Métodos Clássicos e Quânticos no Estudo de Geometrias de Moléculas Biológicas

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 1997
Autor(a) principal: Ota, André Tsutomu
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Condensed matter
Electronic structure
Estrutura eletrônica
Matéria condensada
Link de acesso: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43133/tde-27022014-162732/
Resumo: Duas são as principais características deste trabalho. A primeira é a introdução de um método para o cálculo da energia livre absoluta no programa de dinâmica molecular clássica Thor. Este método é geral e pode ser usado no vácuo ou em solução,sob quaisquer condições de pressão e/ou temperatura. Trata-se de um caso especial de integração termodinâmica para cálculos de energia livre, e compara um estado termodinâmico com um sistema modelo para o qual a energia livre é conhecidaanaliticamente. O estado modelo é conhecido no início, e após uma integração termodinâmica até o estado real final, a energia livre absoluta é calculada como uma soma desta integração mais a energia livre do estado modelo. A energia livredepende do modelo a partir do qual a função de partição é derivada analiticamente. O modelo definido é o sólido de Einstein. Os átomos deste sólido ideal não interagem entre si (como um gás ideal) e estão ligados harmonicamente às suas posiçõesideais. O acoplamento entre os dois estados é feito.
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