it can be used for immunizations. Purification of the VapBC-1 complex demonstrated the expected affinity between VapB-1 antitoxin and VapC-1 toxin and the greater susceptibility of the antitoxin VapB- 1 to enzymatic activity was demonstrated through a trypsin digestion assay. Due to difficulties in obtaining the Lon protease, this part of the work was interrupted. The activity of VapB-1, VapC-1 and complex VapBC-1 proteins on E. coli cells was tested, but it was not possible to observe the toxic effect of the VapC-1 toxin in liquid medium, indicating that this module is not functional or does not behave as most of the TA systems described in the literature. However, preliminary studies of cell viability in solid medium exhibited a tendency of the VapC-1 protein to reduce cell viability within 2 hours after induction. Advances in the understanding of TA systems are important for understanding the mechanisms involved in Leptospira infection.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPLopes, Alexandre Paulo YagueDamiano, Deborah Kohn2022-02-22info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-09052024-224145/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-08-25T19:14:02Zoai:teses.usp.br:tde-09052024-224145Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-08-25T19:14:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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